{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[526.2687487202941, 1218.119441809189, 1, 0, 0.301692451013758, 0.001900169832298913, 0, -0.01175403964516922, 1, 0.301692451013758, 0.0005552361014835277],
[526.8265782680855, 1217.481898321089, 0, 1, 0.3020260380195158, 0, 0.0008213674481559053, 0.005080801402470252, 0.6979739619804842, 1, 0.0005552833258770421],
[526.467559244514, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3018022088933759, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018022088933758, 0.0005551969471917034],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552263340617115],
[525.8634910252094, 1218.444985563965, 0, 1, 0.3014739067561516, 0, 0.0008207182202298153, 0.005076785418923781, 0.6985260932438484, 1, 0.0005553370626316561],
[526.3662943804732, 1217.942182208701, 0, 1, 0.3017621604463743, 0, 0.0008210570375241709, 0.005078881269432841, 0.6982378395536257, 1, 0.0005553037707773783],
[526.3293816233493, 1217.979094965825, 1, 0, 0.3017409986177074, 0.001899950933606853, 0, -0.01175268558519993, 1, 0.3017409986177073, 0.0005552879929775738],
[526.259422805905, 1218.056747550267, 1, 0, 0.301699560979503, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.301699560979503, 0.0005552833258770421],
[525.9004037823333, 1218.408072806841, 1, 0, 0.3014950685848185, 0.001901500726768587, 0, -0.01176227227053468, 1, 0.3014950685848186, 0.0005552263340617115],
[526.0999090344822, 1218.067586578264, 1, 0, 0.3016338226448013, 0.001900779648176022, 0, -0.01175781183430408, 1, 0.3016338226448012, 0.00055511660095111],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993921, 0, 0.0008208256793283724, 0.005077450137667971, 0.6984346451006079, 1, 0.0005552833258770421],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005551166009509074],
[526.1177471015478, 1218.217145122489, 0, 1, 0.3016151023790762, 0, 0.0008208717173320132, 0.005077734918802152, 0.6983848976209237, 1, 0.0005552263340617115],
[526.4432908563235, 1217.944899673159, 0, 1, 0.3017925102419603, 0, 0.0008210552055912826, 0.005078869937492175, 0.6982074897580397, 1, 0.000555236101445855],
[526.5629962773583, 1217.641412092511, 0, 1, 0.3018929396982106, 0, 0.0008212598471675699, 0.005080135806026578, 0.6981070603017894, 1, 0.0005551166009509074],
[526.8265782680855, 1217.481898321089, 1, 0, 0.3020260380195158, 0.001898157840265856, 0, -0.01174159389757322, 1, 0.3020260380195158, 0.0005556502380669948],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005553590426516468],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.000555196947191807],
[526.4004037823335, 1217.908072806841, 0, 1, 0.3017817151308341, 0, 0.0008210800324981499, 0.005079023511368901, 0.6982182848691658, 1, 0.0005556200800861219],
[526.2225100487811, 1218.085966540393, 0, 1, 0.3016797298822729, 0, 0.0008209601189645088, 0.005078281752182722, 0.6983202701177271, 1, 0.0005553370626316561],
[526.4432908563236, 1217.865185732851, 0, 1, 0.3018063019940901, 0, 0.0008211089467987787, 0.005079202368979482, 0.6981936980059099, 1, 0.0005553037707394251],
[526.2225100487811, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017041146406144, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982958853593857, 1, 0.0005556127689449792],
[526.4860920395084, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3017507294096337, 0, 0.0008208256793283724, 0.005077450137667971, 0.6982492705903663, 1, 0.0005552199744813766],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552321252917079],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552833258770421],
[526.8634910252094, 1217.444985563965, 0, 1, 0.3020471998481827, 0, 0.0008213923518989761, 0.005080955451639117, 0.6979528001518173, 1, 0.0005551915680762867],
[526.748925683644, 1217.55955090553, 0, 1, 0.301981520329277, 0, 0.000821315063609229, 0.005080477362993379, 0.6980184796707229, 1, 0.0005552263340617115],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005554596873448689],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553206270299647],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552868502236245],
[526.3548598387493, 1217.828023307991, 0, 1, 0.3017773336297936, 0, 0.000821134003209826, 0.005079357362519433, 0.6982226663702064, 1, 0.0005553383815112748],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.259422805905, 1218.056747550267, 1, 0, 0.301699560979503, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.301699560979503, 0.0005554144552007741],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.7625015295071, 1217.22990370495, 0, 1, 0.3020440341072991, 0, 0.0008215374901292224, 0.005081853245343314, 0.6979559658927009, 1, 0.0005552926775231293],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.5629962773583, 1217.604499335388, 0, 1, 0.3018993288212671, 0, 0.0008212847443860761, 0.005080289814835898, 0.698100671178733, 1, 0.000555375099770694],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993921, 0, 0.0008208256793283724, 0.005077450137667971, 0.6984346451006079, 1, 0.000555380167180574],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005553254848780498],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.7625015295071, 1217.264013106811, 0, 0, 0.3020381267766178, 0, 0, 0, 1, 1, 1.778038688656015e-05],
[526.5629962773583, 1217.604499335388, 0, 1, 0.301899328821267, 0, 0.000821284744386076, 0.005080289814835898, 0.698100671178733, 1, 0.0005372485293208104],
[526.467559244514, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3018022088933759, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018022088933758, 0.000555292386809577],
[526.7625015295071, 1217.19685764463, 0, 1, 0.3020497575006328, 0, 0.0008215597943089315, 0.005081991214175414, 0.6979502424993672, 1, 0.0005551428745643876],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.5629962773583, 1217.641412092511, 0, 1, 0.3018929396982106, 0, 0.0008212598471675699, 0.005080135806026578, 0.6981070603017894, 1, 0.0005552819443426082],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 1.51879063894706e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005399594867289066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.5716274638183, 1217.736849125356, 0, 0, 0.3018798764846216, 0, 0, 0, 1, 1, 1.47404660994199e-05],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.0005402917523541213],
[525.6825185680552, 1218.625958021119, 0, 0, 0.3013701564966171, 0, 0, 0, 1, 1, 1.518790616403812e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993921, 0, 0.0008208256793283724, 0.005077450137667971, 0.6984346451006079, 1, 0.0005399594867289066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[527.2896655109616, 1217.018811078213, 0, 0, 0.3022915227368644, 0, 0, 0, 1, 1, 1.518790635733404e-05],
[526.8265782680855, 1217.481898321089, 0, 1, 0.3020260380195158, 0, 0.0008213674481559053, 0.005080801402470252, 0.6979739619804842, 1, 0.0005399594867289066],
[526.6454529780663, 1217.663023611108, 0, 0, 0.3019222001419555, 0, 0, 0, 1, 1, 1.706904991968359e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.5044720016379, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3018413767220613, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6981586232779387, 1, 0.0005379311051909743],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.1343603420785, 1218.174116247096, 0, 0, 0.3016291942643557, 0, 0, 0, 1, 1, 1.518790623541251e-05],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832614, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983051262167386, 1, 0.0005399594867289066],
[525.6825185680552, 1218.625958021119, 0, 0, 0.3013701564966171, 0, 0, 0, 1, 1, 1.51878068713339e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993921, 0, 0.0008208256793283724, 0.005077450137667971, 0.6984346451006079, 1, 0.0005399594867289066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 1.518790090700838e-05],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005399594867289066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[525.6825185680552, 1218.625958021119, 0, 0, 0.3013701564966171, 0, 0, 0, 1, 1, 1.51879121938408e-05],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993921, 0, 0.0008208256793283724, 0.005077450137667971, 0.6984346451006079, 1, 0.0005399594867289066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 1.429219931437244e-05],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005407075402964407],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 1.518790602689808e-05],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005399594867289066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 1.757004696769509e-05],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005375784687471618],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[525.1378032984913, 1216.181002159921, 1, 0.5, 0.3015747614120813, 0.0019042620693441, 0.0004111230146762748, -0.009236235280655307, 0.9617341847497561, 0.4163131793903586, 0.0005565917852194067],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832614, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983051262167386, 1, 0.0005553292492161137],
[526.748925683644, 1217.55955090553, 0, 1, 0.3019815203292771, 0, 0.0008213150636092292, 0.005080477362993381, 0.6980184796707229, 1, 0.0005552245283104478],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3017849445934618, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6982150554065383, 1, 0.0005553331225921431],
[525.6479237161067, 1215.670633189312, 0, 1.5, 0.3018677551167094, 0, 0.00123388684323545, 0.007632557167532536, 0.5833195687888637, 1, 0.0005562685572003699],
[526.5230047966323, 1217.785471792542, 0, 1, 0.3018520014454077, 0, 0.000821162695041871, 0.005079534843987467, 0.6981479985545922, 1, 0.000555365331496183],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000174579634679233],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.000380610396711027],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[525.5415375916268, 1218.766938997547, 0, 2, 0.301289333076723, 0, 0.001641002833277565, 0.01015088863759272, 0.4881965960723705, 1, 0.00111163444907074],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993922, 0, 0.0008208256793283726, 0.005077450137667972, 0.6984346451006078, 1, 0.0005555949571903236],
[526.2225100487811, 1218.085966540393, 0, 1, 0.3016797298822729, 0, 0.0008209601189645088, 0.005078281752182722, 0.6983202701177271, 1, 0.0005551284910536949],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.0815290723527, 1218.190034759698, 0, 1, 0.3016052889818292, 0, 0.0008208899855245177, 0.005077847921890241, 0.6983947110181707, 1, 0.0005555256127754012],
[525.9669637307873, 1218.341512858387, 0, 1, 0.3015332269434731, 0, 0.0008207879231282783, 0.005077216585979478, 0.6984667730565269, 1, 0.0005555256127754012],
[526.2225100487811, 1218.085966540393, 0, 1, 0.3016797298822729, 0, 0.0008209601189645088, 0.005078281752182722, 0.6983202701177271, 1, 0.0005551497694513415],
[526.2225100487811, 1218.085966540393, 0, 1, 0.3016797298822729, 0, 0.0008209601189645088, 0.005078281752182722, 0.6983202701177271, 1, 0.0005554864964312233],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552526613488651],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.000555359042651865],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832614, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983051262167386, 1, 0.0005553432874262058],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552879929374171],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[525.5070615085556, 1215.837908927359, 0, 1.75, 0.3017822834822926, 0, 0.001439336598366053, 0.008903424921481565, 0.5333152625963807, 1, 0.0005557302134923554],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.1553545866007, 1218.153122002574, 0, 0, 0.3016412301197127, 0, 0, 0, 1, 1, 4.514537518804259e-05],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005099961398379464],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 2.301640736106077e-05],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005321283562953527],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005553534736192855],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552979279741175],
[524.5012715915011, 1216.734778076058, 0, 2.75, 0.3012235312332524, 0, 0.002260147445072945, 0.01398078330776082, 0.373190214296293, 1, 0.001161825077342176],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993922, 0, 0.0008208256793283726, 0.005077450137667972, 0.6984346451006078, 1, 0.0005553737473514735],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552922452903899],
[525.3482786598336, 1215.721000630964, 0, 1.75, 0.3017388709964647, 0, 0.001439475010377993, 0.008904281108253953, 0.5333732930515963, 1, 0.0005563942313297117],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005550418593143525],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.8265782680855, 1217.481898321089, 0, 1, 0.3020260380195158, 0, 0.0008213674481559053, 0.005080801402470252, 0.6979739619804842, 1, 0.0005551938589003094],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832615, 0, 0.0008209779228417689, 0.005078391883117123, 0.6983051262167386, 1, 0.0005552833258770421],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005551915681142927],
[526.4767661251194, 1217.911424404364, 0, 1, 0.3018117005053303, 0, 0.0008210777729497561, 0.005079009534291195, 0.6981882994946697, 1, 0.0005552263340617115],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005555472962656454],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 1.232603458281302e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.000542818013319526],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3017849445934618, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6982150554065383, 1, 0.0005554596873448689],
[526.259422805905, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017188927401842, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017188927401842, 0.0005555472962656454],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005554394478576918],
[526.2225100487811, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016842985594201, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983157014405799, 1, 0.0005553689480325449],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552833258770194],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005551915681142927],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552263340617115],
[526.8265782680855, 1217.481898321089, 0, 1, 0.3020260380195158, 0, 0.0008213674481559053, 0.005080801402470252, 0.6979739619804842, 1, 0.0005552833258770194],
[526.3265782680855, 1217.981898321089, 0, 1, 0.3017393914735002, 0, 0.0008210302643893452, 0.005078715656610862, 0.6982606085264998, 1, 0.0005552321253329958],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005555842105881906],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993922, 0, 0.0008208256793283726, 0.005077450137667972, 0.6984346451006078, 1, 0.0005554260715241958],
[526.7039772537867, 1217.604499335388, 0, 1, 0.3019557517049422, 0, 0.0008212847443860761, 0.005080289814835898, 0.6980442482950577, 1, 0.0005553590426516468],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553432873853574],
[526.2225100487811, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016842985594201, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983157014405799, 1, 0.0005552263340617115],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005554596873830507],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832614, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983051262167386, 1, 0.0005554337876196438],
[526.2225100487811, 1218.085966540393, 0, 1, 0.3016797298822729, 0, 0.0008209601189645088, 0.005078281752182722, 0.6983202701177271, 1, 0.000555363793863433],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.804004587536, 0, 2, 0.3017849445934618, 0, 0.001642300396833881, 0.01015891508513642, 0.4875042635963553, 1, 0.001111626486102828],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005554596873448779],
[526.3265782680855, 1217.981898321089, 0, 1, 0.3017393914735002, 0, 0.0008210302643893452, 0.005078715656610862, 0.6982606085264998, 1, 0.000555994038643771],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553166632026115],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.000555229139139137],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005550111555910232],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.0005553590426516468],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005552321252917079],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552879929775738],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552919255474907],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552833259184201],
[526.0051667295667, 1218.276894224745, 1, 0, 0.3015596952489352, 0.001901122010297908, 0, -0.01175992961234962, 1, 0.3015596952489352, 0.0005552321253329958],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552879929374171],
[526.5629962773583, 1217.641412092511, 0, 1, 0.3018929396982106, 0, 0.0008212598471675699, 0.005080135806026578, 0.6981070603017894, 1, 0.0005554596873448689],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553860209415649],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553568211773479],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005553254849160295],
[527.2141601731925, 1217.094316415982, 0, 1, 0.3022482360483099, 0, 0.0008216290114185509, 0.005082419376246384, 0.6977517639516901, 1, 0.0005551873753810754],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.748925683644, 1217.55955090553, 0, 1, 0.3019815203292771, 0, 0.0008213150636092292, 0.005080477362993381, 0.6980184796707229, 1, 0.0005553037408654969],
[526.259422805905, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017188927401842, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017188927401842, 0.0005554407611364741],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832614, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983051262167386, 1, 0.0005552833258770194],
[526.2687487202941, 1218.03972786888, 1, 0, 0.3017062381932361, 0.001900169832298913, 0, -0.01175403964516922, 1, 0.3017062381932361, 0.0005553037707394251],
[526.3634910252094, 1217.981898321089, 0, 1, 0.3017541676321722, 0, 0.0008210302643893452, 0.005078715656610862, 0.6982458323678278, 1, 0.0005554323071392913],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552361014455729],
[526.5044720016379, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3018413767220613, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6981586232779387, 1, 0.0005555842601757307],
[526.259422805905, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017188927401842, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017188927401842, 0.0005552321253329958],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.0005553254848780498],
[526.3634910252094, 1217.981898321089, 0, 1, 0.3017541676321722, 0, 0.0008210302643893452, 0.005078715656610862, 0.6982458323678278, 1, 0.0005553590426138714],
[526.5730169196761, 1217.682628399773, 0, 1, 0.3018898166290514, 0, 0.0008212320490390489, 0.00507996385281527, 0.6981101833709487, 1, 0.0005552369603833523],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.4682539724428, 1217.813806981869, 0, 1, 0.301825183986819, 0, 0.0008211435888367199, 0.005079416657134377, 0.6981748160131811, 1, 0.0005552563168292258],
[526.5629962773583, 1217.641412092512, 0, 1, 0.3018929396982106, 0, 0.0008212598471675698, 0.005080135806026578, 0.6981070603017894, 1, 0.0005554176111988369],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552833258770421],
[526.3634910252094, 1217.947788919229, 1, 0, 0.3017600683302213, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017600683302213, 0.0005551915680762867],
[526.3634910252094, 1217.908072806841, 0, 1, 0.3017669392424327, 0, 0.0008210800324981499, 0.005079023511368901, 0.6982330607575673, 1, 0.0005552263340617115],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.000555236101445855],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005554323071401539],
[526.259422805905, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017188927401842, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017188927401842, 0.0005552321253329958],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.0005553254848780498],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.7495211973707, 1217.558955391804, 1, 0, 0.3019818617331827, 0.001898435517752098, 0, -0.0117433115504516, 1, 0.3019818617331826, 0.0005552606579250015],
[526.5044720016379, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3018413767220613, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6981586232779387, 1, 0.0005552788991380316],
[526.4004037823335, 1217.908072806841, 0, 1, 0.3017817151308341, 0, 0.0008210800324981499, 0.005079023511368901, 0.6982182848691658, 1, 0.0005553032210512146],
[526.467559244514, 1217.833223577663, 1, 0, 0.3018215461628815, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018215461628815, 0.0005553590426516468],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553432873849864],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552263340617115],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005553590426138714],
[526.4767661251194, 1218.081232965593, 0, 1, 0.3017823233160068, 0, 0.0008209633092904293, 0.005078301486848914, 0.6982176766839931, 1, 0.0005552879929374171],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552321253329958],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.908072806841, 0, 1, 0.3017669392424327, 0, 0.0008210800324981499, 0.005079023511368901, 0.6982330607575673, 1, 0.0005553131674274513],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005550854286863407],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001269322550430629],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0004281127550575181],
[526.1553545866007, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3016772272065371, 0.001900579346542426, 0, -0.01175657281171659, 1, 0.3016772272065371, 0.0005553593285580299],
[526.0512863672961, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3016355567003358, 0.001900955336323969, 0, -0.01175889860319234, 1, 0.3016355567003358, 0.0005555472962656454],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.1553545866007, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3016772272065371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001426393570631964],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.259422805905, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017188927401842, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017188927401842, 0.0004125006993273388],
[525.3634910252094, 1218.908072806841, 0, 1, 0.3011936340182146, 0, 0.0008204064131737596, 0.005074856647907515, 0.6988063659817854, 1, 0.0005551194951821866],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[525.3634910252094, 1218.944985563965, 1, 0, 0.301187260210136, 0.001903444028911433, 0, -0.01177429311732495, 1, 0.301187260210136, 0.0005556585856730084],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[525.8634910252094, 1218.444985563965, 0, 1, 0.3014739067561516, 0, 0.0008207182202298153, 0.005076785418923781, 0.6985260932438484, 1, 0.0005551394081468119],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.7625015295071, 1217.337838621058, 1, 0, 0.3020253418929054, 0.001898388737042597, 0, -0.01174302217509959, 1, 0.3020253418929053, 0.0005553975621406546],
[526.5629962773583, 1217.641412092511, 0, 1, 0.3018929396982106, 0, 0.0008212598471675699, 0.005080135806026578, 0.6981070603017894, 1, 0.0005553023052221657],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005550793089058266],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005551669457454335],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.0815290723527, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3016080415070145, 0.001900846056624179, 0, -0.01175822262260265, 1, 0.3016080415070146, 0.000555145895473111],
[526.2225100487811, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016842985594201, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983157014405799, 1, 0.0005552049972632414],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.5926217083405, 1217.715854880834, 1, 0, 0.3018919123399785, 0.001899001161003471, 0, -0.01174681049727659, 1, 0.3018919123399786, 0.0005551577388732825],
[526.478056366775, 1217.830420222399, 0, 1, 0.3018262328210728, 0, 0.0008211323870669783, 0.00507934736540929, 0.6981737671789272, 1, 0.000555279253928462],
[526.3976004270696, 1217.910876162105, 1, 0, 0.3017801079866269, 0.001899704708358651, 0, -0.0117511624890641, 1, 0.3017801079866269, 0.0005552823582450262],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552571821345595],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.2517290389077, 1218.056747550266, 1, 0, 0.3016964809274687, 0.001900231286320517, 0, -0.0117544197864566, 1, 0.3016964809274687, 0.0005552376209974916],
[526.3265782680855, 1217.981898321089, 0, 1, 0.3017393914735002, 0, 0.0008210302643893452, 0.005078715656610862, 0.6982606085264998, 1, 0.0005553116179175752],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005549069198114955],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553734527253916],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.0005550396253386545],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.6756956831227, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3019035139877656, 0.001898701626440069, 0, -0.01174495764124579, 1, 0.3019035139877656, 0.0005549965502014293],
[526.467559244514, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3018022088933759, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018022088933758, 0.0005552103335905571],
[525.6479184222402, 1216.093075744051, 0, 1.5, 0.3017945378691904, 0, 0.001233458219538207, 0.007629905794037069, 0.583411335441955, 1, 0.0005550766819883412],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005550272472254669],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005550632997791584],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 0, 1, 0.3017209195324898, 0, 0.0008209007125194564, 0.005077914276761074, 0.6982790804675103, 1, 0.0005553048029040938],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005552814325140342],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 0, 1, 0.3017209195324898, 0, 0.0008209007125194564, 0.005077914276761074, 0.6982790804675103, 1, 0.0005554440366393998],
[526.259422805905, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3016792620781615, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3016792620781614, 0.0005553995970892081],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005552485733583433],
[527.2896655109616, 1217.247941761344, 0, 0, 0.3022518192287137, 0, 0, 0, 1, 1, 2.859142972788199e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.8265782680855, 1217.71102900422, 0, 1, 0.3019863693806017, 0, 0.0008212128954910982, 0.00507984537310986, 0.6980136306193983, 1, 0.0005265380070022337],
[526.259422805905, 1218.2781844664, 1, 0, 0.3016612657773224, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3016612657773224, 0.0005552650411530883],
[526.2517290389077, 1218.285878233397, 1, 0, 0.3016568555731713, 0.001900231286320517, 0, -0.0117544197864566, 1, 0.3016568555731713, 0.0005552977436125644],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.000555426928926429],
[526.2225100487811, 1218.288681588661, 0, 1, 0.3016446742051883, 0, 0.0008208235167185411, 0.005077436760231249, 0.6983553257948117, 1, 0.0005552484048013581],
[526.5629962773583, 1217.870542775643, 0, 1, 0.3018532861751861, 0, 0.000821105334989797, 0.005079180027110224, 0.6981467138248139, 1, 0.0005552715628744914],
[526.248925683644, 1218.288681588661, 0, 1, 0.3016552486400493, 0, 0.0008208235167185413, 0.00507743676023125, 0.6983447513599507, 1, 0.0005553838146338278],
[526.0230047966323, 1218.514602475673, 0, 1, 0.3015257467674214, 0, 0.0008206713304611092, 0.005076495368955112, 0.6984742532325786, 1, 0.0005552883532478237],
[526.0999090344822, 1218.296717261395, 1, 0, 0.301594202318325, 0.001900779648176022, 0, -0.01175781183430408, 1, 0.3015942023183249, 0.0005553930923244919],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005553024156661831],
[526.259422805905, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3016792620781615, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3016792620781614, 0.0005552030160598061],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005553219589401747],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005551179069551475],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005552747581689673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.9403952630594, 1217.493143789942, 1, 0, 0.3020696308952642, 0.001897747845846549, 0, -0.01173905776076223, 1, 0.3020696308952642, 0.0005552923567640578],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.7039772537867, 1217.833630018519, 0, 1, 0.3019160922975582, 0, 0.0008211302228406961, 0.005079333977973551, 0.6980839077024418, 1, 0.0005552823785098003],
[526.4682539724428, 1218.042937665, 0, 1, 0.3017855411281634, 0, 0.0008209891203975205, 0.005078461148775379, 0.6982144588718366, 1, 0.0005551880921052584],
[526.5629962773583, 1217.833630018519, 0, 1, 0.3018596736199173, 0, 0.0008211302228406961, 0.005079333977973551, 0.6981403263800827, 1, 0.000555279252341526],
[526.3634910252094, 1218.557489549663, 0, 1, 0.301654628997467, 0, 0.0008206424469719239, 0.005076316701937457, 0.698345371002533, 1, 0.0005555276033679119],
[526.2225100487811, 1218.315097223524, 0, 1, 0.3016401067280878, 0, 0.0008208057195375377, 0.005077326670718443, 0.6983598932719122, 1, 0.0005550143708474256],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005552601107507376],
[526.3265782680855, 1218.21102900422, 0, 1, 0.3016997604832551, 0, 0.0008208758385789792, 0.005077760411944609, 0.6983002395167448, 1, 0.0005552722232797245],
[526.259422805905, 1218.2781844664, 1, 0, 0.3016612657773224, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3016612657773224, 0.0005554503605738653],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 0, 1, 0.3017209195324898, 0, 0.0008209007125194564, 0.005077914276761074, 0.6982790804675103, 1, 0.000555279867736239],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 0, 1, 0.3017209195324898, 0, 0.0008209007125194564, 0.005077914276761074, 0.6982790804675103, 1, 0.0005551655118652632],
[526.2225100487811, 1218.315097223524, 0, 1, 0.3016401067280878, 0, 0.0008208057195375377, 0.005077326670718443, 0.6983598932719122, 1, 0.0005553838146338278],
[526.4432908563236, 1218.17403035629, 0, 1, 0.3017528740861141, 0, 0.0008209007703993829, 0.005077914634793783, 0.6982471259138858, 1, 0.0005552897056530034],
[526.268748720294, 1218.268858552011, 1, 0, 0.301666611557402, 0.001900169832298914, 0, -0.01175403964516922, 1, 0.301666611557402, 0.0005551866824889119],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005552694159091529],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005552904365356467],
[526.259422805905, 1218.2781844664, 1, 1, 0.3016612657773224, 0.00190020350546544, 0.0008208305892286785, -0.006676767430845641, 0.9090004807296236, 0.5123230122842686, 0.001110923713108089],
[526.2502159252995, 1217.82430410413, 0, 2, 0.3017360840272006, 0, 0.00164227302186358, 0.01015874574949035, 0.4875724963496686, 1, 0.001111190633625447],
[526.259422805905, 1218.2781844664, 1, 0, 0.3016612657773224, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3016612657773224, 0.000555241631515076],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 0, 2, 0.3017209195324898, 0, 0.001641801425038913, 0.01015582855352215, 0.4875936742185517, 1, 0.001110739464870277],
[525.5599175537562, 1218.977689718549, 0, 2, 0.3012602969193094, 0, 0.001640719118051933, 0.01014913363656422, 0.4882371726612916, 1, 0.001111112049416655],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 0, 1, 0.3017209195324898, 0, 0.0008209007125194564, 0.005077914276761074, 0.6982790804675103, 1, 0.0005549763614122695],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3017407351158504, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6982592648841496, 1, 0.0005554383257923608],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005555121535934414],
[526.0815290723527, 1218.226947516821, 1, 0, 0.3015989064623788, 0.001900846056624179, 0, -0.01175822262260265, 1, 0.3015989064623787, 0.0005553963772633145],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.2225100487811, 1218.085966540393, 0, 1, 0.3016797298822729, 0, 0.0008209601189645088, 0.005078281752182722, 0.6983202701177271, 1, 0.000555439447894309],
[526.0258081518961, 1218.282668437278, 1, 0, 0.3015669620435993, 0.001901047409657205, 0, -0.01175946814891964, 1, 0.3015669620435993, 0.0005557013314807532],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005553590426138714],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005551166009509074],
[526.3634910252094, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3017849445934618, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6982150554065383, 1, 0.0005552263340617115],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005553258050109434],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005556663208343013],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832614, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983051262167386, 1, 0.0005552833258770194],
[526.259422805905, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017188927401842, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017188927401842, 0.0005552321252917079],
[526.3634910252094, 1217.908072806841, 0, 1, 0.3017669392424327, 0, 0.0008210800324981499, 0.005079023511368901, 0.6982330607575673, 1, 0.0005552879929784758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.871160049717, 1, 0, 0.3017733254529861, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017733254529862, 0.0005551700731895549],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.908072806841, 0, 1, 0.3017669392424327, 0, 0.0008210800324981499, 0.005079023511368901, 0.6982330607575673, 1, 0.0005550825292610723],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005554365883009995],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.0005553254848780498],
[526.5571141984925, 1217.751362390682, 0, 1, 0.3018715561298674, 0, 0.0008211856959345184, 0.00507967712253513, 0.6981284438701325, 1, 0.0005553367785561364],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001527780172154942],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0004023178510666491],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.4767661251194, 1218.081232965593, 0, 1, 0.3017823233160068, 0, 0.0008209633092904293, 0.005078301486848914, 0.6982176766839931, 1, 0.0005552567176859989],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005553254848780498],
[526.2988723915672, 1218.03648686819, 0, 1, 0.3017188579006461, 0, 0.0008209934684068417, 0.005078488044620725, 0.6982811420993539, 1, 0.0005629650880856031],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.2225100487811, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016842985594201, 0, 0.0008209779228417689, 0.005078391883117123, 0.6983157014405799, 1, 0.0005552819443061564],
[526.259422805905, 1218.056747550267, 1, 0, 0.301699560979503, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.301699560979503, 0.0005554260715241958],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.4767661251194, 1218.081232965593, 0, 1, 0.3017823233160068, 0, 0.0008209633092904293, 0.005078301486848914, 0.6982176766839931, 1, 0.0005555318520262064],
