{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[286.4473492453891, 709.3271693531713, 0, 1, 0.2876628633242506, 0, 0.001409786686885109, 0.008899905208060298, 0.7123371366757494, 1, 0.0009713319108836175],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009709065608074671],
[286.6170319572973, 709.1574866412633, 1, 0, 0.2878332660697908, 0.003488976189485448, 0, -0.02202571328589264, 1, 0.2878332660697908, 0.0009713497017759323],
[286.6671091115755, 709.1074094869849, 0, 1, 0.2878835557220594, 0, 0.001410