[526.4582333301249, 1217.850243259049, 1, 0, 0.3018148684110983, 0.001899485916811434, 0, -0.01174980909186964, 1, 0.3018148684110984, 0.0005553846523577981],
[526.5044720016379, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3018413767220613, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6981586232779387, 1, 0.000555236101445855],
[526.3634910252094, 1218.085966540393, 0, 1, 0.301736165953329, 0, 0.0008209601189645088, 0.005078281752182722, 0.6982638340466709, 1, 0.0005553590426516468],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552321253329958],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005555842601757307],
[526.5230047966323, 1217.785471792542, 0, 1, 0.3018520014454077, 0, 0.0008211626950418709, 0.005079534843987466, 0.6981479985545923, 1, 0.0005554668742309675],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005552833258770194],
[526.3634910252094, 1217.981898321089, 1, 0, 0.3017541676321722, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017541676321722, 0.000555620114159773],
[526.3634910252094, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3017849445934618, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6982150554065383, 1, 0.00055511660095111],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552321252917079],
[526.4860920395084, 1218.071907051204, 0, 1, 0.3017876690336005, 0, 0.0008209695948253758, 0.005078340367808762, 0.6982123309663995, 1, 0.0005552573854467867],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.000555236101445855],
[526.3976004270696, 1217.910876162105, 0, 1, 0.3017801079866269, 0, 0.0008210781425576984, 0.005079011820605993, 0.6982198920133731, 1, 0.0005552263340617115],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.0005552515642352781],
[526.3634910252094, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3017407351158505, 0, 0.0008209779228417689, 0.005078391883117123, 0.6982592648841495, 1, 0.0005552025393073786],
[526.3606876699457, 1217.947788919229, 0, 1, 0.3017589461579599, 0, 0.0008210532578636814, 0.005078857889270457, 0.69824105384204, 1, 0.0005556263808102589],
[526.030292122774, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3015875258648159, 0.001901031204808644, 0, -0.01175936790923095, 1, 0.301587525864816, 0.000555419689643526],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.1343603420785, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3016291942643557, 0.001900655185017429, 0, -0.01175704193212187, 1, 0.3016291942643557, 0.000555475627823232],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832614, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983051262167386, 1, 0.0005553725583598469],
[526.259422805905, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017188927401842, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017188927401842, 0.0005553668267903595],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553370626318113],
[526.7039772537867, 1217.604499335388, 0, 1, 0.3019557517049422, 0, 0.0008212847443860761, 0.005080289814835898, 0.6980442482950577, 1, 0.0005553037707775242],
[526.4682539724428, 1217.813806981869, 0, 1, 0.301825183986819, 0, 0.0008211435888367197, 0.005079416657134376, 0.6981748160131811, 1, 0.0005552263340617115],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005554596873830507],
[526.4767661251194, 1217.911424404364, 0, 1, 0.3018117005053303, 0, 0.0008210777729497561, 0.005079009534291195, 0.6981882994946697, 1, 0.0005553424131623563],
[526.4582333301249, 1217.850243259049, 1, 0, 0.3018148684110983, 0.001899485916811434, 0, -0.01174980909186964, 1, 0.3018148684110984, 0.0005556039616466157],
[526.2517290389077, 1218.056747550266, 1, 0, 0.3016964809274687, 0.001900231286320517, 0, -0.0117544197864566, 1, 0.3016964809274687, 0.0005552833259184201],
[526.2687487202941, 1218.154293210446, 1, 0, 0.3016864235740753, 0.001900169832298913, 0, -0.01175403964516922, 1, 0.3016864235740753, 0.0005553037707394251],
[526.3899066600723, 1217.918569929102, 0, 1, 0.3017756972031556, 0, 0.0008210729556888293, 0.0050789797357569, 0.6982243027968444, 1, 0.0005559101765465754],
[525.8234995444835, 1218.511392679553, 1, 2, 0.3014464148418516, 0.001901778830475039, 0.001641346984538177, -0.001610975077055601, 0.7821750128123284, 0.6591218394002104, 0.001669582607135305],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553189176992722],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552833259184201],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552515642352781],
[526.748925683644, 1217.55955090553, 0, 1, 0.3019815203292771, 0, 0.0008213150636092292, 0.005080477362993381, 0.6980184796707229, 1, 0.0005552879929374171],
[526.3634910252094, 1217.947788919229, 1, 0, 0.3017600683302213, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017600683302213, 0.0005552361014835277],
[526.3265782680855, 1217.981898321089, 0, 1, 0.3017393914735002, 0, 0.0008210302643893452, 0.005078715656610862, 0.6982606085264998, 1, 0.0005553432873853574],
[526.3634910252094, 1217.908072806841, 0, 1, 0.3017669392424327, 0, 0.0008210800324981499, 0.005079023511368901, 0.6982330607575673, 1, 0.0005552879929374171]
],
"NAMES": [
["epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3"],
["epi_isl_421502_Ile_de_France_20200312_null_1"],
["epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4"],
["epi_isl_425505_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1"],
["epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3"],
["epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1"],
["epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_21"],
["epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_421665_India_20200310_null_1"],
["epi_isl_427639_New_York_20200406_null_1"],
["epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3"],
["epi_isl_421618_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1"],
["epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2"],
["epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2"],
["epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1"],
["epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1"],
["epi_isl_423399_England_20200329_null_3"],
["epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1"],
["epi_isl_420761_England_20200325_null_3"],
["epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_422091_Wales_20200328_null_3"],
["epi_isl_424484_Reykjavik_20200320_null_1"],
["epi_isl_423907_England_20200318_null_3"],
["epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_423089_England_20200323_null_3"],
["epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_14"],
["Node25"],
["epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1"],
["epi_isl_427687_New_South_Wales_20200318_null_10"],
["Node19"],
["epi_isl_423339_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_425231_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_423312_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3"],
["Node231"],
["epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1"],
["epi_isl_421955_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_423675_England_20200320_null_2"],
["Node634"],
["epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_3"],
["epi_isl_423409_England_20200330_null_1"],
["Node631"],
["epi_isl_423687_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_424088_England_20200313_null_6"],
["Node628"],
["epi_isl_406036_California_20200122_null_1"],
["epi_isl_424146_England_20200321_null_1"],
["Node625"],
["epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1"],
["epi_isl_421575_KZN_20200401_null_2"],
["Node622"],
["epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_3"],
["epi_isl_423145_England_20200324_null_1"],
["Node619"],
["epi_isl_423856_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_7"],
["Node616"],
["epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1"],
["epi_isl_417261_England_20200306_null_1"],
["Node613"],
["epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1"],
["Node610"],
["epi_isl_420700_England_20200327_null_3"],
["epi_isl_425693_Scotland_20200316_null_4"],
["Node607"],
["epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_424435_Reykjavik_20200319_null_1"],
["Node597"],
["epi_isl_423112_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_426618_New_York_20200401_null_2"],
["Node594"],
["epi_isl_423404_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2"],
["Node591"],
["epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1"],
["epi_isl_421915_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_421892_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_421860_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1"],
["epi_isl_423569_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_2"],
["Node292"],
["epi_isl_423736_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423656_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_9"],
["Node288"],
["epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1"],
["epi_isl_421866_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_66"],
["Node275"],
["epi_isl_423155_England_20200323_null_1"],
["Node274"],
["epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_1"],
["Node284"],
["epi_isl_416671_Washington_20200312_null_1"],
["epi_isl_421827_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1"],
["epi_isl_420569_Abruzzo_20200323_null_1"],
["epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1"],
["epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17"],
["epi_isl_423385_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_415517_Noord_Brabant_20200101_null_2"],
["epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4"],
["Node307"],
["epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3"],
["Node314"],
["epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3"],
["epi_isl_423649_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_420528_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1"],
["epi_isl_417242_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_423570_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_418732_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_423377_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1"],
["epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1"],
["epi_isl_423362_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_426801_Victoria_20200325_null_9"],
["Node347"],
["epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1"],
["epi_isl_422349_Wales_20200324_null_2"],
["Node344"],
["epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3"],
["epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1"],
["epi_isl_413695_China_20200101_null_1"],
["epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1"],
["Node338"],
["epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1"],
["epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1"],
["epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_423426_England_20200330_null_1"],
["Node364"],
["epi_isl_423453_England_20200329_null_7"],
["epi_isl_424842_South_Carolina_20200307_null_1"],
["Node360"],
["epi_isl_421906_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2"],
["epi_isl_420634_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_421864_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_422987_Washington_20200318_null_1"],
["epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1"],
["epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2"],
["Node372"],
["epi_isl_421880_England_20200326_null_2"],
["Node371"],
["epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1"],
["epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1"],
["epi_isl_423247_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1"],
["epi_isl_423814_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423967_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2"],
["epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2"],
["epi_isl_423282_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_423531_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5"],
["epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_423549_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423593_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_423346_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2"],
["epi_isl_425880_Scotland_20200321_null_5"],
["Node196"],
["epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2"],
["epi_isl_426051_Prague_20200320_null_2"],
["epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1"],
["epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1"],
["epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1"],
["epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2"],
["epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_423958_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1"],
["epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1"],
["epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1"],
["epi_isl_424571_Reykjavik_20200327_null_3"],
["epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1"],
["epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1"],
["epi_isl_424026_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_424131_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_424142_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_424154_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_421931_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1"],
["epi_isl_428462_Guangdong_20200217_null_6"],
["epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1"],
["epi_isl_419704_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2"],
["Node107"],
["epi_isl_425741_Scotland_20200318_null_17"],
["epi_isl_425259_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3"],
["epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1"],
["epi_isl_426289_Latvia_20200330_null_2"],
["epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1"],
["epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_31"],
["epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2"],
["epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_2"],
["epi_isl_423758_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1"],
["epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1"],
["Node135"],
["epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1"],
["epi_isl_425900_Scotland_20200322_null_1"],
["epi_isl_417948_Kinshasa_20200319_null_2"],
["epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7"],
["epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2"],
["epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2"],
["epi_isl_420223_South_Yorkshire_20200326_null_1"],
["epi_isl_424148_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2"],
["epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3"],
["epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_2"],
["Node156"],
["epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_1"],
["epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1"],
["epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1"],
["epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1"],
["epi_isl_424466_Reykjavik_20200320_null_9"],
["epi_isl_423598_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_417238_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1"],
["Node176"],
["epi_isl_420300_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1"],
["epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4"],
["epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2"],
["epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1"],
["epi_isl_425368_England_20200316_null_6"],
["epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2"],
["epi_isl_422134_Wales_20200325_null_2"],
["epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1"],
["Node585"],
["epi_isl_415149_England_20200301_null_1"],
["Node584"],
["epi_isl_423779_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1"],
["epi_isl_425498_England_20200319_null_35"],
["Node578"],
["epi_isl_423954_England_20200320_null_2"],
["Node577"],
["epi_isl_423870_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_423888_England_20200318_null_2"],
["Node568"],
["epi_isl_422196_Wales_20200327_null_1"],
["Node567"],
["epi_isl_425223_Comunitat_Valenciana_20200317_null_9"],
["epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2"],
["Node564"],
["epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2"],
["epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_16"],
["Node561"],
["epi_isl_422745_Netherlands_20200325_null_3"],
["epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1"],
["Node558"],
["epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1"],
["epi_isl_423121_England_20200324_null_1"],
["Node555"],
["epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2"],
["epi_isl_424155_England_20200320_null_5"],
["epi_isl_423061_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_423091_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_425289_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2"],
["epi_isl_428376_Connecticut_20200327_null_404"],
["epi_isl_422003_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423062_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423743_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425255_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1"],
["epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7"],
["epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2"],
["Node448"],
["epi_isl_421939_England_20200401_null_2"],
["Node435"],
["epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1"],
["epi_isl_422968_USA_20200301_null_1"],
["Node549"],
["epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1"],
["Node548"],
["epi_isl_418935_Washington_20200316_null_2"],
["epi_isl_424295_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2"],
["epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1"],
["Node543"],
["epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1"],
["epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1"],
["epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_417368_USA_20200313_null_2"],
["epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1"],
["epi_isl_416682_USA_20200309_null_1"],
["epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2"],
["epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1"],
["Node530"],
["epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2"],
["epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1"],
["epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_708"],
["epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1"],
["epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9"],
["Node523"],
["epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_413931_California_20200305_null_2"],
["epi_isl_426426_Minnesota_20200305_null_5"],
["Node517"],
["epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2"],
["epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1"],
["epi_isl_417324_California_20200304_null_1"],
["epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1"],
["epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1"],
["epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1"],
["epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1"],
["epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1"],
["epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3"],
["Node506"],
["epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1"],
["Node466"],
["epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18"],
["Node464"],
["epi_isl_423304_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1"],
["epi_isl_427476_New_York_20200401_null_1"],
["Node49"],
["epi_isl_426322_New_York_20200312_null_10"],
["epi_isl_425435_England_20200401_null_4"],
["epi_isl_426677_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_427513_New_York_20200403_null_4"],
["epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1"],
["epi_isl_425332_England_20200329_null_1"],
["Node573"],
["epi_isl_423709_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_427683_New_South_Wales_20200323_null_3"],
["epi_isl_418768_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1"],
["epi_isl_423875_England_20200318_null_2"],
["epi_isl_418731_England_20200313_null_2"],
["epi_isl_428358_Hauts_De_France_20200324_null_6"],
["Node602"],
["epi_isl_427185_Washington_20200326_null_6"],
["epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1"],
["epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1"],
["epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2"],
["Node640"],
["epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5"],
["Node643"],
["epi_isl_423147_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1"],
["epi_isl_426427_Minnesota_20200307_null_60"],
["Node655"],
["epi_isl_424355_Beijing_20200124_null_3"],
["epi_isl_423659_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3"],
["epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5"],
["epi_isl_427102_Victoria_20200404_null_1"],
["epi_isl_418440_Lucerne_20200320_null_1"],
["epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_424254_Washington_20200321_null_3"],
["epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2"],
["epi_isl_413749_China_20200201_null_1"],
["epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1"],
["epi_isl_417231_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_424144_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1"],
["epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4"],
["epi_isl_422297_Wales_20200329_null_4"],
["epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4"],
["epi_isl_420756_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3"],
["epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_17"],
["Node682"],
["epi_isl_427519_New_York_20200318_null_5"],
["Node681"],
["epi_isl_428348_Grand_est_20200320_null_3"],
["epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1"],
["epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1"],
["epi_isl_426081_Washington_20200323_null_12"],
["epi_isl_428478_Guangdong_20200129_null_18"],
["epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2"],
["epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2"],
["epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1"],
["epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_7"],
["Node86"],
["epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_8248"],
["epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1"],
["epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1"],
["epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_418697_England_20200316_null_1"],
["epi_isl_423663_England_20200323_null_3"]
],
"RESOLVED": [
[526.2687487202941, 1218.119441809189, 1, 0, 0.301692451013758, 0.001900169832298913, 0, -0.01175403964516922, 1, 0.301692451013758, 0.0005552361014835277],
[526.8265782680855, 1217.481898321089, 0, 1, 0.3020260380195158, 0, 0.0008213674481559053, 0.005080801402470252, 0.6979739619804842, 1, 0.0005552833258770421],
[526.467559244514, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3018022088933759, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018022088933758, 0.0005551969471917034],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552263340617115],
[525.8634910252094, 1218.444985563965, 0, 1, 0.3014739067561516, 0, 0.0008207182202298153, 0.005076785418923781, 0.6985260932438484, 1, 0.0005553370626316561],
[526.3662943804732, 1217.942182208701, 0, 1, 0.3017621604463743, 0, 0.0008210570375241709, 0.005078881269432841, 0.6982378395536257, 1, 0.0005553037707773783],
[526.3293816233493, 1217.979094965825, 1, 0, 0.3017409986177074, 0.001899950933606853, 0, -0.01175268558519993, 1, 0.3017409986177073, 0.0005552879929775738],
[526.259422805905, 1218.056747550267, 1, 0, 0.301699560979503, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.301699560979503, 0.0005552833258770421],
[525.9004037823333, 1218.408072806841, 1, 0, 0.3014950685848185, 0.001901500726768587, 0, -0.01176227227053468, 1, 0.3014950685848186, 0.0005552263340617115],
[526.0999090344822, 1218.067586578264, 1, 0, 0.3016338226448013, 0.001900779648176022, 0, -0.01175781183430408, 1, 0.3016338226448012, 0.00055511660095111],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993921, 0, 0.0008208256793283724, 0.005077450137667971, 0.6984346451006079, 1, 0.0005552833258770421],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005551166009509074],
[526.1177471015478, 1218.217145122489, 0, 1, 0.3016151023790762, 0, 0.0008208717173320132, 0.005077734918802152, 0.6983848976209237, 1, 0.0005552263340617115],
[526.4432908563235, 1217.944899673159, 0, 1, 0.3017925102419603, 0, 0.0008210552055912826, 0.005078869937492175, 0.6982074897580397, 1, 0.000555236101445855],
[526.5629962773583, 1217.641412092511, 0, 1, 0.3018929396982106, 0, 0.0008212598471675699, 0.005080135806026578, 0.6981070603017894, 1, 0.0005551166009509074],
[526.8265782680855, 1217.481898321089, 1, 0, 0.3020260380195158, 0.001898157840265856, 0, -0.01174159389757322, 1, 0.3020260380195158, 0.0005556502380669948],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005553590426516468],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.000555196947191807],
[526.4004037823335, 1217.908072806841, 0, 1, 0.3017817151308341, 0, 0.0008210800324981499, 0.005079023511368901, 0.6982182848691658, 1, 0.0005556200800861219],
[526.2225100487811, 1218.085966540393, 0, 1, 0.3016797298822729, 0, 0.0008209601189645088, 0.005078281752182722, 0.6983202701177271, 1, 0.0005553370626316561],
[526.4432908563236, 1217.865185732851, 0, 1, 0.3018063019940901, 0, 0.0008211089467987787, 0.005079202368979482, 0.6981936980059099, 1, 0.0005553037707394251],
[526.2225100487811, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017041146406144, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982958853593857, 1, 0.0005556127689449792],
[526.4860920395084, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3017507294096337, 0, 0.0008208256793283724, 0.005077450137667971, 0.6982492705903663, 1, 0.0005552199744813766],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552321252917079],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552833258770421],
[526.8634910252094, 1217.444985563965, 0, 1, 0.3020471998481827, 0, 0.0008213923518989761, 0.005080955451639117, 0.6979528001518173, 1, 0.0005551915680762867],
[526.748925683644, 1217.55955090553, 0, 1, 0.301981520329277, 0, 0.000821315063609229, 0.005080477362993379, 0.6980184796707229, 1, 0.0005552263340617115],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005554596873448689],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553206270299647],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552868502236245],
[526.3548598387493, 1217.828023307991, 0, 1, 0.3017773336297936, 0, 0.000821134003209826, 0.005079357362519433, 0.6982226663702064, 1, 0.0005553383815112748],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.259422805905, 1218.056747550267, 1, 0, 0.301699560979503, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.301699560979503, 0.0005554144552007741],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.7625015295071, 1217.22990370495, 0, 1, 0.3020440341072991, 0, 0.0008215374901292224, 0.005081853245343314, 0.6979559658927009, 1, 0.0005552926775231293],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.5629962773583, 1217.604499335388, 0, 1, 0.3018993288212671, 0, 0.0008212847443860761, 0.005080289814835898, 0.698100671178733, 1, 0.000555375099770694],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993921, 0, 0.0008208256793283724, 0.005077450137667971, 0.6984346451006079, 1, 0.000555380167180574],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005553254848780498],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.7625015295071, 1217.264013106811, 0, 0, 0.3020381267766178, 0, 0, 0, 1, 1, 1.778038688656015e-05],
[526.5629962773583, 1217.604499335388, 0, 1, 0.301899328821267, 0, 0.000821284744386076, 0.005080289814835898, 0.698100671178733, 1, 0.0005372485293208104],
[526.467559244514, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3018022088933759, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018022088933758, 0.000555292386809577],
[526.7625015295071, 1217.19685764463, 0, 1, 0.3020497575006328, 0, 0.0008215597943089315, 0.005081991214175414, 0.6979502424993672, 1, 0.0005551428745643876],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.5629962773583, 1217.641412092511, 0, 1, 0.3018929396982106, 0, 0.0008212598471675699, 0.005080135806026578, 0.6981070603017894, 1, 0.0005552819443426082],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 1.51879063894706e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005399594867289066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.5716274638183, 1217.736849125356, 0, 0, 0.3018798764846216, 0, 0, 0, 1, 1, 1.47404660994199e-05],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.0005402917523541213],
[525.6825185680552, 1218.625958021119, 0, 0, 0.3013701564966171, 0, 0, 0, 1, 1, 1.518790616403812e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993921, 0, 0.0008208256793283724, 0.005077450137667971, 0.6984346451006079, 1, 0.0005399594867289066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[527.2896655109616, 1217.018811078213, 0, 0, 0.3022915227368644, 0, 0, 0, 1, 1, 1.518790635733404e-05],
[526.8265782680855, 1217.481898321089, 0, 1, 0.3020260380195158, 0, 0.0008213674481559053, 0.005080801402470252, 0.6979739619804842, 1, 0.0005399594867289066],
[526.6454529780663, 1217.663023611108, 0, 0, 0.3019222001419555, 0, 0, 0, 1, 1, 1.706904991968359e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.5044720016379, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3018413767220613, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6981586232779387, 1, 0.0005379311051909743],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.1343603420785, 1218.174116247096, 0, 0, 0.3016291942643557, 0, 0, 0, 1, 1, 1.518790623541251e-05],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832614, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983051262167386, 1, 0.0005399594867289066],
[525.6825185680552, 1218.625958021119, 0, 0, 0.3013701564966171, 0, 0, 0, 1, 1, 1.51878068713339e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993921, 0, 0.0008208256793283724, 0.005077450137667971, 0.6984346451006079, 1, 0.0005399594867289066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 1.518790090700838e-05],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005399594867289066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[525.6825185680552, 1218.625958021119, 0, 0, 0.3013701564966171, 0, 0, 0, 1, 1, 1.51879121938408e-05],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993921, 0, 0.0008208256793283724, 0.005077450137667971, 0.6984346451006079, 1, 0.0005399594867289066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 1.429219931437244e-05],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005407075402964407],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 1.518790602689808e-05],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005399594867289066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 1.757004696769509e-05],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005375784687471618],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[525.1378032984913, 1216.181002159921, 1, 0, 0.3015747614120813, 0.0019042620693441, 0, -0.01177935333852912, 1, 0.3015747614120814, 0.0005565917852194067],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832614, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983051262167386, 1, 0.0005553292492161137],
[526.748925683644, 1217.55955090553, 0, 1, 0.3019815203292771, 0, 0.0008213150636092292, 0.005080477362993381, 0.6980184796707229, 1, 0.0005552245283104478],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3017849445934618, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6982150554065383, 1, 0.0005553331225921431],
[525.6479237161067, 1215.67087574405, 0, 1, 0.3018677130684329, 0, 0.0008225910646974666, 0.00508837042977272, 0.6981322869315671, 1, 0.0005562685572003699],
[526.5230047966323, 1217.785471792542, 0, 1, 0.3018520014454077, 0, 0.000821162695041871, 0.005079534843987467, 0.6981479985545922, 1, 0.000555365331496183],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000174579634679233],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.000380610396711027],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[525.5415375916268, 1218.766938997547, 0, 2, 0.301289333076723, 0, 0.001641002833277565, 0.01015088863759272, 0.4881965960723705, 1, 0.00111163444907074],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993922, 0, 0.0008208256793283726, 0.005077450137667972, 0.6984346451006078, 1, 0.0005555949571903236],
[526.2225100487811, 1218.085966540393, 0, 1, 0.3016797298822729, 0, 0.0008209601189645088, 0.005078281752182722, 0.6983202701177271, 1, 0.0005551284910536949],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.0815290723527, 1218.190034759698, 0, 1, 0.3016052889818292, 0, 0.0008208899855245177, 0.005077847921890241, 0.6983947110181707, 1, 0.0005555256127754012],
[525.9669637307873, 1218.341512858387, 0, 1, 0.3015332269434731, 0, 0.0008207879231282783, 0.005077216585979478, 0.6984667730565269, 1, 0.0005555256127754012],
[526.2225100487811, 1218.085966540393, 0, 1, 0.3016797298822729, 0, 0.0008209601189645088, 0.005078281752182722, 0.6983202701177271, 1, 0.0005551497694513415],
[526.2225100487811, 1218.085966540393, 0, 1, 0.3016797298822729, 0, 0.0008209601189645088, 0.005078281752182722, 0.6983202701177271, 1, 0.0005554864964312233],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552526613488651],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.000555359042651865],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832614, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983051262167386, 1, 0.0005553432874262058],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552879929374171],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[525.5069403485558, 1215.838083142036, 0, 1, 0.3017822047092984, 0, 0.000822477938358161, 0.005087670654702877, 0.6982177952907016, 1, 0.0005557302134923554],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.1553545866007, 1218.153122002574, 0, 0, 0.3016412301197127, 0, 0, 0, 1, 1, 4.514537518804259e-05],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005099961398379464],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 2.301640736106077e-05],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005321283562953527],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005553534736192855],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552979279741175],
[524.5017307314855, 1216.734318936074, 0, 2, 0.3012237949194909, 0, 0.001643744216690479, 0.01016784624252376, 0.4882881847867177, 1, 0.001161825077342176],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993922, 0, 0.0008208256793283726, 0.005077450137667972, 0.6984346451006078, 1, 0.0005553737473514735],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552922452903899],
[525.3483999646022, 1215.720879326195, 0, 1, 0.3017389406690332, 0, 0.0008225572308622709, 0.005088161140985224, 0.6982610593309668, 1, 0.0005563942313297117],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005550418593143525],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.8265782680855, 1217.481898321089, 0, 1, 0.3020260380195158, 0, 0.0008213674481559053, 0.005080801402470252, 0.6979739619804842, 1, 0.0005551938589003094],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832615, 0, 0.0008209779228417689, 0.005078391883117123, 0.6983051262167386, 1, 0.0005552833258770421],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005551915681142927],
[526.4767661251194, 1217.911424404364, 0, 1, 0.3018117005053303, 0, 0.0008210777729497561, 0.005079009534291195, 0.6981882994946697, 1, 0.0005552263340617115],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005555472962656454],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 1.232603458281302e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.000542818013319526],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3017849445934618, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6982150554065383, 1, 0.0005554596873448689],
[526.259422805905, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017188927401842, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017188927401842, 0.0005555472962656454],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005554394478576918],
[526.2225100487811, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016842985594201, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983157014405799, 1, 0.0005553689480325449],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552833258770194],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005551915681142927],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552263340617115],
[526.8265782680855, 1217.481898321089, 0, 1, 0.3020260380195158, 0, 0.0008213674481559053, 0.005080801402470252, 0.6979739619804842, 1, 0.0005552833258770194],
[526.3265782680855, 1217.981898321089, 0, 1, 0.3017393914735002, 0, 0.0008210302643893452, 0.005078715656610862, 0.6982606085264998, 1, 0.0005552321253329958],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005555842105881906],
[526.0230047966323, 1218.285471792542, 0, 1, 0.3015653548993922, 0, 0.0008208256793283726, 0.005077450137667972, 0.6984346451006078, 1, 0.0005554260715241958],
[526.7039772537867, 1217.604499335388, 0, 1, 0.3019557517049422, 0, 0.0008212847443860761, 0.005080289814835898, 0.6980442482950577, 1, 0.0005553590426516468],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553432873853574],
[526.2225100487811, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016842985594201, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983157014405799, 1, 0.0005552263340617115],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005554596873830507],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832614, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983051262167386, 1, 0.0005554337876196438],
[526.2225100487811, 1218.085966540393, 0, 1, 0.3016797298822729, 0, 0.0008209601189645088, 0.005078281752182722, 0.6983202701177271, 1, 0.000555363793863433],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.804004587536, 0, 2, 0.3017849445934618, 0, 0.001642300396833881, 0.01015891508513642, 0.4875042635963553, 1, 0.001111626486102828],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005554596873448779],
[526.3265782680855, 1217.981898321089, 0, 1, 0.3017393914735002, 0, 0.0008210302643893452, 0.005078715656610862, 0.6982606085264998, 1, 0.000555994038643771],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553166632026115],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.000555229139139137],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005550111555910232],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.0005553590426516468],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005552321252917079],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552879929775738],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552919255474907],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552833259184201],
[526.0051667295667, 1218.276894224745, 1, 0, 0.3015596952489352, 0.001901122010297908, 0, -0.01175992961234962, 1, 0.3015596952489352, 0.0005552321253329958],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552879929374171],
[526.5629962773583, 1217.641412092511, 0, 1, 0.3018929396982106, 0, 0.0008212598471675699, 0.005080135806026578, 0.6981070603017894, 1, 0.0005554596873448689],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553860209415649],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553568211773479],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005553254849160295],
[527.2141601731925, 1217.094316415982, 0, 1, 0.3022482360483099, 0, 0.0008216290114185509, 0.005082419376246384, 0.6977517639516901, 1, 0.0005551873753810754],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.748925683644, 1217.55955090553, 0, 1, 0.3019815203292771, 0, 0.0008213150636092292, 0.005080477362993381, 0.6980184796707229, 1, 0.0005553037408654969],
[526.259422805905, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017188927401842, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017188927401842, 0.0005554407611364741],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832614, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983051262167386, 1, 0.0005552833258770194],
[526.2687487202941, 1218.03972786888, 1, 0, 0.3017062381932361, 0.001900169832298913, 0, -0.01175403964516922, 1, 0.3017062381932361, 0.0005553037707394251],
[526.3634910252094, 1217.981898321089, 0, 1, 0.3017541676321722, 0, 0.0008210302643893452, 0.005078715656610862, 0.6982458323678278, 1, 0.0005554323071392913],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552361014455729],
[526.5044720016379, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3018413767220613, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6981586232779387, 1, 0.0005555842601757307],
[526.259422805905, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017188927401842, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017188927401842, 0.0005552321253329958],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.0005553254848780498],
[526.3634910252094, 1217.981898321089, 0, 1, 0.3017541676321722, 0, 0.0008210302643893452, 0.005078715656610862, 0.6982458323678278, 1, 0.0005553590426138714],
[526.5730169196761, 1217.682628399773, 0, 1, 0.3018898166290514, 0, 0.0008212320490390489, 0.00507996385281527, 0.6981101833709487, 1, 0.0005552369603833523],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.4682539724428, 1217.813806981869, 0, 1, 0.301825183986819, 0, 0.0008211435888367199, 0.005079416657134377, 0.6981748160131811, 1, 0.0005552563168292258],
[526.5629962773583, 1217.641412092512, 0, 1, 0.3018929396982106, 0, 0.0008212598471675698, 0.005080135806026578, 0.6981070603017894, 1, 0.0005554176111988369],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552833258770421],
[526.3634910252094, 1217.947788919229, 1, 0, 0.3017600683302213, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017600683302213, 0.0005551915680762867],
[526.3634910252094, 1217.908072806841, 0, 1, 0.3017669392424327, 0, 0.0008210800324981499, 0.005079023511368901, 0.6982330607575673, 1, 0.0005552263340617115],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.000555236101445855],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005554323071401539],
[526.259422805905, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017188927401842, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017188927401842, 0.0005552321253329958],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.0005553254848780498],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.7495211973707, 1217.558955391804, 1, 0, 0.3019818617331827, 0.001898435517752098, 0, -0.0117433115504516, 1, 0.3019818617331826, 0.0005552606579250015],
[526.5044720016379, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3018413767220613, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6981586232779387, 1, 0.0005552788991380316],
[526.4004037823335, 1217.908072806841, 0, 1, 0.3017817151308341, 0, 0.0008210800324981499, 0.005079023511368901, 0.6982182848691658, 1, 0.0005553032210512146],
[526.467559244514, 1217.833223577663, 1, 0, 0.3018215461628815, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018215461628815, 0.0005553590426516468],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553432873849864],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552263340617115],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005553590426138714],
[526.4767661251194, 1218.081232965593, 0, 1, 0.3017823233160068, 0, 0.0008209633092904293, 0.005078301486848914, 0.6982176766839931, 1, 0.0005552879929374171],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552321253329958],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.908072806841, 0, 1, 0.3017669392424327, 0, 0.0008210800324981499, 0.005079023511368901, 0.6982330607575673, 1, 0.0005553131674274513],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005550854286863407],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001269322550430629],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0004281127550575181],
[526.1553545866007, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3016772272065371, 0.001900579346542426, 0, -0.01175657281171659, 1, 0.3016772272065371, 0.0005553593285580299],
[526.0512863672961, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3016355567003358, 0.001900955336323969, 0, -0.01175889860319234, 1, 0.3016355567003358, 0.0005555472962656454],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.1553545866007, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3016772272065371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001426393570631964],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.259422805905, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017188927401842, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017188927401842, 0.0004125006993273388],
[525.3634910252094, 1218.908072806841, 0, 1, 0.3011936340182146, 0, 0.0008204064131737596, 0.005074856647907515, 0.6988063659817854, 1, 0.0005551194951821866],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[525.3634910252094, 1218.944985563965, 1, 0, 0.301187260210136, 0.001903444028911433, 0, -0.01177429311732495, 1, 0.301187260210136, 0.0005556585856730084],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[525.8634910252094, 1218.444985563965, 0, 1, 0.3014739067561516, 0, 0.0008207182202298153, 0.005076785418923781, 0.6985260932438484, 1, 0.0005551394081468119],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.7625015295071, 1217.337838621058, 1, 0, 0.3020253418929054, 0.001898388737042597, 0, -0.01174302217509959, 1, 0.3020253418929053, 0.0005553975621406546],
[526.5629962773583, 1217.641412092511, 0, 1, 0.3018929396982106, 0, 0.0008212598471675699, 0.005080135806026578, 0.6981070603017894, 1, 0.0005553023052221657],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005550793089058266],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005551669457454335],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.0815290723527, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3016080415070145, 0.001900846056624179, 0, -0.01175822262260265, 1, 0.3016080415070146, 0.000555145895473111],
[526.2225100487811, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016842985594201, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983157014405799, 1, 0.0005552049972632414],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.5926217083405, 1217.715854880834, 1, 0, 0.3018919123399785, 0.001899001161003471, 0, -0.01174681049727659, 1, 0.3018919123399786, 0.0005551577388732825],
[526.478056366775, 1217.830420222399, 0, 1, 0.3018262328210728, 0, 0.0008211323870669783, 0.00507934736540929, 0.6981737671789272, 1, 0.000555279253928462],
[526.3976004270696, 1217.910876162105, 1, 0, 0.3017801079866269, 0.001899704708358651, 0, -0.0117511624890641, 1, 0.3017801079866269, 0.0005552823582450262],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552571821345595],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.2517290389077, 1218.056747550266, 1, 0, 0.3016964809274687, 0.001900231286320517, 0, -0.0117544197864566, 1, 0.3016964809274687, 0.0005552376209974916],
[526.3265782680855, 1217.981898321089, 0, 1, 0.3017393914735002, 0, 0.0008210302643893452, 0.005078715656610862, 0.6982606085264998, 1, 0.0005553116179175752],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005549069198114955],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553734527253916],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.0005550396253386545],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.6756956831227, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3019035139877656, 0.001898701626440069, 0, -0.01174495764124579, 1, 0.3019035139877656, 0.0005549965502014293],
[526.467559244514, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3018022088933759, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018022088933758, 0.0005552103335905571],
[525.6479184222402, 1216.092833709017, 0, 1, 0.3017945798070341, 0, 0.0008223056433529456, 0.00508660487506174, 0.6982054201929659, 1, 0.0005550766819883412],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005550272472254669],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005550632997791584],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 0, 1, 0.3017209195324898, 0, 0.0008209007125194564, 0.005077914276761074, 0.6982790804675103, 1, 0.0005553048029040938],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005552814325140342],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 0, 1, 0.3017209195324898, 0, 0.0008209007125194564, 0.005077914276761074, 0.6982790804675103, 1, 0.0005554440366393998],
[526.259422805905, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3016792620781615, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3016792620781614, 0.0005553995970892081],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005552485733583433],
[527.2896655109616, 1217.247941761344, 0, 0, 0.3022518192287137, 0, 0, 0, 1, 1, 2.859142972788199e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.8265782680855, 1217.71102900422, 0, 1, 0.3019863693806017, 0, 0.0008212128954910982, 0.00507984537310986, 0.6980136306193983, 1, 0.0005265380070022337],
[526.259422805905, 1218.2781844664, 1, 0, 0.3016612657773224, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3016612657773224, 0.0005552650411530883],
[526.2517290389077, 1218.285878233397, 1, 0, 0.3016568555731713, 0.001900231286320517, 0, -0.0117544197864566, 1, 0.3016568555731713, 0.0005552977436125644],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.000555426928926429],
[526.2225100487811, 1218.288681588661, 0, 1, 0.3016446742051883, 0, 0.0008208235167185411, 0.005077436760231249, 0.6983553257948117, 1, 0.0005552484048013581],
[526.5629962773583, 1217.870542775643, 0, 1, 0.3018532861751861, 0, 0.000821105334989797, 0.005079180027110224, 0.6981467138248139, 1, 0.0005552715628744914],
[526.248925683644, 1218.288681588661, 0, 1, 0.3016552486400493, 0, 0.0008208235167185413, 0.00507743676023125, 0.6983447513599507, 1, 0.0005553838146338278],
[526.0230047966323, 1218.514602475673, 0, 1, 0.3015257467674214, 0, 0.0008206713304611092, 0.005076495368955112, 0.6984742532325786, 1, 0.0005552883532478237],
[526.0999090344822, 1218.296717261395, 1, 0, 0.301594202318325, 0.001900779648176022, 0, -0.01175781183430408, 1, 0.3015942023183249, 0.0005553930923244919],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005553024156661831],
[526.259422805905, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3016792620781615, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3016792620781614, 0.0005552030160598061],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005553219589401747],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005551179069551475],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005552747581689673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.9403952630594, 1217.493143789942, 1, 0, 0.3020696308952642, 0.001897747845846549, 0, -0.01173905776076223, 1, 0.3020696308952642, 0.0005552923567640578],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.7039772537867, 1217.833630018519, 0, 1, 0.3019160922975582, 0, 0.0008211302228406961, 0.005079333977973551, 0.6980839077024418, 1, 0.0005552823785098003],
[526.4682539724428, 1218.042937665, 0, 1, 0.3017855411281634, 0, 0.0008209891203975205, 0.005078461148775379, 0.6982144588718366, 1, 0.0005551880921052584],
[526.5629962773583, 1217.833630018519, 0, 1, 0.3018596736199173, 0, 0.0008211302228406961, 0.005079333977973551, 0.6981403263800827, 1, 0.000555279252341526],
[526.3634910252094, 1218.557489549663, 0, 1, 0.301654628997467, 0, 0.0008206424469719239, 0.005076316701937457, 0.698345371002533, 1, 0.0005555276033679119],
[526.2225100487811, 1218.315097223524, 0, 1, 0.3016401067280878, 0, 0.0008208057195375377, 0.005077326670718443, 0.6983598932719122, 1, 0.0005550143708474256],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005552601107507376],
[526.3265782680855, 1218.21102900422, 0, 1, 0.3016997604832551, 0, 0.0008208758385789792, 0.005077760411944609, 0.6983002395167448, 1, 0.0005552722232797245],
[526.259422805905, 1218.2781844664, 1, 0, 0.3016612657773224, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3016612657773224, 0.0005554503605738653],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 0, 1, 0.3017209195324898, 0, 0.0008209007125194564, 0.005077914276761074, 0.6982790804675103, 1, 0.000555279867736239],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 0, 1, 0.3017209195324898, 0, 0.0008209007125194564, 0.005077914276761074, 0.6982790804675103, 1, 0.0005551655118652632],
[526.2225100487811, 1218.315097223524, 0, 1, 0.3016401067280878, 0, 0.0008208057195375377, 0.005077326670718443, 0.6983598932719122, 1, 0.0005553838146338278],
[526.4432908563236, 1218.17403035629, 0, 1, 0.3017528740861141, 0, 0.0008209007703993829, 0.005077914634793783, 0.6982471259138858, 1, 0.0005552897056530034],
[526.268748720294, 1218.268858552011, 1, 0, 0.301666611557402, 0.001900169832298914, 0, -0.01175403964516922, 1, 0.301666611557402, 0.0005551866824889119],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005552694159091529],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3017209195324898, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017209195324897, 0.0005552904365356467],
[526.259422805905, 1218.2781844664, 1, 1, 0.3016612657773224, 0.00190020350546544, 0.0008208305892286785, -0.006676767430845641, 0.9090004807296236, 0.5123230122842686, 0.001110923713108089],
[526.2502159252995, 1217.82430410413, 0, 2, 0.3017360840272006, 0, 0.00164227302186358, 0.01015874574949035, 0.4875724963496686, 1, 0.001111190633625447],
[526.259422805905, 1218.2781844664, 1, 0, 0.3016612657773224, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3016612657773224, 0.000555241631515076],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 0, 2, 0.3017209195324898, 0, 0.001641801425038913, 0.01015582855352215, 0.4875936742185517, 1, 0.001110739464870277],
[525.5599175537562, 1218.977689718549, 0, 2, 0.3012602969193094, 0, 0.001640719118051933, 0.01014913363656422, 0.4882371726612916, 1, 0.001111112049416655],
[526.3634910252094, 1218.174116247096, 0, 1, 0.3017209195324898, 0, 0.0008209007125194564, 0.005077914276761074, 0.6982790804675103, 1, 0.0005549763614122695],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3017407351158504, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6982592648841496, 1, 0.0005554383257923608],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005555121535934414],
[526.0815290723527, 1218.226947516821, 1, 0, 0.3015989064623788, 0.001900846056624179, 0, -0.01175822262260265, 1, 0.3015989064623787, 0.0005553963772633145],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.2225100487811, 1218.085966540393, 0, 1, 0.3016797298822729, 0, 0.0008209601189645088, 0.005078281752182722, 0.6983202701177271, 1, 0.000555439447894309],
[526.0258081518961, 1218.282668437278, 1, 0, 0.3015669620435993, 0.001901047409657205, 0, -0.01175946814891964, 1, 0.3015669620435993, 0.0005557013314807532],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005553590426138714],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005551166009509074],
[526.3634910252094, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3017849445934618, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6982150554065383, 1, 0.0005552263340617115],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005553258050109434],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005556663208343013],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832614, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983051262167386, 1, 0.0005552833258770194],
[526.259422805905, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017188927401842, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017188927401842, 0.0005552321252917079],
[526.3634910252094, 1217.908072806841, 0, 1, 0.3017669392424327, 0, 0.0008210800324981499, 0.005079023511368901, 0.6982330607575673, 1, 0.0005552879929784758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.871160049717, 1, 0, 0.3017733254529861, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017733254529862, 0.0005551700731895549],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.908072806841, 0, 1, 0.3017669392424327, 0, 0.0008210800324981499, 0.005079023511368901, 0.6982330607575673, 1, 0.0005550825292610723],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005554365883009995],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.0005553254848780498],
[526.5571141984925, 1217.751362390682, 0, 1, 0.3018715561298674, 0, 0.0008211856959345184, 0.00507967712253513, 0.6981284438701325, 1, 0.0005553367785561364],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 0, 0.3017605533021671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001527780172154942],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0004023178510666491],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.4767661251194, 1218.081232965593, 0, 1, 0.3017823233160068, 0, 0.0008209633092904293, 0.005078301486848914, 0.6982176766839931, 1, 0.0005552567176859989],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005553254848780498],
[526.2988723915672, 1218.03648686819, 0, 1, 0.3017188579006461, 0, 0.0008209934684068417, 0.005078488044620725, 0.6982811420993539, 1, 0.0005629650880856031],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.2225100487811, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016842985594201, 0, 0.0008209779228417689, 0.005078391883117123, 0.6983157014405799, 1, 0.0005552819443061564],
[526.259422805905, 1218.056747550267, 1, 0, 0.301699560979503, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.301699560979503, 0.0005554260715241958],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.4767661251194, 1218.081232965593, 0, 1, 0.3017823233160068, 0, 0.0008209633092904293, 0.005078301486848914, 0.6982176766839931, 1, 0.0005555318520262064],
[526.4582333301249, 1217.850243259049, 1, 0, 0.3018148684110983, 0.001899485916811434, 0, -0.01174980909186964, 1, 0.3018148684110984, 0.0005553846523577981],
[526.5044720016379, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3018413767220613, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6981586232779387, 1, 0.000555236101445855],
[526.3634910252094, 1218.085966540393, 0, 1, 0.301736165953329, 0, 0.0008209601189645088, 0.005078281752182722, 0.6982638340466709, 1, 0.0005553590426516468],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552321253329958],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005555842601757307],
[526.5230047966323, 1217.785471792542, 0, 1, 0.3018520014454077, 0, 0.0008211626950418709, 0.005079534843987466, 0.6981479985545923, 1, 0.0005554668742309675],
[526.259422805905, 1218.049053783269, 1, 0, 0.3017008917109399, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017008917109398, 0.0005552833258770194],
[526.3634910252094, 1217.981898321089, 1, 0, 0.3017541676321722, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017541676321722, 0.000555620114159773],
[526.3634910252094, 1217.804004587536, 0, 1, 0.3017849445934618, 0, 0.0008211501984169403, 0.00507945754256821, 0.6982150554065383, 1, 0.00055511660095111],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552321252917079],
[526.4860920395084, 1218.071907051204, 0, 1, 0.3017876690336005, 0, 0.0008209695948253758, 0.005078340367808762, 0.6982123309663995, 1, 0.0005552573854467867],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.000555236101445855],
[526.3976004270696, 1217.910876162105, 0, 1, 0.3017801079866269, 0, 0.0008210781425576984, 0.005079011820605993, 0.6982198920133731, 1, 0.0005552263340617115],
[526.467559244514, 1217.84091734466, 1, 0, 0.3018202148933944, 0.0018994522690724, 0, -0.01174960095423276, 1, 0.3018202148933944, 0.0005552515642352781],
[526.3634910252094, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3017407351158505, 0, 0.0008209779228417689, 0.005078391883117123, 0.6982592648841495, 1, 0.0005552025393073786],
[526.3606876699457, 1217.947788919229, 0, 1, 0.3017589461579599, 0, 0.0008210532578636814, 0.005078857889270457, 0.69824105384204, 1, 0.0005556263808102589],
[526.030292122774, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3015875258648159, 0.001901031204808644, 0, -0.01175936790923095, 1, 0.301587525864816, 0.000555419689643526],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.1343603420785, 1218.174116247096, 1, 0, 0.3016291942643557, 0.001900655185017429, 0, -0.01175704193212187, 1, 0.3016291942643557, 0.000555475627823232],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.248925683644, 1218.05955090553, 0, 1, 0.3016948737832614, 0, 0.0008209779228417687, 0.005078391883117122, 0.6983051262167386, 1, 0.0005553725583598469],
[526.259422805905, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017188927401842, 0.00190020350546544, 0, -0.01175424794009507, 1, 0.3017188927401842, 0.0005553668267903595],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553370626318113],
[526.7039772537867, 1217.604499335388, 0, 1, 0.3019557517049422, 0, 0.0008212847443860761, 0.005080289814835898, 0.6980442482950577, 1, 0.0005553037707775242],
[526.4682539724428, 1217.813806981869, 0, 1, 0.301825183986819, 0, 0.0008211435888367197, 0.005079416657134376, 0.6981748160131811, 1, 0.0005552263340617115],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005554596873830507],
[526.4767661251194, 1217.911424404364, 0, 1, 0.3018117005053303, 0, 0.0008210777729497561, 0.005079009534291195, 0.6981882994946697, 1, 0.0005553424131623563],
[526.4582333301249, 1217.850243259049, 1, 0, 0.3018148684110983, 0.001899485916811434, 0, -0.01174980909186964, 1, 0.3018148684110984, 0.0005556039616466157],
[526.2517290389077, 1218.056747550266, 1, 0, 0.3016964809274687, 0.001900231286320517, 0, -0.0117544197864566, 1, 0.3016964809274687, 0.0005552833259184201],
[526.2687487202941, 1218.154293210446, 1, 0, 0.3016864235740753, 0.001900169832298913, 0, -0.01175403964516922, 1, 0.3016864235740753, 0.0005553037707394251],
[526.3899066600723, 1217.918569929102, 0, 1, 0.3017756972031556, 0, 0.0008210729556888293, 0.0050789797357569, 0.6982243027968444, 1, 0.0005559101765465754],
[525.8234995444835, 1218.511392679553, 1, 2, 0.3014464148418516, 0.001901778830475039, 0.001641346984538177, -0.001610975077055601, 0.7821750128123284, 0.6591218394002104, 0.001669582607135305],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005553189176992722],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 1, 0, 0.3017605533021671, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017605533021671, 0.0005552833259184201],
[526.3634910252094, 1217.944985563965, 0, 1, 0.3017605533021671, 0, 0.0008210551476895763, 0.005078869579324742, 0.6982394466978329, 1, 0.0005552515642352781],
[526.748925683644, 1217.55955090553, 0, 1, 0.3019815203292771, 0, 0.0008213150636092292, 0.005080477362993381, 0.6980184796707229, 1, 0.0005552879929374171],
[526.3634910252094, 1217.947788919229, 1, 0, 0.3017600683302213, 0.001899827813004809, 0, -0.01175192398778219, 1, 0.3017600683302213, 0.0005552361014835277],
[526.3265782680855, 1217.981898321089, 0, 1, 0.3017393914735002, 0, 0.0008210302643893452, 0.005078715656610862, 0.6982606085264998, 1, 0.0005553432873853574],
[526.3634910252094, 1217.908072806841, 0, 1, 0.3017669392424327, 0, 0.0008210800324981499, 0.005079023511368901, 0.6982330607575673, 1, 0.0005552879929374171]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9928132013319511, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333333, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4964066006659755, 3.092891868235964, 0.6666666666666667, 1, 0.1604991774087148],
[0.7232357972073383, 2.245266964762827, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.9986490641418466, 2.000675467929078, 0, 2, 0.332957988861684, 0, 0.9996623800611815, 6.18369529254528, 0.4449450446234492, 1, 0.161661002486057],
[0.9251019503625982, 2.006758538494908, 1, 0, 0.3155340964818875, 1.080961941122322, 0, -6.686596795139589, 1, 0.3155340964818875, 0.161661002486057],
[0.7183953502934814, 2.28160464970652, 1, 0, 0.2394651167644937, 1.391991192024665, 0, -8.610556476938351, 1, 0.2394651167644937, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 1.582337666924497, 0, 0, 0.236995756849677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 6.185783736471929, 0.4444444444444444, 1, 0.161661002486057],
[0.9258169338297485, 2.005990696275682, 1, 0, 0.3157836565820163, 1.080127143347211, 0, -6.681432916639064, 1, 0.3157836565820163, 0.161661002486057],
[0.320197225719357, 2.679802774280642, 0, 1, 0.1067324085731191, 0, 0.3731617899636054, 2.308298131429625, 0.8932675914268809, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258168557921094, 2.074183144207889, 1, 0, 0.3086056185973699, 1.080127234391754, 0, -6.681433479820917, 1, 0.3086056185973699, 0.161661002486057],
[1.398685065519112, 1.319746512316107, 1, 0, 0.514519135564535, 0.7149572299385759, 0, -4.422570805227067, 1, 0.514519135564535, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.005606710527464, 0, 0, 0.3159084610159388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.925459650349436, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3163467492155951, 2.161088275696124, 0, -13.36802470888125, 0.9999999999999999, 0.1000752657392747, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.717259441121378, 2.279557489375638, 0, 1, 0.2393404261108542, 0, 0.4386816321416382, 2.713589705590709, 0.7606595738891457, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.92630129328856, 0, 1, 0.3417283115356199, 0, 0.5191295896878163, 3.211223373012241, 0.6582716884643801, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.208681884496655, 1.738577570540498, 0, 1, 0.4101036583090438, 0, 0.575182848867143, 3.557956712019966, 0.5898963416909562, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.001633758279812, 1.998249078639444, 1, 2, 0.333890959324413, 0.9983689065326454, 1.000876227783249, 0.01550974701409422, 0.7399969288193393, 0.7044465833050434, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9980318899120386, 2.001968110087963, 0, 1, 0.332677296637346, 0, 0.4995084561841804, 3.089851284494306, 0.667322703362654, 1, 0.161661002486057],
[0.9258170257213308, 2.005990597590552, 1, 0, 0.3157836886567245, 1.080127036139642, 0, -6.68143225347623, 1, 0.3157836886567245, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.280992528041677, 0, 1, 0.239423383370808, 0, 0.4384056447824229, 2.711882507472603, 0.760576616629192, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.001590641035507, 1.998155809063486, 0, 3, 0.3338917664199433, 0, 1.501384419769581, 9.287239326003025, 0.2955523423683614, 1, 0.161661002486057],
[0.999031455227712, 2.000787068336949, 0, 2, 0.3330306308131502, 0, 0.999606620639745, 6.183350376823004, 0.4448481394335043, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7179742621854597, 2.281166947640609, 0, 1, 0.2393932835950387, 0, 0.4383721239843016, 2.71167515506475, 0.7606067164049612, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.6813935267442207, 1.394022447065402, 0, 1, 0.3283166051254093, 0, 0.717348563579539, 4.437363077971814, 0.6716833948745907, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9254594241540378, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3163466963557885, 2.161088803896723, 0, -13.36802797621593, 0.9999999999999998, 0.1000752322952216, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.500954996922673, 0, 0, 0.3998472588393079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6806470183758283, 2.159925101006681, 1, 0, 0.2396161722955265, 1.469190304228787, 0, -9.088093489680681, 1, 0.2396161722955266, 0.161661002486057],
[1.001370697449137, 1.924215613633614, 0, 3, 0.3422803469019967, 0, 1.559076840840573, 9.644112165981657, 0.2845263267750551, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.003262486758875, 1.996737513241126, 1, 2, 0.3344208289196248, 0.9967481224485779, 1.001633908682157, 0.03022241702355242, 0.7392895665512812, 0.7051513338115817, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 3, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 1.499999999999999, 3.092891868235965, 0.5925925925925926, 0.8024691358024691, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7185369360148699, 2.281463063985131, 0, 1, 0.2395123120049566, 0, 0.4383152266569051, 2.711323200502293, 0.7604876879950434, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.500954996922673, 0, 0, 0.3998472588393079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9995157994227988, 2.000393475814389, 0, 1, 0.333182009093849, 0, 0.4999016503954981, 3.09228349885195, 0.6668179909061509, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7183954515684015, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2642718708030197, 1.39199099579041, 0, -8.610555263075685, 1, 0.2642718708030197, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7183953225641418, 2.281604677435859, 1, 0, 0.2394651075213805, 1.39199124575413, 0, -8.610556809297202, 1, 0.2394651075213805, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9264184296252966, 2.073581570374702, 0, 2, 0.3088061432084324, 0, 0.9645147451993386, 5.966279624441438, 0.4777489476664021, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7183955559163, 2.281604444083701, 1, 0, 0.2394651853054333, 1.391990793601888, 0, -8.610554012381217, 1, 0.2394651853054333, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258169121897579, 2.074183087810241, 1, 0, 0.3086056373965861, 1.08012716859404, 0, -6.681433072810488, 1, 0.3086056373965861, 0.161661002486057],
[0, 2.017024305353326, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9988304765991052, 2.001169523400896, 0, 1, 0.3329434921997015, 0, 0.4997077900229789, 3.091084320512474, 0.6670565078002985, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258168557921094, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3164302146798117, 1.080127234391754, 0, -6.681433479820917, 1, 0.3164302146798117, 0.161661002486057],
[0.7720496845915841, 2.227950315408417, 0, 1, 0.2573498948638613, 0, 0.4488430433497728, 2.776445997781591, 0.7426501051361387, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9254593358345707, 2.074540664165428, 1, 1, 0.3084864452781904, 1.08054450506808, 0.4820344171958144, -3.702253967674646, 0.9048361130796261, 0.5218090036360068, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9988175642971988, 2.001182435702803, 0, 1, 0.3329391880990661, 0, 0.4997045657403076, 3.091064375797164, 0.6670608119009339, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4917619519252438, 2.349083977032671, 0, 1, 0.1731040557013357, 0, 0.4256978506418428, 2.633274841151369, 0.8268959442986643, 1, 0.161661002486057],
[0.999878695231371, 2.000121304768631, 0, 0.75, 0.3332928984104568, 0, 0.374977256735315, 2.319528216260172, 0.7378215076609936, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.001591692076586, 1.998408307923416, 1, 0, 0.3338638973588617, 0.9984108373809634, 0, -6.175953520188487, 1, 0.3338638973588617, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.9995958168181889, 2.000404183181813, 0, 1, 0.3331986056060627, 0, 0.4998989746209264, 3.092266947089122, 0.6668013943939373, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.009467149599337, 0, 0, 0.1965200685050679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.009467149599337, 0, 0, 0.1965200685050679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7183954867277682, 2.281604513272233, 1, 0, 0.2394651622425893, 1.391990927664255, 0, -8.610554841662026, 1, 0.2394651622425893, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.924943804529305, 1.074965469761577, 1, 0, 0.6416673400845839, 0.5194956848335239, 0, -3.213487958410561, 1, 0.6416673400845839, 0.161661002486057],
[0.999515662087483, 2.000484337912519, 0, 1, 0.3331718873624941, 0, 0.4998789448376726, 3.092143047181626, 0.6668281126375059, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9996064837968568, 2.000393516203145, 1, 1, 0.3332021612656187, 1.000393671119107, 0.4999016403022811, -3.095935464460532, 0.8889763197279206, 0.5553806422591581, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9995153600007178, 2.000393832901863, 1, 1, 0.3331818717598016, 1.000484874989096, 0.4999015611587614, -3.096500121440912, 0.8889898403306351, 0.5553535838502384, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.926174485752164, 1.073825514247834, 0, 0, 0.6420581619173885, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258169181938307, 2.074183081806168, 1, 0, 0.3086056393979437, 1.08012716158924, 0, -6.681433029480312, 1, 0.3086056393979437, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281477548777291, 0, 1, 0.2393846686844487, 0, 0.4383124438528569, 2.71130598667827, 0.7606153313155513, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0, 2.017024305353326, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9985464529901482, 2.001453547009854, 0, 2, 0.3328488176633825, 0, 0.9992737543111979, 6.181291337701458, 0.4450907000931466, 1, 0.161661002486057],
[0.9995157028588677, 2.000484297141134, 0, 1, 0.3331719009529557, 0, 0.499878955025584, 3.092143110201842, 0.6668280990470443, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9970935924479285, 2.002906407552073, 0, 2, 0.3323645308159759, 0, 0.9985489049607538, 6.176807576378088, 0.445737119712572, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.068218803720369, 1.005606710527463, 0, 0, 0.515095795852337, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000706901866805, 1.998793563838496, 0, 1, 0.3336245195852969, 0, 0.5003017910862159, 3.094758682628893, 0.6663754804147031, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.500954996922673, 0, 0, 0.3998472588393079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.009467149599337, 0, 0, 0.1965200685050679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258168557921095, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3164302146798117, 1.080127234391753, 0, -6.681433479820915, 1, 0.3164302146798117, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6812465686990332, 2.159325550683476, 0, 1, 0.2398272390447613, 0, 0.4631075660098947, 2.864683250061108, 0.7601727609552387, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258170586813748, 2.073802668143343, 1, 1, 0.3086448093410191, 1.080126997686004, 0.4822059568933293, -3.698610249829696, 0.9047383816668459, 0.5220280003488842, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9985475571731641, 2.001180298312415, 0, 2, 0.3328793828237211, 0, 0.9994101989144053, 6.182135354508907, 0.4450499178616593, 1, 0.161661002486057],
[0.7183954925817718, 2.281120379624205, 1, 1, 0.2395038143450236, 1.391990916321311, 0.4383810731482489, -5.898824258839476, 0.9426379229141844, 0.4216455516042318, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 6.185783736471929, 0.4444444444444444, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9996064413035204, 2.000393558696481, 0, 1, 0.3332021471011732, 0, 0.4999016296831265, 3.092283370729699, 0.6667978528988268, 1, 0.161661002486057],
[0.9258169243734061, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3164302307027221, 1.080127154379686, 0, -6.681432984883569, 1, 0.316430230702722, 0.161661002486057],
[1.068218803720369, 1.005606710527463, 0, 0, 0.515095795852337, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.998798774940163, 2.001201225059839, 0, 1, 0.3329329249800541, 0, 0.4996998739944798, 3.091035353672127, 0.6670670750199459, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9239374820774798, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3159908471849456, 2.164648624821439, 0, -13.39004825859679, 1, 0.09985021550465945, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7185225598599145, 2.281477440140086, 0, 1, 0.2395075199533048, 0, 0.4383124647239985, 2.711306115782637, 0.7604924800466952, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000484070068947, 0, 1, 0.2641280873151813, 0, 0.4998790117661545, 3.09214346118674, 0.7358719126848188, 1, 0.161661002486057],
[0.7181288836469201, 2.281871116353081, 0, 1, 0.2393762945489732, 0, 0.4382368455577869, 2.71083835197412, 0.7606237054510268, 1, 0.161661002486057],
[1.000359809392763, 1.999549465844425, 0, 1, 0.3334633542588282, 0, 0.5001126589172389, 3.093588751933991, 0.6665366457411718, 1, 0.161661002486057],
[1.924584007972991, 1.075415992027006, 1, 0, 0.6415280026576643, 0.519592803357656, 0, -3.214088712597647, 1, 0.6415280026576643, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.001323779199262094, 2.998676220800737, 0, 1, 0.000441259733087365, 0, 0.3334804848430651, 2.062838159573007, 0.9995587402669126, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7185222562384046, 2.281477743761597, 0, 1, 0.2395074187461348, 0, 0.4383124063929046, 2.711305754959106, 0.7604925812538652, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.999873208686676, 1, 1, 0.3333474218524701, 0.9999999999999993, 0.5000316998379629, -3.092695779893842, 0.8888794963443112, 0.5555743400492517, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.926174485752164, 1.073825514247834, 0, 0, 0.6420581619173885, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.00035978461041, 1.999549496875568, 0, 1, 0.3334633453031922, 0, 0.5001126511559569, 3.093588703924379, 0.6665366546968078, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.009467149599337, 0, 0, 0.1965200685050679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9995159842712191, 2.000484015728783, 0, 1, 0.3331719947570728, 0, 0.4998790253446223, 3.092143545180205, 0.6668280052429272, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9996063120938434, 2.000393687906159, 0, 2, 0.3332021040312809, 0, 0.9998031947868369, 6.184566341985095, 0.4446194340683107, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258170586813748, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3164302620816037, 1.080126997686004, 0, -6.681432015610338, 1, 0.3164302620816037, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.999873154429919, 0, 1, 0.3333474278815084, 0, 0.5000317134038728, 3.09308804049387, 0.6666525721184916, 1, 0.161661002486057],
[0.9987987745219076, 2.001201225478094, 0, 1, 0.3329329248406356, 0, 0.4996998738900413, 3.091035353026093, 0.6670670751593644, 1, 0.161661002486057],
[0.9998732214431771, 2.000126778556825, 1, 1, 0.3332910738143922, 1.000126794631663, 0.4999683073697668, -3.093872236163043, 0.8889170601156493, 0.5554992077444337, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9924647695714394, 2.007535230428561, 3, 0, 0.3308215898571464, 3.022777323668067, 0, -18.69824680772208, 1, 0.03620608222070543, 0.161661002486057],
[1.000685067367774, 1.925132065681643, 0, 1, 0.3420190059263257, 0, 0.5194448826792171, 3.213173707270672, 0.6579809940736743, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281477752279516, 0, 1, 0.2393846524433899, 0, 0.438312404756461, 2.711305744836419, 0.7606153475566101, 1, 0.161661002486057],
[0.4918769349939024, 2.009935144632337, 0, 1, 0.1966082660642468, 0, 0.497528491240409, 3.07760364954634, 0.8033917339357531, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7184048346045631, 2.281595165395438, 1, 0, 0.2394682782015209, 1.391972815091699, 0, -8.610442801205284, 1, 0.2394682782015209, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.492202587832827, 2.348643367114803, 1, 1, 0.1732591614042306, 2.031683751202955, 0.4257777123601583, -9.933787457375836, 0.9699812629895029, 0.3164995857979639, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.001871763692634201, 2.998128236307365, 0, 2, 0.0006239212308780673, 0, 0.6670828738344073, 4.126430391843835, 0.9987525468159462, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.394170470994863, 0, 1, 0.3281568936370247, 0, 0.7172724001867663, 4.436891947695487, 0.6718431063629753, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.349084272059173, 0, 0, 0.1730242453517345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000242035034474, 0, 0.5, 0.2641516052194391, 0, 0.2499697492815576, 1.546258809715825, 0.8578160611579623, 1, 0.161661002486057],
[0.9995154624215039, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3332256409222162, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6667743590777837, 1, 0.161661002486057],
[0.9976606419624958, 2.002339358037506, 0, 2, 0.3325535473208318, 0, 0.9988316875318284, 6.178556808207199, 0.4454847671940051, 1, 0.161661002486057],
[0.9998730474722097, 2.000126952527792, 0, 1, 0.3332910158240697, 0, 0.4999682638825422, 3.092695555476737, 0.6667089841759303, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 1.582337666924497, 0, 0, 0.236995756849677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.500954996922673, 0, 0, 0.3998472588393079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -3.092891868235964, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.349084272059173, 0, 0, 0.1730242453517345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281235104413158, 0, 1.5, 0.2394040191940055, 0, 0.657538540020789, 4.067391206964095, 0.6633321382178251, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.926174485752164, 1.073825514247834, 0, 0, 0.6420581619173885, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 6.185783736471929, 0.4444444444444444, 1, 0.161661002486057],
[0.999863568203337, 2.000136431796665, 0, 4, 0.3332878560677788, 0, 1.999863577509518, 12.37072359292095, 0.1975847686943308, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3165137589237419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3165137589237419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9998731960610641, 2.000126803938938, 0, 1, 0.3332910653536878, 0, 0.499968301025043, 3.092695785232214, 0.6667089346463122, 1, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.005606710527464, 0, 0, 0.3159084610159388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7183955343137014, 2.2816044656863, 1, 0, 0.239465178104567, 1.391990835459913, 0, -8.61055427130591, 1, 0.239465178104567, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.926174485752164, 1.073825514247834, 0, 0, 0.6420581619173885, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7183955559163, 2.228746743722275, 1, 0, 0.2437600505426565, 1.391990793601888, 0, -8.610554012381217, 1, 0.2437600505426565, 0.161661002486057],
[0.4918769130794817, 2.009935118273651, 0, 1, 0.1966082610984346, 0, 0.4975284977650959, 3.077603689906643, 0.8033917389015655, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.349084272059173, 0, 0, 0.1730242453517345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.393433646735375, 1.326060406386852, 0, 1, 0.5123870909500927, 0, 0.7541134590728965, 4.664782770587715, 0.4876129090499073, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.3201971093071632, 2.679802890692836, 0, 1, 0.1067323697690544, 0, 0.3731617737532405, 2.308298031155814, 0.8932676302309456, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000117160903446, 1.999882839096555, 11, 0, 0.3333723869678153, 10.99871138103785, 0, -68.03564998297269, 0.9999999999999988, 5.652308677994711e-06, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.00068526809526, 1.998830485178681, 0, 1, 0.3336156067868696, 0, 0.5002925497759793, 3.094701517882327, 0.6663843932131304, 1, 0.161661002486057],
[0.4922025920443481, 2.009609863976501, 1, 1, 0.1967384049351165, 2.031683733818896, 0.4976090224901947, -9.489454399869954, 0.9612940000235863, 0.3547708098938189, 0.161661002486057],
[0.7181592071431043, 2.22895646845448, 0, 0.75, 0.2436820560148131, 0, 0.3364803263834206, 2.081394530585331, 0.8110139104535877, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6812465112434329, 2.159325608139076, 0, 1, 0.2398272188179908, 0, 0.4631075536874718, 2.864683173837265, 0.7601727811820091, 1, 0.161661002486057],
[0.9258170525618052, 2.074182947438194, 1, 0, 0.3086056841872685, 1.080127004825548, 0, -6.681432059774018, 1, 0.3086056841872685, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.001079461380931, 1.998648355958691, 0, 1, 0.3337234317041342, 0, 0.5003381395324693, 3.094983526256573, 0.6662765682958658, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.002055471001336, 1.923056443925805, 1, 1, 0.3425699597638455, 0.9979487452932305, 0.5200055376214333, -2.95645332097343, 0.8826458226673972, 0.5677857421950883, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 1.582337666924497, 0, 0, 0.236995756849677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9998732122874392, 2.000126787712563, 2, 1, 0.3332910707624795, 2.000253607579447, 0.4999683050811225, -9.280440424262006, 0.9629770487005316, 0.2592029109510634, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.009467149599337, 0, 0, 0.1965200685050679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.999873208686685, 0, 2, 0.333347421852469, 0, 1.000063399675921, 6.186175913156145, 0.4444256599507499, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926184114073304, 1, 0, 0.3417419960659897, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3417419960659897, 0.161661002486057],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -3.092891868235964, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.161661002486057],
[0.9941472287114343, 2.005852771288567, 1, 1, 0.3313824095704779, 1.005887227886911, 0.498541076550497, -3.13833357169842, 0.8901856986272639, 0.5529505177682199, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000484316309422, 0, 1, 0.2641280633907779, 0, 0.499878950235832, 3.092143080573472, 0.7358719366092221, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -12.37156747294386, 1, 0.111111111111111, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9985338521802842, 2.00119143539793, 0, 1, 0.3328750990349641, 0, 0.4997023184846648, 3.091050474759758, 0.667124900965036, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4922447194134794, 2.348604994223286, 0, 1, 0.1732737627937816, 0, 0.4257846689671682, 2.633811880536195, 0.8267262372062184, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000393458951608, 0, 1, 0.2641368912674085, 0, 0.4999016546095352, 3.092283524919072, 0.7358631087325915, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.9254595928369385, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3163467357754485, 2.161088409996514, 0, -13.36802553963442, 0.9999999999999999, 0.1000752572357815, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2.5, 0.3333333333333334, 0, 1.249999999999999, 7.73222967058991, 0.3628873693012115, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.924363842794529, 1.074667706320694, 2, 0, 0.6416617535624981, 1.039304499244609, 0, -6.42891286866941, 1, 0.4117298059849001, 0.161661002486057],
[0.9992128963796998, 2.000787103620302, 0, 2, 0.3330709654598998, 0, 0.999606603011946, 6.183350267781251, 0.4447943371125902, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.349084272059173, 0, 0, 0.1730242453517345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.920651445853904, 1.079348554146094, 0, 1, 0.6402171486179684, 0, 0.9264847728370108, 5.731034439904074, 0.3597828513820316, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258169121897826, 2.074183087810216, 1, 0, 0.3086056373965943, 1.080127168594011, 0, -6.68143307281031, 1, 0.3086056373965943, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9982824025148571, 2.001717597485145, 0, 1, 0.3327608008382855, 0, 0.4995709690799285, 3.090237975748145, 0.6672391991617145, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9985469158347338, 2.001453084165268, 0, 1, 0.332848971944911, 0, 0.4996369926987636, 3.090646383575757, 0.667151028055089, 1, 0.161661002486057],
[0.001323926207305664, 2.998676073792693, 0, 1, 0.0004413087357685549, 0, 0.3334805011917178, 2.062838260702237, 0.9995586912642315, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.322536149094354, 2.677463850905645, 0, 1, 0.107512049698118, 0, 0.3734877689055456, 2.310314566667112, 0.892487950301882, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -12.37156747294386, 1, 0.111111111111111, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.500954996922673, 0, 0, 0.3998472588393079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.068101641628032, 1.931898358371968, 1, 0, 0.3560338805426774, 0.9362404859482947, 0, -5.79138117140554, 1, 0.3560338805426774, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.227947489295086, 0, 1, 0.2437344101870152, 0, 0.4488436126995059, 2.77644951965591, 0.7562655898129848, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 6.185783736471929, 0.4444444444444444, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9263013528923789, 2.07369864710762, 0, 1, 0.3087671176307931, 0, 0.482230145346718, 2.982971390322224, 0.6912328823692069, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4917619254648939, 2.349083977061151, 0, 1, 0.1731040479976845, 0, 0.4256978506366816, 2.633274841119443, 0.8268959520023155, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6806470869960309, 2.159925032386478, 1, 0, 0.2396161964527033, 1.469190156110712, 0, -9.088092573454301, 1, 0.2396161964527033, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281477847975329, 0, 1, 0.2393846448061211, 0, 0.4383123863715961, 2.711305631111621, 0.7606153551938788, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258169121897826, 2.074183087810216, 1, 1, 0.3086056373965943, 1.080127168594011, 0.4821175169525334, -3.699158377377099, 0.9047625605670417, 0.5219738353602303, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.002056124746636, 1.923045821617489, 0, 1, 0.3425713507155478, 0, 0.5200084099706432, 3.216659565225034, 0.6574286492844522, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.005606710527464, 0, 0, 0.3159084610159388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.005688483866723561, 2.994311516133276, 0, 2, 0.001896161288907854, 0, 0.6679331756980026, 4.131690175282754, 0.9962112728498177, 1, 0.161661002486057],
[0.7198482417523049, 2.280151758247696, 1, 1, 0.2399494139174349, 1.389181694138379, 0.4385672999101179, -5.880295059473292, 0.9424242787606796, 0.4223231065955492, 0.161661002486057],
[0.718395513007035, 2.000000000000001, 1, 0, 0.264271887431259, 1.391990876744531, 0, -8.610554526683629, 1, 0.2642718874312591, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.349084272059173, 0, 0, 0.1730242453517345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.9940190319040093, 2.005980968095991, 1, 1, 0.3313396773013364, 1.006016955313757, 0.4985092161413505, -3.139333119106313, 0.8902140182458463, 0.552893372848519, 0.161661002486057],
[0.9914119808514226, 2.00858801914858, 1, 1, 0.3304706602838073, 1.008662412109648, 0.4978621750536429, -3.159699798967043, 0.8907891426915846, 0.5517304632591988, 0.161661002486057],
[0.7183954515684016, 2.281604548431599, 1, 0, 0.2394651505228005, 1.391990995790409, 0, -8.610555263075684, 1, 0.2394651505228005, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.000685490769438, 1.925131421420343, 0, 1, 0.342019176456428, 0, 0.5194450565157831, 3.213174782586075, 0.657980823543572, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9328788985779159, 2.08883756930871, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.6558006165491117, 2.365915851337518, 0, 0, 0.2170291698505303, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.6859018959867432, 1.402935673321968, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.321336926642133, 2.700379541244494, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.001131202601072, 2.020585265285557, 0, 2, 0.3313120914025589, 0, 0.9898122263686568, 6.167085977319855, 0.4471435191044197, 1, 0.1604991774087148],
[0.846656871861497, 2.014477645257753, 0, 0, 0.2959164858539955, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.6859018959867432, 1.833157070561454, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.9321587697085661, 2.08955769817806, 2, 0, 0.3084865107680052, 2.145557243027696, 0, -13.36802641401697, 1, 0.09516392732581846, 0.1604991774087148],
[0.9995408600155549, 2.000459139984447, 0, 0.75, 0.3331802866718514, 0, 0.3749139310117732, 2.319136497029386, 0.7379149733017808, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 4, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 1.999999999999999, 6.185783736471929, 0.4609053497942386, 0.8683127572016461, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0, 2.017024305353326, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8402467202620169, 2.000599182264049, 1, 0, 0.2957734242166651, 1.190126632911065, 0, -7.36186597020337, 1, 0.2957734242166652, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 3, 0, 0.3333333333333334, 2.999999999999998, 0, -18.55735120941578, 0.9999999999999999, 0.0370370370370372, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 1.582337666924497, 0, 0, 0.236995756849677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926301352900157, 1, 0, 0.3417283045742827, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3417283045742827, 0.161661002486057],
[0.4918768917898197, 2.348969005919995, 0, 1, 0.1731445173377242, 0, 0.4257186865725975, 2.633403727712965, 0.8268554826622758, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.500954996922673, 0, 0, 0.3998472588393079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.926174485752164, 1.073825514247834, 0, 0, 0.6420581619173885, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.001590641035507, 1.998409358964495, 0, 1, 0.3338635470118355, 0, 0.5003979767779735, 3.095353666516648, 0.6661364529881645, 1, 0.161661002486057],
[0.9996064837968568, 2.000393516203145, 0, 1, 0.3332021612656187, 0, 0.4999016403022811, 3.092283436417492, 0.6667978387343813, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.7183955343137014, 2.2816044656863, 1, 0, 0.239465178104567, 1.391990835459913, 0, -8.61055427130591, 1, 0.239465178104567, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 1.582337666924497, 0, 0, 0.236995756849677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7191100110275251, 2.03659888732744, 1, 1, 0.2609528210533419, 1.390607813359621, 0.4910147040845468, -5.564688424795975, 0.9319036251843026, 0.4538092672909863, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4964066006659755, 3.092891868235964, 0.6666666666666667, 1, 0.1604991774087148],
[0.6859018959867432, 1.833157070561454, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4964066006659755, 3.092891868235964, 0.6666666666666667, 1, 0.1604991774087148],
[0.9324896704912368, 2.089226797395389, 1, 0, 0.3085960183231273, 1.072397938170402, 0, -6.681641336014553, 1, 0.3085960183231273, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.7232357972073383, 2.245266964762827, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.7232357972073383, 2.29848067067929, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.9999999999999993, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.00157156940748, 1.996491285121017, 0, 3, 0.3340729057413296, 0, 1.502636160927772, 9.294982326101636, 0.2953112932824726, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.005606710527464, 0, 0, 0.3159084610159388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.0005480889926851618, 2.999451911007314, 0, 1, 0.000182696330895054, 0, 0.3333942432383146, 2.062304687656934, 0.9998173036691049, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9991220567153192, 2.000877943284682, 0, 2, 0.3330406855717729, 0, 0.9995612209692106, 6.183069544279371, 0.4448347271025707, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258170257213308, 2.074182974278668, 1, 0, 0.3086056752404437, 1.080127036139642, 0, -6.68143225347623, 1, 0.3086056752404438, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.349084272059173, 0, 0, 0.1730242453517345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6816375901650064, 1.392187924082828, 0, 1, 0.3286860854406224, 0, 0.7182938328234669, 4.44321030908749, 0.6713139145593776, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9987987744965079, 2.001201225503494, 0, 1, 0.3329329248321691, 0, 0.4996998738836992, 3.091035352986862, 0.6670670751678309, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6813935551160745, 1.820418477267742, 0, 1, 0.2723600119817228, 0, 0.5493242419187567, 3.398000961710819, 0.7276399880182772, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6510875095515912, 2.348912490448411, 0, 0, 0.2170291698505303, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.999873222765524, 0, 2, 0.3333474202880214, 0, 1.00006339263561, 6.186175869606298, 0.4444256620366359, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057]
],
"RESOLVED": [
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9928132013319511, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333333, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4964066006659755, 3.092891868235964, 0.6666666666666667, 1, 0.1604991774087148],
[0.7232357972073383, 2.245266964762827, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.9986490641418466, 2.000675467929078, 0, 2, 0.332957988861684, 0, 0.9996623800611815, 6.18369529254528, 0.4449450446234492, 1, 0.161661002486057],
[0.9251019503625982, 2.006758538494908, 1, 0, 0.3155340964818875, 1.080961941122322, 0, -6.686596795139589, 1, 0.3155340964818875, 0.161661002486057],
[0.7183953502934814, 2.28160464970652, 1, 0, 0.2394651167644937, 1.391991192024665, 0, -8.610556476938351, 1, 0.2394651167644937, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 1.582337666924497, 0, 0, 0.236995756849677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 6.185783736471929, 0.4444444444444444, 1, 0.161661002486057],
[0.9258169338297485, 2.005990696275682, 1, 0, 0.3157836565820163, 1.080127143347211, 0, -6.681432916639064, 1, 0.3157836565820163, 0.161661002486057],
[0.320197225719357, 2.679802774280642, 0, 1, 0.1067324085731191, 0, 0.3731617899636054, 2.308298131429625, 0.8932675914268809, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258168557921094, 2.074183144207889, 1, 0, 0.3086056185973699, 1.080127234391754, 0, -6.681433479820917, 1, 0.3086056185973699, 0.161661002486057],
[1.398685065519112, 1.319746512316107, 1, 0, 0.514519135564535, 0.7149572299385759, 0, -4.422570805227067, 1, 0.514519135564535, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.005606710527464, 0, 0, 0.3159084610159388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.925459650349436, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3163467492155951, 2.161088275696124, 0, -13.36802470888125, 0.9999999999999999, 0.1000752657392747, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.717259441121378, 2.279557489375638, 0, 1, 0.2393404261108542, 0, 0.4386816321416382, 2.713589705590709, 0.7606595738891457, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.92630129328856, 0, 1, 0.3417283115356199, 0, 0.5191295896878163, 3.211223373012241, 0.6582716884643801, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.208681884496655, 1.738577570540498, 0, 1, 0.4101036583090438, 0, 0.575182848867143, 3.557956712019966, 0.5898963416909562, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.001633758279812, 1.998249078639444, 1, 2, 0.333890959324413, 0.9983689065326454, 1.000876227783249, 0.01550974701409422, 0.7399969288193393, 0.7044465833050434, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9980318899120386, 2.001968110087963, 0, 1, 0.332677296637346, 0, 0.4995084561841804, 3.089851284494306, 0.667322703362654, 1, 0.161661002486057],
[0.9258170257213308, 2.005990597590552, 1, 0, 0.3157836886567245, 1.080127036139642, 0, -6.68143225347623, 1, 0.3157836886567245, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.280992528041677, 0, 1, 0.239423383370808, 0, 0.4384056447824229, 2.711882507472603, 0.760576616629192, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.001590641035507, 1.998155809063486, 0, 3, 0.3338917664199433, 0, 1.501384419769581, 9.287239326003025, 0.2955523423683614, 1, 0.161661002486057],
[0.999031455227712, 2.000787068336949, 0, 2, 0.3330306308131502, 0, 0.999606620639745, 6.183350376823004, 0.4448481394335043, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7179742621854597, 2.281166947640609, 0, 1, 0.2393932835950387, 0, 0.4383721239843016, 2.71167515506475, 0.7606067164049612, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.6813935267442207, 1.394022447065402, 0, 1, 0.3283166051254093, 0, 0.717348563579539, 4.437363077971814, 0.6716833948745907, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9254594241540378, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3163466963557885, 2.161088803896723, 0, -13.36802797621593, 0.9999999999999998, 0.1000752322952216, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.500954996922673, 0, 0, 0.3998472588393079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6806470183758283, 2.159925101006681, 1, 0, 0.2396161722955265, 1.469190304228787, 0, -9.088093489680681, 1, 0.2396161722955266, 0.161661002486057],
[1.001370697449137, 1.924215613633614, 0, 3, 0.3422803469019967, 0, 1.559076840840573, 9.644112165981657, 0.2845263267750551, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.003262486758875, 1.996737513241126, 1, 2, 0.3344208289196248, 0.9967481224485779, 1.001633908682157, 0.03022241702355242, 0.7392895665512812, 0.7051513338115817, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 3, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 1.499999999999999, 3.092891868235965, 0.5925925925925926, 0.8024691358024691, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7185369360148699, 2.281463063985131, 0, 1, 0.2395123120049566, 0, 0.4383152266569051, 2.711323200502293, 0.7604876879950434, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.500954996922673, 0, 0, 0.3998472588393079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9995157994227988, 2.000393475814389, 0, 1, 0.333182009093849, 0, 0.4999016503954981, 3.09228349885195, 0.6668179909061509, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7183954515684015, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2642718708030197, 1.39199099579041, 0, -8.610555263075685, 1, 0.2642718708030197, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7183953225641418, 2.281604677435859, 1, 0, 0.2394651075213805, 1.39199124575413, 0, -8.610556809297202, 1, 0.2394651075213805, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9264184296252966, 2.073581570374702, 0, 2, 0.3088061432084324, 0, 0.9645147451993386, 5.966279624441438, 0.4777489476664021, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7183955559163, 2.281604444083701, 1, 0, 0.2394651853054333, 1.391990793601888, 0, -8.610554012381217, 1, 0.2394651853054333, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258169121897579, 2.074183087810241, 1, 0, 0.3086056373965861, 1.08012716859404, 0, -6.681433072810488, 1, 0.3086056373965861, 0.161661002486057],
[0, 2.017024305353326, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9988304765991052, 2.001169523400896, 0, 1, 0.3329434921997015, 0, 0.4997077900229789, 3.091084320512474, 0.6670565078002985, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258168557921094, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3164302146798117, 1.080127234391754, 0, -6.681433479820917, 1, 0.3164302146798117, 0.161661002486057],
[0.7720496845915841, 2.227950315408417, 0, 1, 0.2573498948638613, 0, 0.4488430433497728, 2.776445997781591, 0.7426501051361387, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9254593358345707, 2.074540664165428, 1, 1, 0.3084864452781904, 1.08054450506808, 0.4820344171958144, -3.702253967674646, 0.9048361130796261, 0.5218090036360068, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9988175642971988, 2.001182435702803, 0, 1, 0.3329391880990661, 0, 0.4997045657403076, 3.091064375797164, 0.6670608119009339, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4917619519252438, 2.349083977032671, 0, 1, 0.1731040557013357, 0, 0.4256978506418428, 2.633274841151369, 0.8268959442986643, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.001591692076586, 1.998408307923416, 1, 0, 0.3338638973588617, 0.9984108373809634, 0, -6.175953520188487, 1, 0.3338638973588617, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.9995958168181889, 2.000404183181813, 0, 1, 0.3331986056060627, 0, 0.4998989746209264, 3.092266947089122, 0.6668013943939373, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.009467149599337, 0, 0, 0.1965200685050679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.009467149599337, 0, 0, 0.1965200685050679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7183954867277682, 2.281604513272233, 1, 0, 0.2394651622425893, 1.391990927664255, 0, -8.610554841662026, 1, 0.2394651622425893, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.924943804529305, 1.074965469761577, 1, 0, 0.6416673400845839, 0.5194956848335239, 0, -3.213487958410561, 1, 0.6416673400845839, 0.161661002486057],
[0.999515662087483, 2.000484337912519, 0, 1, 0.3331718873624941, 0, 0.4998789448376726, 3.092143047181626, 0.6668281126375059, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9996064837968568, 2.000393516203145, 1, 1, 0.3332021612656187, 1.000393671119107, 0.4999016403022811, -3.095935464460532, 0.8889763197279206, 0.5553806422591581, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9995153600007178, 2.000393832901863, 1, 1, 0.3331818717598016, 1.000484874989096, 0.4999015611587614, -3.096500121440912, 0.8889898403306351, 0.5553535838502384, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.926174485752164, 1.073825514247834, 0, 0, 0.6420581619173885, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258169181938307, 2.074183081806168, 1, 0, 0.3086056393979437, 1.08012716158924, 0, -6.681433029480312, 1, 0.3086056393979437, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281477548777291, 0, 1, 0.2393846686844487, 0, 0.4383124438528569, 2.71130598667827, 0.7606153313155513, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0, 2.017024305353326, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9985464529901482, 2.001453547009854, 0, 2, 0.3328488176633825, 0, 0.9992737543111979, 6.181291337701458, 0.4450907000931466, 1, 0.161661002486057],
[0.9995157028588677, 2.000484297141134, 0, 1, 0.3331719009529557, 0, 0.499878955025584, 3.092143110201842, 0.6668280990470443, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9970935924479285, 2.002906407552073, 0, 2, 0.3323645308159759, 0, 0.9985489049607538, 6.176807576378088, 0.445737119712572, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.068218803720369, 1.005606710527463, 0, 0, 0.515095795852337, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000706901866805, 1.998793563838496, 0, 1, 0.3336245195852969, 0, 0.5003017910862159, 3.094758682628893, 0.6663754804147031, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.500954996922673, 0, 0, 0.3998472588393079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.009467149599337, 0, 0, 0.1965200685050679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258168557921095, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3164302146798117, 1.080127234391753, 0, -6.681433479820915, 1, 0.3164302146798117, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6812465686990332, 2.159325550683476, 0, 1, 0.2398272390447613, 0, 0.4631075660098947, 2.864683250061108, 0.7601727609552387, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258170586813748, 2.073802668143343, 1, 1, 0.3086448093410191, 1.080126997686004, 0.4822059568933293, -3.698610249829696, 0.9047383816668459, 0.5220280003488842, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9985475571731641, 2.001180298312415, 0, 2, 0.3328793828237211, 0, 0.9994101989144053, 6.182135354508907, 0.4450499178616593, 1, 0.161661002486057],
[0.7183954925817718, 2.281120379624205, 1, 1, 0.2395038143450236, 1.391990916321311, 0.4383810731482489, -5.898824258839476, 0.9426379229141844, 0.4216455516042318, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 6.185783736471929, 0.4444444444444444, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9996064413035204, 2.000393558696481, 0, 1, 0.3332021471011732, 0, 0.4999016296831265, 3.092283370729699, 0.6667978528988268, 1, 0.161661002486057],
[0.9258169243734061, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3164302307027221, 1.080127154379686, 0, -6.681432984883569, 1, 0.316430230702722, 0.161661002486057],
[1.068218803720369, 1.005606710527463, 0, 0, 0.515095795852337, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.998798774940163, 2.001201225059839, 0, 1, 0.3329329249800541, 0, 0.4996998739944798, 3.091035353672127, 0.6670670750199459, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9239374820774798, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3159908471849456, 2.164648624821439, 0, -13.39004825859679, 1, 0.09985021550465945, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7185225598599145, 2.281477440140086, 0, 1, 0.2395075199533048, 0, 0.4383124647239985, 2.711306115782637, 0.7604924800466952, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000484070068947, 0, 1, 0.2641280873151813, 0, 0.4998790117661545, 3.09214346118674, 0.7358719126848188, 1, 0.161661002486057],
[0.7181288836469201, 2.281871116353081, 0, 1, 0.2393762945489732, 0, 0.4382368455577869, 2.71083835197412, 0.7606237054510268, 1, 0.161661002486057],
[1.000359809392763, 1.999549465844425, 0, 1, 0.3334633542588282, 0, 0.5001126589172389, 3.093588751933991, 0.6665366457411718, 1, 0.161661002486057],
[1.924584007972991, 1.075415992027006, 1, 0, 0.6415280026576643, 0.519592803357656, 0, -3.214088712597647, 1, 0.6415280026576643, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.001323779199262094, 2.998676220800737, 0, 1, 0.000441259733087365, 0, 0.3334804848430651, 2.062838159573007, 0.9995587402669126, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7185222562384046, 2.281477743761597, 0, 1, 0.2395074187461348, 0, 0.4383124063929046, 2.711305754959106, 0.7604925812538652, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.999873208686676, 1, 1, 0.3333474218524701, 0.9999999999999993, 0.5000316998379629, -3.092695779893842, 0.8888794963443112, 0.5555743400492517, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.926174485752164, 1.073825514247834, 0, 0, 0.6420581619173885, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.00035978461041, 1.999549496875568, 0, 1, 0.3334633453031922, 0, 0.5001126511559569, 3.093588703924379, 0.6665366546968078, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.009467149599337, 0, 0, 0.1965200685050679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9995159842712191, 2.000484015728783, 0, 1, 0.3331719947570728, 0, 0.4998790253446223, 3.092143545180205, 0.6668280052429272, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9996063120938434, 2.000393687906159, 0, 2, 0.3332021040312809, 0, 0.9998031947868369, 6.184566341985095, 0.4446194340683107, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258170586813748, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3164302620816037, 1.080126997686004, 0, -6.681432015610338, 1, 0.3164302620816037, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.999873154429919, 0, 1, 0.3333474278815084, 0, 0.5000317134038728, 3.09308804049387, 0.6666525721184916, 1, 0.161661002486057],
[0.9987987745219076, 2.001201225478094, 0, 1, 0.3329329248406356, 0, 0.4996998738900413, 3.091035353026093, 0.6670670751593644, 1, 0.161661002486057],
[0.9998732214431771, 2.000126778556825, 1, 1, 0.3332910738143922, 1.000126794631663, 0.4999683073697668, -3.093872236163043, 0.8889170601156493, 0.5554992077444337, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9924647695714394, 2.007535230428561, 3, 0, 0.3308215898571464, 3.022777323668067, 0, -18.69824680772208, 1, 0.03620608222070543, 0.161661002486057],
[1.000685067367774, 1.925132065681643, 0, 1, 0.3420190059263257, 0, 0.5194448826792171, 3.213173707270672, 0.6579809940736743, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281477752279516, 0, 1, 0.2393846524433899, 0, 0.438312404756461, 2.711305744836419, 0.7606153475566101, 1, 0.161661002486057],
[0.4918769349939024, 2.009935144632337, 0, 1, 0.1966082660642468, 0, 0.497528491240409, 3.07760364954634, 0.8033917339357531, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7184048346045631, 2.281595165395438, 1, 0, 0.2394682782015209, 1.391972815091699, 0, -8.610442801205284, 1, 0.2394682782015209, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.492202587832827, 2.348643367114803, 1, 1, 0.1732591614042306, 2.031683751202955, 0.4257777123601583, -9.933787457375836, 0.9699812629895029, 0.3164995857979639, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.001871763692634201, 2.998128236307365, 0, 2, 0.0006239212308780673, 0, 0.6670828738344073, 4.126430391843835, 0.9987525468159462, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.394170470994863, 0, 1, 0.3281568936370247, 0, 0.7172724001867663, 4.436891947695487, 0.6718431063629753, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.349084272059173, 0, 0, 0.1730242453517345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9995154624215039, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3332256409222162, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6667743590777837, 1, 0.161661002486057],
[0.9976606419624958, 2.002339358037506, 0, 2, 0.3325535473208318, 0, 0.9988316875318284, 6.178556808207199, 0.4454847671940051, 1, 0.161661002486057],
[0.9998730474722097, 2.000126952527792, 0, 1, 0.3332910158240697, 0, 0.4999682638825422, 3.092695555476737, 0.6667089841759303, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 1.582337666924497, 0, 0, 0.236995756849677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.500954996922673, 0, 0, 0.3998472588393079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -3.092891868235964, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.349084272059173, 0, 0, 0.1730242453517345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281477659151605, 0, 1, 0.2393846598757206, 0, 0.4383124226479876, 2.711305855509534, 0.7606153401242794, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.926174485752164, 1.073825514247834, 0, 0, 0.6420581619173885, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 6.185783736471929, 0.4444444444444444, 1, 0.161661002486057],
[0.999863568203337, 2.000136431796665, 0, 4, 0.3332878560677788, 0, 1.999863577509518, 12.37072359292095, 0.1975847686943308, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3165137589237419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3165137589237419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9998731960610641, 2.000126803938938, 0, 1, 0.3332910653536878, 0, 0.499968301025043, 3.092695785232214, 0.6667089346463122, 1, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.005606710527464, 0, 0, 0.3159084610159388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7183955343137014, 2.2816044656863, 1, 0, 0.239465178104567, 1.391990835459913, 0, -8.61055427130591, 1, 0.239465178104567, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.926174485752164, 1.073825514247834, 0, 0, 0.6420581619173885, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7183955559163, 2.228746743722275, 1, 0, 0.2437600505426565, 1.391990793601888, 0, -8.610554012381217, 1, 0.2437600505426565, 0.161661002486057],
[0.4918769130794817, 2.009935118273651, 0, 1, 0.1966082610984346, 0, 0.4975284977650959, 3.077603689906643, 0.8033917389015655, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.349084272059173, 0, 0, 0.1730242453517345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.393433646735375, 1.326060406386852, 0, 1, 0.5123870909500927, 0, 0.7541134590728965, 4.664782770587715, 0.4876129090499073, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.3201971093071632, 2.679802890692836, 0, 1, 0.1067323697690544, 0, 0.3731617737532405, 2.308298031155814, 0.8932676302309456, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000117160903446, 1.999882839096555, 11, 0, 0.3333723869678153, 10.99871138103785, 0, -68.03564998297269, 0.9999999999999988, 5.652308677994711e-06, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.00068526809526, 1.998830485178681, 0, 1, 0.3336156067868696, 0, 0.5002925497759793, 3.094701517882327, 0.6663843932131304, 1, 0.161661002486057],
[0.4922025920443481, 2.009609863976501, 1, 1, 0.1967384049351165, 2.031683733818896, 0.4976090224901947, -9.489454399869954, 0.9612940000235863, 0.3547708098938189, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6812465112434329, 2.159325608139076, 0, 1, 0.2398272188179908, 0, 0.4631075536874718, 2.864683173837265, 0.7601727811820091, 1, 0.161661002486057],
[0.9258170525618052, 2.074182947438194, 1, 0, 0.3086056841872685, 1.080127004825548, 0, -6.681432059774018, 1, 0.3086056841872685, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.001079461380931, 1.998648355958691, 0, 1, 0.3337234317041342, 0, 0.5003381395324693, 3.094983526256573, 0.6662765682958658, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.002055471001336, 1.923056443925805, 1, 1, 0.3425699597638455, 0.9979487452932305, 0.5200055376214333, -2.95645332097343, 0.8826458226673972, 0.5677857421950883, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 1.582337666924497, 0, 0, 0.236995756849677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9998732122874392, 2.000126787712563, 2, 1, 0.3332910707624795, 2.000253607579447, 0.4999683050811225, -9.280440424262006, 0.9629770487005316, 0.2592029109510634, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.009467149599337, 0, 0, 0.1965200685050679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.999873208686685, 0, 2, 0.333347421852469, 0, 1.000063399675921, 6.186175913156145, 0.4444256599507499, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926184114073304, 1, 0, 0.3417419960659897, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3417419960659897, 0.161661002486057],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -3.092891868235964, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.161661002486057],
[0.9941472287114343, 2.005852771288567, 1, 1, 0.3313824095704779, 1.005887227886911, 0.498541076550497, -3.13833357169842, 0.8901856986272639, 0.5529505177682199, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000484316309422, 0, 1, 0.2641280633907779, 0, 0.499878950235832, 3.092143080573472, 0.7358719366092221, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -12.37156747294386, 1, 0.111111111111111, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9985338521802842, 2.00119143539793, 0, 1, 0.3328750990349641, 0, 0.4997023184846648, 3.091050474759758, 0.667124900965036, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4922447194134794, 2.348604994223286, 0, 1, 0.1732737627937816, 0, 0.4257846689671682, 2.633811880536195, 0.8267262372062184, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000393458951608, 0, 1, 0.2641368912674085, 0, 0.4999016546095352, 3.092283524919072, 0.7358631087325915, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.9254595928369385, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3163467357754485, 2.161088409996514, 0, -13.36802553963442, 0.9999999999999999, 0.1000752572357815, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 6.185783736471929, 0.4444444444444444, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.924363842794529, 1.074667706320694, 2, 0, 0.6416617535624981, 1.039304499244609, 0, -6.42891286866941, 1, 0.4117298059849001, 0.161661002486057],
[0.9992128963796998, 2.000787103620302, 0, 2, 0.3330709654598998, 0, 0.999606603011946, 6.183350267781251, 0.4447943371125902, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.349084272059173, 0, 0, 0.1730242453517345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.920651445853904, 1.079348554146094, 0, 1, 0.6402171486179684, 0, 0.9264847728370108, 5.731034439904074, 0.3597828513820316, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258169121897826, 2.074183087810216, 1, 0, 0.3086056373965943, 1.080127168594011, 0, -6.68143307281031, 1, 0.3086056373965943, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9982824025148571, 2.001717597485145, 0, 1, 0.3327608008382855, 0, 0.4995709690799285, 3.090237975748145, 0.6672391991617145, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9985469158347338, 2.001453084165268, 0, 1, 0.332848971944911, 0, 0.4996369926987636, 3.090646383575757, 0.667151028055089, 1, 0.161661002486057],
[0.001323926207305664, 2.998676073792693, 0, 1, 0.0004413087357685549, 0, 0.3334805011917178, 2.062838260702237, 0.9995586912642315, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.322536149094354, 2.677463850905645, 0, 1, 0.107512049698118, 0, 0.3734877689055456, 2.310314566667112, 0.892487950301882, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -12.37156747294386, 1, 0.111111111111111, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.500954996922673, 0, 0, 0.3998472588393079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.068101641628032, 1.931898358371968, 1, 0, 0.3560338805426774, 0.9362404859482947, 0, -5.79138117140554, 1, 0.3560338805426774, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.227947489295086, 0, 1, 0.2437344101870152, 0, 0.4488436126995059, 2.77644951965591, 0.7562655898129848, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 6.185783736471929, 0.4444444444444444, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9263013528923789, 2.07369864710762, 0, 1, 0.3087671176307931, 0, 0.482230145346718, 2.982971390322224, 0.6912328823692069, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4917619254648939, 2.349083977061151, 0, 1, 0.1731040479976845, 0, 0.4256978506366816, 2.633274841119443, 0.8268959520023155, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6806470869960309, 2.159925032386478, 1, 0, 0.2396161964527033, 1.469190156110712, 0, -9.088092573454301, 1, 0.2396161964527033, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281477847975329, 0, 1, 0.2393846448061211, 0, 0.4383123863715961, 2.711305631111621, 0.7606153551938788, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258169121897826, 2.074183087810216, 1, 1, 0.3086056373965943, 1.080127168594011, 0.4821175169525334, -3.699158377377099, 0.9047625605670417, 0.5219738353602303, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.002056124746636, 1.923045821617489, 0, 1, 0.3425713507155478, 0, 0.5200084099706432, 3.216659565225034, 0.6574286492844522, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.005606710527464, 0, 0, 0.3159084610159388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.005688483866723561, 2.994311516133276, 0, 2, 0.001896161288907854, 0, 0.6679331756980026, 4.131690175282754, 0.9962112728498177, 1, 0.161661002486057],
[0.7198482417523049, 2.280151758247696, 1, 1, 0.2399494139174349, 1.389181694138379, 0.4385672999101179, -5.880295059473292, 0.9424242787606796, 0.4223231065955492, 0.161661002486057],
[0.718395513007035, 2.000000000000001, 1, 0, 0.264271887431259, 1.391990876744531, 0, -8.610554526683629, 1, 0.2642718874312591, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.349084272059173, 0, 0, 0.1730242453517345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.9940190319040093, 2.005980968095991, 1, 1, 0.3313396773013364, 1.006016955313757, 0.4985092161413505, -3.139333119106313, 0.8902140182458463, 0.552893372848519, 0.161661002486057],
[0.9914119808514226, 2.00858801914858, 1, 1, 0.3304706602838073, 1.008662412109648, 0.4978621750536429, -3.159699798967043, 0.8907891426915846, 0.5517304632591988, 0.161661002486057],
[0.7183954515684016, 2.281604548431599, 1, 0, 0.2394651505228005, 1.391990995790409, 0, -8.610555263075684, 1, 0.2394651505228005, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.000685490769438, 1.925131421420343, 0, 1, 0.342019176456428, 0, 0.5194450565157831, 3.213174782586075, 0.657980823543572, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9328788985779159, 2.08883756930871, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.6558006165491117, 2.365915851337518, 0, 0, 0.2170291698505303, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.6859018959867432, 1.402935673321968, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.321336926642133, 2.700379541244494, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.001131202601072, 2.020585265285557, 0, 2, 0.3313120914025589, 0, 0.9898122263686568, 6.167085977319855, 0.4471435191044197, 1, 0.1604991774087148],
[0.846656871861497, 2.014477645257753, 0, 0, 0.2959164858539955, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.6859018959867432, 1.833157070561454, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.9321587697085661, 2.08955769817806, 2, 0, 0.3084865107680052, 2.145557243027696, 0, -13.36802641401697, 1, 0.09516392732581846, 0.1604991774087148],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 4, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 1.999999999999999, 6.185783736471929, 0.4609053497942386, 0.8683127572016461, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[0, 2.017024305353326, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8402467202620169, 2.000599182264049, 1, 0, 0.2957734242166651, 1.190126632911065, 0, -7.36186597020337, 1, 0.2957734242166652, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 3.092891868235964, 0.6666666666666666, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 3, 0, 0.3333333333333334, 2.999999999999998, 0, -18.55735120941578, 0.9999999999999999, 0.0370370370370372, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 1.582337666924497, 0, 0, 0.236995756849677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926301352900157, 1, 0, 0.3417283045742827, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3417283045742827, 0.161661002486057],
[0.4918768917898197, 2.348969005919995, 0, 1, 0.1731445173377242, 0, 0.4257186865725975, 2.633403727712965, 0.8268554826622758, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.500954996922673, 0, 0, 0.3998472588393079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.926174485752164, 1.073825514247834, 0, 0, 0.6420581619173885, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.001590641035507, 1.998409358964495, 0, 1, 0.3338635470118355, 0, 0.5003979767779735, 3.095353666516648, 0.6661364529881645, 1, 0.161661002486057],
[0.9996064837968568, 2.000393516203145, 0, 1, 0.3332021612656187, 0, 0.4999016403022811, 3.092283436417492, 0.6667978387343813, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.7183955343137014, 2.2816044656863, 1, 0, 0.239465178104567, 1.391990835459913, 0, -8.61055427130591, 1, 0.239465178104567, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 1.582337666924497, 0, 0, 0.236995756849677, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.926174485752164, 0, 0, 0.3417431205381293, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.81998253976842, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7191100110275251, 2.03659888732744, 1, 1, 0.2609528210533419, 1.390607813359621, 0.4910147040845468, -5.564688424795975, 0.9319036251843026, 0.4538092672909863, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4964066006659755, 3.092891868235964, 0.6666666666666667, 1, 0.1604991774087148],
[0.6859018959867432, 1.833157070561454, 0, 0, 0.2722849703381963, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4964066006659755, 3.092891868235964, 0.6666666666666667, 1, 0.1604991774087148],
[0.9324896704912368, 2.089226797395389, 1, 0, 0.3085960183231273, 1.072397938170402, 0, -6.681641336014553, 1, 0.3085960183231273, 0.1604991774087148],
[1.007238822628876, 2.014477645257753, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.7232357972073383, 2.245266964762827, 0, 0, 0.2436365586290828, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[0.7232357972073383, 2.29848067067929, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1604991774087148],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.9999999999999993, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 2.159599662228255, 0, 0, 0.2397307403349032, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.00157156940748, 1.996491285121017, 0, 3, 0.3340729057413296, 0, 1.502636160927772, 9.294982326101636, 0.2953112932824726, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.005606710527464, 0, 0, 0.3159084610159388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.3190275428457465, 2.680972457154252, 0, 0, 0.1063425142819155, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.0005480889926851618, 2.999451911007314, 0, 1, 0.000182696330895054, 0, 0.3333942432383146, 2.062304687656934, 0.9998173036691049, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.8405721193825089, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2959164858539956, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9261744857521658, 2.073825514247833, 0, 0, 0.3087248285840554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9991220567153192, 2.000877943284682, 0, 2, 0.3330406855717729, 0, 0.9995612209692106, 6.183069544279371, 0.4448347271025707, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2641751273121275, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9258170257213308, 2.074182974278668, 1, 0, 0.3086056752404437, 1.080127036139642, 0, -6.68143225347623, 1, 0.3086056752404438, 0.161661002486057],
[0.4914878473233356, 2.349084272059173, 0, 0, 0.1730242453517345, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.209525894466619, 1.73764283580772, 0, 0, 0.4104026627460959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6816375901650064, 1.392187924082828, 0, 1, 0.3286860854406224, 0, 0.7182938328234669, 4.44321030908749, 0.6713139145593776, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.9987987744965079, 2.001201225503494, 0, 1, 0.3329329248321691, 0, 0.4996998738836992, 3.091035352986862, 0.6670670751678309, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6813935551160745, 1.820418477267742, 0, 1, 0.2723600119817228, 0, 0.5493242419187567, 3.398000961710819, 0.7276399880182772, 1, 0.161661002486057],
[0.7708693168689446, 2.229130683131056, 0, 0, 0.2569564389563148, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -6.185783736471929, 1, 0.3333333333333334, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6510875095515912, 2.348912490448411, 0, 0, 0.2170291698505303, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.7180380471432837, 2.281961952856717, 0, 0, 0.2393460157144278, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 1.999873222765524, 0, 2, 0.3333474202880214, 0, 1.00006339263561, 6.186175869606298, 0.4444256620366359, 1, 0.161661002486057],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[1.399010504297538, 1.319027542845746, 0, 0, 0.514713363106866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057],
[0.6809724571542538, 1.39285305709358, 0, 0, 0.3283653578740153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.161661002486057]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node107":{
"Global MG94xREV":0.000555229139139137,
"Nucleotide GTR":0.0005547727874964729,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "S", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "TCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node135":{
"Global MG94xREV":0.0005553037408654969,
"Nucleotide GTR":0.0005548473279064896,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node156":{
"Global MG94xREV":0.0005552563168292258,
"Nucleotide GTR":0.000554799942848787,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node176":{
"Global MG94xREV":0.0005552788991380316,
"Nucleotide GTR":0.0005548225065968341,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node19":{
"Global MG94xREV":0.000555375099770694,
"Nucleotide GTR":0.0005549186281606699,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node196":{
"Global MG94xREV":0.0005554394478576918,
"Nucleotide GTR":0.0005549829233589533,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node231":{
"Global MG94xREV":0.0005372485293208104,
"Nucleotide GTR":0.0005368069562267646,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "L", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "TTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node25":{
"Global MG94xREV":0.0005554144552007741,
"Nucleotide GTR":0.0005549579512438971,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node274":{
"Global MG94xREV":0.000380610396711027,
"Nucleotide GTR":0.0003802975669845049,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node275":{
"Global MG94xREV":0.000174579634679233,
"Nucleotide GTR":0.0001744361449063707,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node284":{
"Global MG94xREV":0.0005555949571903236,
"Nucleotide GTR":0.0005551383048759965,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node288":{
"Global MG94xREV":0.0005553331225921431,
"Nucleotide GTR":0.0005548766854838283,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node292":{
"Global MG94xREV":0.0005553292492161137,
"Nucleotide GTR":0.0005548728152913883,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node307":{
"Global MG94xREV":0.0005551497694513415,
"Nucleotide GTR":0.0005546934830438829,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node314":{
"Global MG94xREV":0.0005552526613488651,
"Nucleotide GTR":0.0005547962903729233,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node338":{
"Global MG94xREV":0.0005553737473514735,
"Nucleotide GTR":0.0005549172768530244,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "I", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "ATA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node344":{
"Global MG94xREV":0.0005321283562953527,
"Nucleotide GTR":0.0005316909915527898,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "V", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GTT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node347":{
"Global MG94xREV":0.0005099961398379464,
"Nucleotide GTR":0.000509576965915396,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAT", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node360":{
"Global MG94xREV":0.0005551938589003094,
"Nucleotide GTR":0.000554737536255033,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node364":{
"Global MG94xREV":0.0005550418593143525,
"Nucleotide GTR":0.0005545856615999499,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node371":{
"Global MG94xREV":0.000542818013319526,
"Nucleotide GTR":0.0005423718625781758,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node372":{
"Global MG94xREV":1.232603458281302e-05,
"Nucleotide GTR":1.231590361933708e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node435":{
"Global MG94xREV":0.0005550272472254669,
"Nucleotide GTR":0.000554571061520972,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node435_1":{
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node448":{
"Global MG94xREV":0.0005552103335905571,
"Nucleotide GTR":0.0005547539974044717,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node464":{
"Global MG94xREV":0.0005554383257923608,
"Nucleotide GTR":0.0005549818022158661,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node466":{
"Global MG94xREV":0.0005549763614122695,
"Nucleotide GTR":0.0005545202175316322,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node49":{
"Global MG94xREV":0.000555439447894309,
"Nucleotide GTR":0.000554982923395541,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node506":{
"Global MG94xREV":0.001110739464870277,
"Nucleotide GTR":0.001109826530473226,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node517":{
"Global MG94xREV":0.0005552601107507376,
"Nucleotide GTR":0.0005548037336520148,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node523":{
"Global MG94xREV":0.0005552823785098003,
"Nucleotide GTR":0.0005548259831088517,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node530":{
"Global MG94xREV":0.0005553219589401747,
"Nucleotide GTR":0.0005548655310074431,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node543":{
"Global MG94xREV":0.0005265380070022337,
"Nucleotide GTR":0.00052610523705649,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node548":{
"Global MG94xREV":0.0005554440366393998,
"Nucleotide GTR":0.0005549875083690692,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node549":{
"Global MG94xREV":0.0005552814325140342,
"Nucleotide GTR":0.0005548250378906157,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node555":{
"Global MG94xREV":0.000555279253928462,
"Nucleotide GTR":0.0005548228610956565,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node558":{
"Global MG94xREV":0.0005552049972632414,
"Nucleotide GTR":0.000554748665463169,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node561":{
"Global MG94xREV":0.0005551669457454335,
"Nucleotide GTR":0.0005547106452205068,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node564":{
"Global MG94xREV":0.0005553023052221657,
"Nucleotide GTR":0.0005548458934431366,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node567":{
"Global MG94xREV":0.0005551394081468119,
"Nucleotide GTR":0.0005546831302554749,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node568":{
"Global MG94xREV":0.0005556585856730084,
"Nucleotide GTR":0.0005552018810614205,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node573":{
"Global MG94xREV":0.0005556663208343013,
"Nucleotide GTR":0.0005552096098650627,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node577":{
"Global MG94xREV":0.0004125006993273388,
"Nucleotide GTR":0.0004121616584548982,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node578":{
"Global MG94xREV":0.0001426393570631964,
"Nucleotide GTR":0.0001425221195114977,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node584":{
"Global MG94xREV":0.0004281127550575181,
"Nucleotide GTR":0.0004277608823886616,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node585":{
"Global MG94xREV":0.0001269322550430629,
"Nucleotide GTR":0.0001268279274078351,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node591":{
"Global MG94xREV":0.0005375784687471618,
"Nucleotide GTR":0.0005371366244706631,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTT", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node594":{
"Global MG94xREV":0.0005399594867289066,
"Nucleotide GTR":0.0005395156854559351,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node597":{
"Global MG94xREV":0.0005407075402964407,
"Nucleotide GTR":0.0005402631241863682,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACG", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node602":{
"Global MG94xREV":0.0005550825292610723,
"Nucleotide GTR":0.0005546262981193945,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node607":{
"Global MG94xREV":0.0005399594867289066,
"Nucleotide GTR":0.0005395156854559351,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "I", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ATA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node610":{
"Global MG94xREV":0.0005399594867289066,
"Nucleotide GTR":0.0005395156854559351,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCT", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node613":{
"Global MG94xREV":0.0005399594867289066,
"Nucleotide GTR":0.0005395156854559351,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "I", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ATA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node616":{
"Global MG94xREV":0.0005399594867289066,
"Nucleotide GTR":0.0005395156854559351,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "I", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ATT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node619":{
"Global MG94xREV":0.0005379311051909743,
"Nucleotide GTR":0.0005374889710769859,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "G", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "GGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node622":{
"Global MG94xREV":0.0005399594867289066,
"Nucleotide GTR":0.0005395156854559351,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "L", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CTG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node625":{
"Global MG94xREV":0.0005399594867289066,
"Nucleotide GTR":0.0005395156854559351,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "I", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ATA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node628":{
"Global MG94xREV":0.0005402917523541213,
"Nucleotide GTR":0.0005398476779867589,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAC", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node631":{
"Global MG94xREV":0.0005399594867289066,
"Nucleotide GTR":0.0005395156854559351,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "V", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GTA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node634":{
"Global MG94xREV":0.0005552819443426082,
"Nucleotide GTR":0.0005548255492985091,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node640":{
"Global MG94xREV":0.0004023178510666491,
"Nucleotide GTR":0.0004019871796388279,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "V", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GTT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node643":{
"Global MG94xREV":0.0005552567176859989,
"Nucleotide GTR":0.0005548003433760894,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node655":{
"Global MG94xREV":0.0005552819443061564,
"Nucleotide GTR":0.0005548255492620872,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node681":{
"Global MG94xREV":0.0005553725583598469,
"Nucleotide GTR":0.0005549160888386488,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node682":{
"Global MG94xREV":0.000555475627823232,
"Nucleotide GTR":0.0005550190735876054,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node86":{
"Global MG94xREV":0.0005553189176992722,
"Nucleotide GTR":0.0005548624922661842,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406036_California_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":1.518790616403812e-05,
"Nucleotide GTR":1.517542298288281e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "I", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ATA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406036_California_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551915681142927,
"Nucleotide GTR":0.0005547352473518505,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACG", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553860209415649,
"Nucleotide GTR":0.0005549295403552577,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "T", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "ACT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":1.51878068713339e-05,
"Nucleotide GTR":1.517532377178883e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "I", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ATA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001161825077342176,
"Nucleotide GTR":0.001160870154869348,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "ILVF", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "-TT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413695_China_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413749_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555620114159773,
"Nucleotide GTR":0.0005551634411685335,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCT", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413749_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005563942313297117,
"Nucleotide GTR":0.0005559369220792828,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "E", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "HPRL", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAA", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CNT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413931_California_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005550143708474256,
"Nucleotide GTR":0.0005545581957262298,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "F", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "TTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413931_California_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552922452903899,
"Nucleotide GTR":0.0005548358417797783,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "A", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GCA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551915680762867,
"Nucleotide GTR":0.0005547352473138752,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCG", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415149_England_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "AS", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "KCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415149_England_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415517_Noord_Brabant_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555256127754012,
"Nucleotide GTR":0.0005550690174563495,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "S", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "TCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415517_Noord_Brabant_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552747581689673,
"Nucleotide GTR":0.0005548183690312991,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTC", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001110923713108089,
"Nucleotide GTR":0.001110010627274485,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "H", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "CAT", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_3":{
"Global MG94xREV":1.706904991968359e-05,
"Nucleotide GTR":1.705502059661592e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "G", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "GGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553432873853574,
"Nucleotide GTR":0.0005548868419224375,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "T", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "ACA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005552263340617115,
"Nucleotide GTR":0.0005547699847245848,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "I", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "ATC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553432873849864,
"Nucleotide GTR":0.0005548868419220676,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "T", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "ACT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554337876196438,
"Nucleotide GTR":0.0005549772677731451,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "I", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "ATT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555472962656454,
"Nucleotide GTR":0.0005550906831245894,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTT", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "KGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111112049416655,
"Nucleotide GTR":0.001110198808786451,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "P", "I", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "CCA", "ATA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416671_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551284910536949,
"Nucleotide GTR":0.0005546722221352901,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "F", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "TTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416671_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555276033679119,
"Nucleotide GTR":0.0005550710064127606,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "K", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "AAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553024156661831,
"Nucleotide GTR":0.0005548460037963783,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000555279867736239,
"Nucleotide GTR":0.0005548234743989364,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "T", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "ACT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":2.859142972788199e-05,
"Nucleotide GTR":2.856792997795419e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552904365356467,
"Nucleotide GTR":0.00055483403451168,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGC", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "ILV", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "NTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417231_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552321252917079,
"Nucleotide GTR":0.000554775771194678,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "V", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GTT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417231_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417238_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATY", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417261_England_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "TI", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "AYA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417261_England_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417324_California_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553838146338278,
"Nucleotide GTR":0.0005549273358609192,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "F", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TTT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417324_California_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553838146338278,
"Nucleotide GTR":0.0005549273358609192,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "I", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ATT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553037707775242,
"Nucleotide GTR":0.0005548473577939313,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "V", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "GTA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553037707394251,
"Nucleotide GTR":0.0005548473577558641,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "R", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AGA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "PL", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CYG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553037707394251,
"Nucleotide GTR":0.0005548473577558641,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTG", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552923567640578,
"Nucleotide GTR":0.0005548359531618244,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAT", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553432874262058,
"Nucleotide GTR":0.0005548868419632523,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "I", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "ATT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417948_Kinshasa_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553037707394251,
"Nucleotide GTR":0.0005548473577558641,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAG", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417948_Kinshasa_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTK", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTK", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552321253329958,
"Nucleotide GTR":0.0005547757712359313,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "TTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552515642352781,
"Nucleotide GTR":0.0005547951941610719,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "P", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "CCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "I", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "ATA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552650411530883,
"Nucleotide GTR":0.0005548086600019887,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTT", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111190633625447,
"Nucleotide GTR":0.001110277328405634,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "Q", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "L", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAG", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CTC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552199744813766,
"Nucleotide GTR":0.00055476363037129,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "H", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAC", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553037707773783,
"Nucleotide GTR":0.0005548473577937866,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "V", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "GTC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418440_Lucerne_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552321253329958,
"Nucleotide GTR":0.0005547757712359313,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTT", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418440_Lucerne_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "AV", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GYT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418697_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553432873853574,
"Nucleotide GTR":0.0005548868419224375,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "H", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CAC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418697_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418731_England_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005551700731895549,
"Nucleotide GTR":0.0005547137700941329,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418731_England_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418732_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "TI", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "AYA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418732_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418768_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552321252917079,
"Nucleotide GTR":0.000554775771194678,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAT", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418768_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553048029040938,
"Nucleotide GTR":0.00055484838907218,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552321253329958,
"Nucleotide GTR":0.0005547757712359313,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "F", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "TTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552883532478237,
"Nucleotide GTR":0.0005548319529361436,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "I", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ATA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552030160598061,
"Nucleotide GTR":0.0005547466858881155,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAT", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553995970892081,
"Nucleotide GTR":0.0005549431053444493,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552694159091529,
"Nucleotide GTR":0.0005548130311623721,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGC", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553963772633145,
"Nucleotide GTR":0.0005549398881649819,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCG", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554323071401539,
"Nucleotide GTR":0.0005549757885104854,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "G", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GGG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555842601757307,
"Nucleotide GTR":0.0005551276166534495,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "V", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GTT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "IV", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "RTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATW", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553370626316561,
"Nucleotide GTR":0.0005548806222849597,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "M", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "ATG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552571821345595,
"Nucleotide GTR":0.0005548008074429118,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "ED", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAM", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552879929374171,
"Nucleotide GTR":0.0005548315929218823,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "D", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAT", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552606579250015,
"Nucleotide GTR":0.0005548042803765474,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAC", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419704_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "S", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "TCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419704_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553367785561364,
"Nucleotide GTR":0.000554880338442927,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "R", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CGA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005550632997791584,
"Nucleotide GTR":0.0005546070844424965,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552833258770421,
"Nucleotide GTR":0.0005548269296974386,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGT", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553590426516468,
"Nucleotide GTR":0.0005549025842392247,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTC", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553206270299647,
"Nucleotide GTR":0.0005548642001919509,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "S", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "TCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552321252917079,
"Nucleotide GTR":0.000554775771194678,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005552369603833523,
"Nucleotide GTR":0.0005547806023122845,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "S", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555994038643771,
"Nucleotide GTR":0.0005555370583180626,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "H", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CAC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552263340617115,
"Nucleotide GTR":0.0005547699847245848,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "V", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GTT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552833258770421,
"Nucleotide GTR":0.0005548269296974386,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "I", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ATA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "PS", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "YCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552823582450262,
"Nucleotide GTR":0.0005548259628607337,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGG", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420223_South_Yorkshire_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552321253329958,
"Nucleotide GTR":0.0005547757712359313,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAT", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420223_South_Yorkshire_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420300_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553032210512146,
"Nucleotide GTR":0.0005548468085194516,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "G", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "GGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420300_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005629650880856031,
"Nucleotide GTR":0.0005625023781437068,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "N", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAC", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554407611364741,
"Nucleotide GTR":0.0005549842355583311,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAT", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420528_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACY", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420528_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551873753810754,
"Nucleotide GTR":0.0005547310580647075,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "R", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AGA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420569_Abruzzo_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATM", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420569_Abruzzo_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553590426138714,
"Nucleotide GTR":0.0005549025842014796,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "P", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "CCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420634_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "AS", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "KCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420634_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420700_England_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "TI", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "AYA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420700_England_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556263808102589,
"Nucleotide GTR":0.0005551697026683597,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "I", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "ATC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420756_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420761_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005552321252917079,
"Nucleotide GTR":0.000554775771194678,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "V", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GTA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420761_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "LF", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "YTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "AV", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GYT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "AS", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "KCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "CF", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TKC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005552361014835277,
"Nucleotide GTR":0.0005547797441184021,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGG", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "QR", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CRA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "HR", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CRT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555292386809577,
"Nucleotide GTR":0.0005548359831826492,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAC", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553370626316561,
"Nucleotide GTR":0.0005548806222849597,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "S", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "AGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553258050109434,
"Nucleotide GTR":0.0005548693739170651,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005559101765465754,
"Nucleotide GTR":0.0005554532651484562,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "I", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "ATT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552715628744914,
"Nucleotide GTR":0.0005548151763630855,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "L", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TTA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421502_Ile_de_France_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552833258770421,
"Nucleotide GTR":0.0005548269296974386,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "L", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CTA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421502_Ile_de_France_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552833258770421,
"Nucleotide GTR":0.0005548269296974386,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "L", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CTT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421575_KZN_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":1.518790635733404e-05,
"Nucleotide GTR":1.517542317601986e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "L", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CTG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421575_KZN_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000555236101445855,
"Nucleotide GTR":0.0005547797440807604,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "R", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AGG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421618_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551166009509074,
"Nucleotide GTR":0.0005546603418051665,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "L", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TTA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421618_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551166009509074,
"Nucleotide GTR":0.0005546603418051665,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "V", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GTT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421665_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552879929374171,
"Nucleotide GTR":0.0005548315929218823,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "S", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "TCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCW", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421827_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "LV", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "STC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421860_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421864_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551915681142927,
"Nucleotide GTR":0.0005547352473518505,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "A", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "GCT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421864_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "SL", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TYA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421866_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421880_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "PL", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CYT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421880_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCY", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421892_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "QP", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CMA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421906_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421915_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "IV", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "RTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421915_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421931_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "AV", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GYT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421931_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421939_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005550766819883412,
"Nucleotide GTR":0.0005546204556526297,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "H", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "YF", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "CAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TWT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421939_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551428745643876,
"Nucleotide GTR":0.0005546865938239466,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "Y", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "TAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421955_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422003_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "IV", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "RTA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422003_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTR", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552879929374171,
"Nucleotide GTR":0.0005548315929218823,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "I", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATT", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555196947191807,
"Nucleotide GTR":0.0005547406220082146,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAC", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422091_Wales_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005551915680762867,
"Nucleotide GTR":0.0005547352473138752,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "V", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "GTG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422091_Wales_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005550854286863407,
"Nucleotide GTR":0.0005546291951615789,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTW", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422134_Wales_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553131674274513,
"Nucleotide GTR":0.0005548567467206037,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422134_Wales_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005562685572003699,
"Nucleotide GTR":0.0005558113512435027,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "HY", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "T", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "YAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "ACT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACR", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553689480325449,
"Nucleotide GTR":0.0005549124814787325,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "C", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "TGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422196_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422196_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005550396253386545,
"Nucleotide GTR":0.0005545834294603907,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAC", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "NS", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "ART", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422297_Wales_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005552515642352781,
"Nucleotide GTR":0.0005547951941610719,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTC", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422297_Wales_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "TA", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "RCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCY", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422349_Wales_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":2.301640736106077e-05,
"Nucleotide GTR":2.299748981050908e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "V", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GTT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422349_Wales_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555842105881906,
"Nucleotide GTR":0.0005551275671066671,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCT", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "HR", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CRT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAY", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "AV", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GYT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555363793863433,
"Nucleotide GTR":0.0005549073315459129,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "F", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "TTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552879929784758,
"Nucleotide GTR":0.0005548315929629072,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "S", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "TCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553116179175752,
"Nucleotide GTR":0.0005548551984842941,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "F", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "TTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005555256127754012,
"Nucleotide GTR":0.0005550690174563495,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "I", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ATT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422745_Netherlands_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422745_Netherlands_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00055511660095111,
"Nucleotide GTR":0.000554660341805369,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "Y", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "TAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554864964312233,
"Nucleotide GTR":0.0005550299332625162,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005551969471917034,
"Nucleotide GTR":0.0005547406220081119,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAC", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":1.51879063894706e-05,
"Nucleotide GTR":1.517542320812998e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "V", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GTA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422968_USA_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422968_USA_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422987_Washington_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552263340617115,
"Nucleotide GTR":0.0005547699847245848,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "N", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAT", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422987_Washington_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554503605738653,
"Nucleotide GTR":0.000554993827105793,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423061_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "LF", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "YTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423061_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423062_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "VF", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "KTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423062_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423089_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553383815112748,
"Nucleotide GTR":0.0005548819400805713,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423089_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423091_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTY", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423091_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423112_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTY", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423112_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423121_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551577388732825,
"Nucleotide GTR":0.0005547014459156303,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423121_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423145_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "SG", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "RGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423145_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423147_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553254848780498,
"Nucleotide GTR":0.0005548690540472934,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGC", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423147_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423155_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "AV", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GYT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423155_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423247_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "VF", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "KTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423247_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423282_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "MV", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "RTG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423282_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423304_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555121535934414,
"Nucleotide GTR":0.0005550555693367048,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "T", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "ACA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423304_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423312_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "VL", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "KTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423312_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423339_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555380167180574,
"Nucleotide GTR":0.0005549236914055653,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "I", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "ATA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423339_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423346_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554596873448689,
"Nucleotide GTR":0.0005550031462109752,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "Y", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "TAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423346_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423362_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAY", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423362_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423377_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005557302134923554,
"Nucleotide GTR":0.0005552734500087271,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "C", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "YSCF", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "TGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TNT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423377_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423385_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "YTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423385_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423399_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005556127689449792,
"Nucleotide GTR":0.0005551561019908881,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "Y", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TAT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423399_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423404_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTY", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423404_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423409_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "AV", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GYA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423409_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423426_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "PL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CYA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423426_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423453_England_20200329_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "PL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CYA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423453_England_20200329_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTR", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423531_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "HY", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "YAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423549_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005565917852194067,
"Nucleotide GTR":0.0005561343135962988,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "PS", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "YCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCA", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423569_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423570_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "VF", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "KTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423570_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423593_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "TS", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AST", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423593_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423598_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553254848780498,
"Nucleotide GTR":0.0005548690540472934,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAC", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423598_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423649_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552879929374171,
"Nucleotide GTR":0.0005548315929218823,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "S", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "TCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423649_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423656_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGY", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423656_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "ED", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAK", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423659_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423663_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005552879929374171,
"Nucleotide GTR":0.0005548315929218823,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "S", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "TCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423663_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423675_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423675_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAY", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423687_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423709_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "TP", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "MCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423709_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423736_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552245283104478,
"Nucleotide GTR":0.0005547681804574978,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "I", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATT", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423736_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423743_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGR", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423743_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423758_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553254849160295,
"Nucleotide GTR":0.0005548690540852424,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCC", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423758_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423779_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553593285580299,
"Nucleotide GTR":0.0005549028699106165,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423779_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCY", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423814_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423856_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "TI", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "AYT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423856_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423870_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551194951821866,
"Nucleotide GTR":0.0005546632336576313,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423870_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423875_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTY", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423875_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423888_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423888_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423907_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005554596873448689,
"Nucleotide GTR":0.0005550031462109752,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAT", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423907_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423954_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAY", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423954_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554260715241958,
"Nucleotide GTR":0.0005549695580196789,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "I", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ATA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423958_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "KE", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "RAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423967_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424026_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAY", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424026_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424088_England_20200313_null_6":{
"Global MG94xREV":1.47404660994199e-05,
"Nucleotide GTR":1.472835067635596e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAC", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424088_England_20200313_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424131_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "PL", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CYA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424131_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424142_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "IL", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "MTA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424142_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424144_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552573854467867,
"Nucleotide GTR":0.000554801010588034,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "D", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAC", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424144_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "TI", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "AYA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424146_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553254848780498,
"Nucleotide GTR":0.0005548690540472934,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAC", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424148_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "RW", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "YGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424154_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424155_England_20200320_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGY", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424155_England_20200320_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551866824889119,
"Nucleotide GTR":0.0005547303657420428,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAG", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551655118652632,
"Nucleotide GTR":0.0005547092125188647,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "A", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "GCA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424254_Washington_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005554668742309675,
"Nucleotide GTR":0.000555010327190057,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATA", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424254_Washington_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424295_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552485733583433,
"Nucleotide GTR":0.0005547922057423859,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424295_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555241631515076,
"Nucleotide GTR":0.0005547852696047291,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTT", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005554323071392913,
"Nucleotide GTR":0.0005549757885096238,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "A", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424355_Beijing_20200124_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005554260715241958,
"Nucleotide GTR":0.0005549695580196789,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGT", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424355_Beijing_20200124_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552263340617115,
"Nucleotide GTR":0.0005547699847245848,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "C", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "TGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552919255474907,
"Nucleotide GTR":0.0005548355222996811,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCC", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424435_Reykjavik_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":1.429219931437244e-05,
"Nucleotide GTR":1.42804523288945e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACG", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424435_Reykjavik_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424466_Reykjavik_20200320_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0005552321253329958,
"Nucleotide GTR":0.0005547757712359313,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAT", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424466_Reykjavik_20200320_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424484_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552263340617115,
"Nucleotide GTR":0.0005547699847245848,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "I", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATT", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424484_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005549965502014293,
"Nucleotide GTR":0.0005545403897273051,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAC", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424571_Reykjavik_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005554596873830507,
"Nucleotide GTR":0.0005550031462491258,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAT", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424571_Reykjavik_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005552879929775738,
"Nucleotide GTR":0.000554831592962006,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACT", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005552263340617115,
"Nucleotide GTR":0.0005547699847245848,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCT", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555145895473111,
"Nucleotide GTR":0.0005546896122497374,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553424131623563,
"Nucleotide GTR":0.0005548859684179739,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "N", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAT", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424842_South_Carolina_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424842_South_Carolina_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "PL", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CYT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552897056530034,
"Nucleotide GTR":0.0005548333042297603,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "R", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AGG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552484048013581,
"Nucleotide GTR":0.0005547920373239407,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "C", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "TGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "TI", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "AYA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "PL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CYA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552979279741175,
"Nucleotide GTR":0.0005548415197928179,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "V", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GTT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "LF", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "YTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553254848780498,
"Nucleotide GTR":0.0005548690540472934,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTC", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":1.757004696769509e-05,
"Nucleotide GTR":1.755560586720127e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTT", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555472962656454,
"Nucleotide GTR":0.0005550906831245894,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAT", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000555419689643526,
"Nucleotide GTR":0.0005549631813843774,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAT", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553166632026115,
"Nucleotide GTR":0.0005548602396225309,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "P", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "S", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CCC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "TCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425223_Comunitat_Valenciana_20200317_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425223_Comunitat_Valenciana_20200317_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425231_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553254848780498,
"Nucleotide GTR":0.0005548690540472934,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGC", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425231_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425255_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005549069198114955,
"Nucleotide GTR":0.0005544508330060113,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACT", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425255_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425259_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553590426516468,
"Nucleotide GTR":0.0005549025842392247,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTC", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425259_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425289_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552376209974916,
"Nucleotide GTR":0.0005547812623834536,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425289_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425332_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425332_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425368_England_20200316_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005552321253329958,
"Nucleotide GTR":0.0005547757712359313,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425368_England_20200316_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425435_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005553590426138714,
"Nucleotide GTR":0.0005549025842014796,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTC", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425435_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425498_England_20200319_null_35":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425498_England_20200319_null_35",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425505_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552263340617115,
"Nucleotide GTR":0.0005547699847245848,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "S", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "TCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425505_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552833259184201,
"Nucleotide GTR":0.0005548269297387824,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCT", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425693_Scotland_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":1.51879121938408e-05,
"Nucleotide GTR":1.517542900772948e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "I", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ATA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425693_Scotland_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005555472962656454,
"Nucleotide GTR":0.0005550906831245894,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAT", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425741_Scotland_20200318_null_17":{
"Global MG94xREV":0.0005550111555910232,
"Nucleotide GTR":0.0005545549831124977,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "P", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CCC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425741_Scotland_20200318_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425880_Scotland_20200321_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425880_Scotland_20200321_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425900_Scotland_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552833258770194,
"Nucleotide GTR":0.0005548269296974154,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "I", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ATT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425900_Scotland_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001669582607135305,
"Nucleotide GTR":0.001668210350689054,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "I", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "Y", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCG", "ATA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TAT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553568211773479,
"Nucleotide GTR":0.0005549003645907904,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "S", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "TCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00111163444907074,
"Nucleotide GTR":0.001110720779071968,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "F", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "TTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552833259184201,
"Nucleotide GTR":0.0005548269297387824,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATT", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426051_Prague_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552833258770194,
"Nucleotide GTR":0.0005548269296974154,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "V", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GTC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426051_Prague_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001111626486102828,
"Nucleotide GTR":0.001110712822648946,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "Y", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "TAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426081_Washington_20200323_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0005552263340617115,
"Nucleotide GTR":0.0005547699847245848,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "L", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "TTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426081_Washington_20200323_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005551179069551475,
"Nucleotide GTR":0.0005546616467359809,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTT", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555426928926429,
"Nucleotide GTR":0.0005549704147171993,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552833258770421,
"Nucleotide GTR":0.0005548269296974386,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "I", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ATT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426289_Latvia_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552833259184201,
"Nucleotide GTR":0.0005548269297387824,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "S", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "TCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426289_Latvia_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555236101445855,
"Nucleotide GTR":0.0005547797440807604,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCG", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0005557013314807532,
"Nucleotide GTR":0.0005552445917357088,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATA", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "GV", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GKT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426426_Minnesota_20200305_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426426_Minnesota_20200305_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426427_Minnesota_20200307_null_60":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426427_Minnesota_20200307_null_60",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552722232797245,
"Nucleotide GTR":0.0005548158362255209,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "F", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "TTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553930923244919,
"Nucleotide GTR":0.0005549366059261015,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "TTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553734527253916,
"Nucleotide GTR":0.0005549169824691002,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "V", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GTT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553534736192855,
"Nucleotide GTR":0.0005548970197841389,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTT", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426618_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":1.518790602689808e-05,
"Nucleotide GTR":1.517542284585549e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426618_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555365331496183,
"Nucleotide GTR":0.0005549088679148586,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "I", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATA", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552977436125644,
"Nucleotide GTR":0.0005548413355827944,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552833258770421,
"Nucleotide GTR":0.0005548269296974386,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTT", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426677_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551166009509074,
"Nucleotide GTR":0.0005546603418051665,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426677_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005555842601757307,
"Nucleotide GTR":0.0005551276166534495,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCT", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001527780172154942,
"Nucleotide GTR":0.0001526524465380848,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "V", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GTT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005555318520262064,
"Nucleotide GTR":0.0005550752515790161,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "D", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAT", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552868502236245,
"Nucleotide GTR":0.0005548304511473048,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "V", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GTT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553590426516468,
"Nucleotide GTR":0.0005549025842392247,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "T", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ACA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552833258770194,
"Nucleotide GTR":0.0005548269296974154,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAT", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "GC", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "KGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555359042651865,
"Nucleotide GTR":0.0005549025842394417,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACC", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "GV", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GKT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426801_Victoria_20200325_null_9":{
"Global MG94xREV":4.514537518804259e-05,
"Nucleotide GTR":4.510826948757868e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAT", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426801_Victoria_20200325_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005552879929775738,
"Nucleotide GTR":0.000554831592962006,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGT", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "GV", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GKT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "GV", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GKT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553370626318113,
"Nucleotide GTR":0.0005548806222851151,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "N", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "AAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_66":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_66",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":1.778038688656015e-05,
"Nucleotide GTR":1.77657729043483e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "L", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "TTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555279252341526,
"Nucleotide GTR":0.0005548228595100255,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "L", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "TTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":1.518790090700838e-05,
"Nucleotide GTR":1.517541773017389e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCT", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552926775231293,
"Nucleotide GTR":0.0005548362736572585,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427102_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553590426516468,
"Nucleotide GTR":0.0005549025842392247,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "H", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "CAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427102_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000555236101445855,
"Nucleotide GTR":0.0005547797440807604,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "G", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "GGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553590426516468,
"Nucleotide GTR":0.0005549025842392247,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGC", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553975621406546,
"Nucleotide GTR":0.0005549410720684529,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000555236101445855,
"Nucleotide GTR":0.0005547797440807604,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCG", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427185_Washington_20200326_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005554365883009995,
"Nucleotide GTR":0.0005549800661525765,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427185_Washington_20200326_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005551880921052584,
"Nucleotide GTR":0.0005547317741998032,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "L", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "TTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556039616466157,
"Nucleotide GTR":0.000555147301931383,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAA", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552833258770194,
"Nucleotide GTR":0.0005548269296974154,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "L", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CTA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "ND", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "RAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427476_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427476_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427513_New_York_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005552263340617115,
"Nucleotide GTR":0.0005547699847245848,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "Y", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "TAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427513_New_York_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427519_New_York_20200318_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427519_New_York_20200318_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005554176111988369,
"Nucleotide GTR":0.0005549611046479948,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "L", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TTA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427639_New_York_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552263340617115,
"Nucleotide GTR":0.0005547699847245848,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "F", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTT", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427639_New_York_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005556502380669948,
"Nucleotide GTR":0.0005551935403164386,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTA", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427683_New_South_Wales_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005552833258770194,
"Nucleotide GTR":0.0005548269296974154,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "I", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ATT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427683_New_South_Wales_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427687_New_South_Wales_20200318_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427687_New_South_Wales_20200318_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552361014835277,
"Nucleotide GTR":0.0005547797441184021,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCG", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005553846523577981,
"Nucleotide GTR":0.0005549281728963517,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAA", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0005550793089058266,
"Nucleotide GTR":0.0005546230804110095,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005556200800861219,
"Nucleotide GTR":0.0005551634071228881,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "V", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GTC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005552361014455729,
"Nucleotide GTR":0.0005547797440804793,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "A", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "GCT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_31":{
"Global MG94xREV":0.0005554596873448689,
"Nucleotide GTR":0.0005550031462109752,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "L", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TTA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_31",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552263340617115,
"Nucleotide GTR":0.0005547699847245848,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTT", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428348_Grand_est_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005553668267903595,
"Nucleotide GTR":0.0005549103619800282,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAT", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428348_Grand_est_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_8248":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_8248",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428358_Hauts_De_France_20200324_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428358_Hauts_De_France_20200324_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428376_Connecticut_20200327_null_404":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428376_Connecticut_20200327_null_404",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_21":{
"Global MG94xREV":0.00055511660095111,
"Nucleotide GTR":0.000554660341805369,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "TTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_708":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_708",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005553590426138714,
"Nucleotide GTR":0.0005549025842014796,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACC", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005552263340617115,
"Nucleotide GTR":0.0005547699847245848,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "S", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "TCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005552025393073786,
"Nucleotide GTR":0.0005547462095275388,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "C", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TGT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428462_Guangdong_20200217_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005554596873448779,
"Nucleotide GTR":0.0005550031462109835,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTT", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428462_Guangdong_20200217_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_7":{
"Global MG94xREV":1.518790623541251e-05,
"Nucleotide GTR":1.517542305419854e-05,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "I", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ATT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428478_Guangdong_20200129_null_18":{
"Global MG94xREV":0.0005554596873830507,
"Nucleotide GTR":0.0005550031462491258,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCT", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428478_Guangdong_20200129_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":10738.17847706115,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03289473299174684],
[0.01229510039665237],
[0.01087391524488085],
[0.03957239579288258],
[0.02471382056329628],
[0.009237311793557241],
[0.008169575057803389],
[0.02973075018211619],
[0.01802482776688194],
[0.006737159626186465],
[0.005958414360433473],
[0.02168388534020181],
[0.02623939401631371],
[0.009807527054827882],
[0.008673879392242394],
[0.03156601653035093],
[0.01845990434415652],
[0.006899778675234985],
[0.00610223634638799],
[0.02220728288595607],
[0.01386893043611451],
[0.005183805326798011],
[0.004584611589256403],
[0.01668433680794969],
[0.01011519371444721],
[0.003780767038963919],
[0.003343749869137013],
[0.01216858787971353],
[0.01472505351271014],
[0.005503799387284083],
[0.004867617679514782],
[0.01771425370203006],
[0.03379741142626377],
[0.01263249550428444],
[0.01117231100303403],
[0.04065831882783672],
[0.02539200308153122],
[0.009490796816556063],
[0.008393759860449356],
[0.03054660441136742],
[0.01851945477343428],
[0.006922036904442001],
[0.006121921756843372],
[0.0222789221103148],
[0.02695944044804069],
[0.01007665959864746],
[0.008911903025781006],
[0.03243223308826317],
[0.01223844085433082],
[0.03939003422104845],
[0.0245999318013538],
[0.009194743466205729],
[0.00813192718435758],
[0.02959374189069519],
[0.006706112756404834],
[0.005930956184433851],
[0.02158395943642771],
[0.02611847495036091],
[0.009762331003042565],
[0.00863390753185396],
[0.03142055077636562]
],
"Log Likelihood":-4918.174715664122,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6047582251932118, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":450
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":11551.64360837152,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3033012560079396],
[0.1867052504070257],
[0.1946726103916742],
[0.3153208831933604]
],
"Log Likelihood":-5029.987770534481,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2443716057732158,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1445395985742936,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.03129133800270918,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":3.191250754971803,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.9766712462244713
},
"display order":0,
"estimated parameters":745
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-21/sequences.helicase.compressed.fas",
"number of sequences":370,
"number of sites":601,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3,epi_isl_421502_Ile_de_France_20200312_null_1,epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4,epi_isl_425505_England_20200318_null_1,epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1,epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1,epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3,epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1,epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1,epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_21,epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1,epi_isl_421665_India_20200310_null_1,epi_isl_427639_New_York_20200406_null_1,epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3,epi_isl_421618_New_York_20200320_null_1,epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1,epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1,epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2,epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1,epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1,epi_isl_423399_England_20200329_null_3,epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_420761_England_20200325_null_3,epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1,epi_isl_422091_Wales_20200328_null_3,epi_isl_424484_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_423907_England_20200318_null_3,epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1,(epi_isl_423089_England_20200323_null_3,epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_14)Node25,(epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_427687_New_South_Wales_20200318_null_10)Node19,epi_isl_423339_England_20200327_null_1,epi_isl_425231_England_20200330_null_1,(epi_isl_423312_England_20200325_null_1,epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3)Node231,epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1,(epi_isl_421955_England_20200330_null_1,epi_isl_423675_England_20200320_null_2)Node634,(epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_3,epi_isl_423409_England_20200330_null_1)Node631,(epi_isl_423687_England_20200323_null_1,epi_isl_424088_England_20200313_null_6)Node628,(epi_isl_406036_California_20200122_null_1,epi_isl_424146_England_20200321_null_1)Node625,(epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1,epi_isl_421575_KZN_20200401_null_2)Node622,(epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_3,epi_isl_423145_England_20200324_null_1)Node619,(epi_isl_423856_England_20200317_null_1,epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_7)Node616,(epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1,epi_isl_417261_England_20200306_null_1)Node613,(epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1,epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1)Node610,(epi_isl_420700_England_20200327_null_3,epi_isl_425693_Scotland_20200316_null_4)Node607,(epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1,epi_isl_424435_Reykjavik_20200319_null_1)Node597,(epi_isl_423112_England_20200324_null_2,epi_isl_426618_New_York_20200401_null_2)Node594,(epi_isl_423404_England_20200330_null_1,epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2)Node591,epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1,epi_isl_421915_England_20200327_null_2,epi_isl_421892_England_20200327_null_1,epi_isl_421860_England_20200327_null_1,epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1,epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1,(epi_isl_423569_England_20200331_null_1,epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_2)Node292,epi_isl_423736_England_20200323_null_1,(epi_isl_423656_England_20200322_null_1,epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_9)Node288,((epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1,epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_421866_England_20200327_null_1,epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_66)Node275,epi_isl_423155_England_20200323_null_1)Node274,(epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_1)Node284,epi_isl_416671_Washington_20200312_null_1,epi_isl_421827_England_20200324_null_2,epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1,epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1,epi_isl_420569_Abruzzo_20200323_null_1,epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1,epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1,(epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17,epi_isl_423385_England_20200328_null_1,epi_isl_415517_Noord_Brabant_20200101_null_2,epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4)Node307,(epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3)Node314,epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3,epi_isl_423649_England_20200322_null_1,epi_isl_420528_England_20200327_null_1,epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,epi_isl_423570_England_20200401_null_1,epi_isl_418732_England_20200313_null_1,epi_isl_423377_England_20200328_null_1,epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1,epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1,(epi_isl_423362_England_20200328_null_1,epi_isl_426801_Victoria_20200325_null_9)Node347,(epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1,epi_isl_422349_Wales_20200324_null_2)Node344,epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3,epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1,(epi_isl_413695_China_20200101_null_1,epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1)Node338,epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1,epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1,epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1,(epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1,epi_isl_423426_England_20200330_null_1)Node364,(epi_isl_423453_England_20200329_null_7,epi_isl_424842_South_Carolina_20200307_null_1)Node360,epi_isl_421906_England_20200327_null_1,epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2,epi_isl_420634_England_20200320_null_1,epi_isl_421864_England_20200327_null_1,epi_isl_422987_Washington_20200318_null_1,((epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1,epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2)Node372,epi_isl_421880_England_20200326_null_2)Node371,epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1,epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1,epi_isl_423247_England_20200325_null_1,epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1,epi_isl_423814_England_20200323_null_1,epi_isl_423967_England_20200320_null_1,epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2,epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2,epi_isl_423282_England_20200326_null_1,epi_isl_423531_England_20200326_null_1,epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5,epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1,epi_isl_423549_England_20200331_null_1,epi_isl_423593_England_20200402_null_1,epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1,epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1,epi_isl_423346_England_20200327_null_1,(epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2,epi_isl_425880_Scotland_20200321_null_5)Node196,epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2,epi_isl_426051_Prague_20200320_null_2,epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1,epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1,epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2,epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1,epi_isl_423958_England_20200319_null_1,epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1,epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1,epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1,epi_isl_424571_Reykjavik_20200327_null_3,epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1,epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1,epi_isl_424026_England_20200319_null_1,epi_isl_424131_England_20200321_null_1,epi_isl_424142_England_20200321_null_1,epi_isl_424154_England_20200320_null_1,epi_isl_421931_England_20200331_null_1,epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1,epi_isl_428462_Guangdong_20200217_null_6,epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1,(epi_isl_419704_New_York_20200318_null_1,epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2)Node107,epi_isl_425741_Scotland_20200318_null_17,epi_isl_425259_England_20200101_null_1,epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3,epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1,epi_isl_426289_Latvia_20200330_null_2,epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1,epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1,epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_31,epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2,epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_2,epi_isl_423758_England_20200322_null_1,(epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1,epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1)Node135,epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1,epi_isl_425900_Scotland_20200322_null_1,epi_isl_417948_Kinshasa_20200319_null_2,epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7,epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2,epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2,epi_isl_420223_South_Yorkshire_20200326_null_1,epi_isl_424148_England_20200320_null_1,epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2,(epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3,epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_2)Node156,epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_1,epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1,epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1,epi_isl_424466_Reykjavik_20200320_null_9,epi_isl_423598_England_20200321_null_1,(epi_isl_417238_England_20200303_null_1,epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1)Node176,epi_isl_420300_New_York_20200318_null_1,epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1,epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4,epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2,epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1,epi_isl_425368_England_20200316_null_6,epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2,epi_isl_422134_Wales_20200325_null_2,((epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1,epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1)Node585,epi_isl_415149_England_20200301_null_1)Node584,((epi_isl_423779_England_20200323_null_1,epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1,epi_isl_425498_England_20200319_null_35)Node578,epi_isl_423954_England_20200320_null_2)Node577,((epi_isl_423870_England_20200318_null_1,epi_isl_423888_England_20200318_null_2)Node568,epi_isl_422196_Wales_20200327_null_1)Node567,(epi_isl_425223_Comunitat_Valenciana_20200317_null_9,epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2)Node564,(epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2,epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_16)Node561,(epi_isl_422745_Netherlands_20200325_null_3,epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1)Node558,(epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1,epi_isl_423121_England_20200324_null_1)Node555,epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2,epi_isl_424155_England_20200320_null_5,(epi_isl_423061_England_20200323_null_1,epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1,epi_isl_423091_England_20200324_null_1,epi_isl_425289_England_20200321_null_1,epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2,epi_isl_428376_Connecticut_20200327_null_404,epi_isl_422003_England_20200331_null_1,epi_isl_423062_England_20200323_null_1,epi_isl_423743_England_20200323_null_1,epi_isl_425255_England_20200331_null_1,epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1,epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1,(epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7,epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2)Node448,epi_isl_421939_England_20200401_null_2)Node435,(epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1,(((epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1,epi_isl_422968_USA_20200301_null_1)Node549,epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1)Node548,epi_isl_418935_Washington_20200316_null_2,epi_isl_424295_Washington_20200323_null_1,(epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2,epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1)Node543,epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1,epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1,epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1,epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_417368_USA_20200313_null_2,epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1,epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1,epi_isl_416682_USA_20200309_null_1,epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1,(epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2,epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1)Node530,epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2,epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1,epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_708,epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1,(epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9)Node523,epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1,epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1,(epi_isl_413931_California_20200305_null_2,epi_isl_426426_Minnesota_20200305_null_5)Node517,epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1,epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1,epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2,epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1,epi_isl_417324_California_20200304_null_1,epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1,epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1,epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1,epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1,epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1,epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1,(epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1,epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3)Node506,epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1)Node466,epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18)Node464,epi_isl_423304_England_20200325_null_1,(epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1,epi_isl_427476_New_York_20200401_null_1)Node49,epi_isl_426322_New_York_20200312_null_10,epi_isl_425435_England_20200401_null_4,epi_isl_426677_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_427513_New_York_20200403_null_4,(epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1,epi_isl_425332_England_20200329_null_1)Node573,epi_isl_423709_England_20200323_null_1,epi_isl_427683_New_South_Wales_20200323_null_3,epi_isl_418768_England_20200318_null_1,epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1,epi_isl_423875_England_20200318_null_2,(epi_isl_418731_England_20200313_null_2,epi_isl_428358_Hauts_De_France_20200324_null_6)Node602,epi_isl_427185_Washington_20200326_null_6,epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1,epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1,(epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1,epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2)Node640,(epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5)Node643,epi_isl_423147_England_20200323_null_1,(epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1,epi_isl_426427_Minnesota_20200307_null_60)Node655,epi_isl_424355_Beijing_20200124_null_3,epi_isl_423659_England_20200323_null_1,epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3,epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1,epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5,epi_isl_427102_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_418440_Lucerne_20200320_null_1,epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_424254_Washington_20200321_null_3,epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2,epi_isl_413749_China_20200201_null_1,epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1,epi_isl_417231_England_20200303_null_1,epi_isl_424144_England_20200321_null_1,epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1,epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4,epi_isl_422297_Wales_20200329_null_4,epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4,epi_isl_420756_England_20200327_null_2,((epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3,epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_17)Node682,epi_isl_427519_New_York_20200318_null_5)Node681,epi_isl_428348_Grand_est_20200320_null_3,epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1,epi_isl_426081_Washington_20200323_null_12,epi_isl_428478_Guangdong_20200129_null_18,epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2,epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1,epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2,epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1,(epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_7)Node86,epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_8248,epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1,epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1,epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1,epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_418697_England_20200316_null_1,epi_isl_423663_England_20200323_null_3)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node107":"test",
"Node135":"test",
"Node156":"test",
"Node176":"test",
"Node19":"test",
"Node196":"test",
"Node231":"test",
"Node25":"test",
"Node274":"test",
"Node275":"test",
"Node284":"test",
"Node288":"test",
"Node292":"test",
"Node307":"test",
"Node314":"test",
"Node338":"test",
"Node344":"test",
"Node347":"test",
"Node360":"test",
"Node364":"test",
"Node371":"test",
"Node372":"test",
"Node435":"test",
"Node448":"test",
"Node464":"test",
"Node466":"test",
"Node49":"test",
"Node506":"test",
"Node517":"test",
"Node523":"test",
"Node530":"test",
"Node543":"test",
"Node548":"test",
"Node549":"test",
"Node555":"test",
"Node558":"test",
"Node561":"test",
"Node564":"test",
"Node567":"test",
"Node568":"test",
"Node573":"test",
"Node577":"test",
"Node578":"test",
"Node584":"test",
"Node585":"test",
"Node591":"test",
"Node594":"test",
"Node597":"test",
"Node602":"test",
"Node607":"test",
"Node610":"test",
"Node613":"test",
"Node616":"test",
"Node619":"test",
"Node622":"test",
"Node625":"test",
"Node628":"test",
"Node631":"test",
"Node634":"test",
"Node640":"test",
"Node643":"test",
"Node655":"test",
"Node681":"test",
"Node682":"test",
"Node86":"test",
"epi_isl_406036_California_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2":"test",
"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_413749_China_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413931_California_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_415149_England_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_415517_Noord_Brabant_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416315_Hong_Kong_20200219_null_3":"test",
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":"test",
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4":"test",
"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_416671_Washington_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":"test",
"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_417231_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417261_England_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417324_California_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417424_Kasterlee_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_417834_Reykjavik_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_417948_Kinshasa_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_418090_Wales_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418440_Lucerne_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_418697_England_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418731_England_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_418732_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418768_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_418863_Komen_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418935_Washington_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2":"test",
"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_419704_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_420060_Ile_de_France_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420078_Thies_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_420195_South_Yorkshire_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_420223_South_Yorkshire_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_420300_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420328_Alken_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_420388_Vilvoorde_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420528_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420569_Abruzzo_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420623_ARA_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420634_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420700_England_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_420761_England_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3":"test",
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421502_Ile_de_France_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421575_KZN_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_421603_New_York_20200321_null_3":"test",
"epi_isl_421618_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_421730_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421864_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421880_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421915_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_421931_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421939_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422003_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422051_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422091_Wales_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422134_Wales_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422196_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422297_Wales_20200329_null_4":"test",
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422349_Wales_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_422745_Netherlands_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4":"test",
"epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_422968_USA_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_422987_Washington_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423061_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423062_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423089_England_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_423091_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423112_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423121_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423145_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423147_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423155_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423247_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423282_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423304_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423312_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423339_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423346_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423362_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423377_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423385_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423399_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_423404_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423409_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423426_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423453_England_20200329_null_7":"test",
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423570_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423593_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_423598_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423649_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423656_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423663_England_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_423675_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423709_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423736_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423743_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423758_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423779_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423856_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_423870_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423875_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_423888_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_423907_England_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_423954_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424026_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424088_England_20200313_null_6":"test",
"epi_isl_424131_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424142_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424144_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424155_England_20200320_null_5":"test",
"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424254_Washington_20200321_null_3":"test",
"epi_isl_424295_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7":"test",
"epi_isl_424355_Beijing_20200124_null_3":"test",
"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424435_Reykjavik_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9":"test",
"epi_isl_424466_Reykjavik_20200320_null_9":"test",
"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7":"test",
"epi_isl_424484_Reykjavik_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_424571_Reykjavik_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3":"test",
"epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_424842_South_Carolina_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_424846_Massachusetts_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_424851_Illinois_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_424868_Louisiana_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_2":"test",
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424972_Taoyuan_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_425223_Comunitat_Valenciana_20200317_null_9":"test",
"epi_isl_425231_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425255_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425259_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_425289_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_425332_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_425368_England_20200316_null_6":"test",
"epi_isl_425435_England_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_425498_England_20200319_null_35":"test",
"epi_isl_425505_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_425693_Scotland_20200316_null_4":"test",
"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_425741_Scotland_20200318_null_17":"test",
"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_425880_Scotland_20200321_null_5":"test",
"epi_isl_425900_Scotland_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_7":"test",
"epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_425953_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_425990_Scotland_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_426051_Prague_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_426081_Washington_20200323_null_12":"test",
"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426108_Washington_20200325_null_17":"test",
"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_9":"test",
"epi_isl_426181_South_Korea_20200223_null_2":"test",
"epi_isl_426289_Latvia_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_10":"test",
"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_426426_Minnesota_20200305_null_5":"test",
"epi_isl_426427_Minnesota_20200307_null_60":"test",
"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_426507_Arizona_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_426618_New_York_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_426677_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426716_Victoria_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426801_Victoria_20200325_null_9":"test",
"epi_isl_426814_Victoria_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426877_Victoria_20200328_null_18":"test",
"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_426983_Victoria_20200327_null_66":"test",
"epi_isl_426989_Victoria_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_427102_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5":"test",
"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_427185_Washington_20200326_null_6":"test",
"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_427388_Liege_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5":"test",
"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_17":"test",
"epi_isl_427476_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_427513_New_York_20200403_null_4":"test",
"epi_isl_427519_New_York_20200318_null_5":"test",
"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_427620_Alaska_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_427639_New_York_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_427683_New_South_Wales_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_427687_New_South_Wales_20200318_null_10":"test",
"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_16":"test",
"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_428346_Istanbul_20200417_null_31":"test",
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_428348_Grand_est_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_8248":"test",
"epi_isl_428358_Hauts_De_France_20200324_null_6":"test",
"epi_isl_428376_Connecticut_20200327_null_404":"test",
"epi_isl_428380_Connecticut_20200331_null_21":"test",
"epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_14":"test",
"epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_708":"test",
"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4":"test",
"epi_isl_428462_Guangdong_20200217_null_6":"test",
"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_7":"test",
"epi_isl_428478_Guangdong_20200129_null_18":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":19
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":21
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":41
}
}
}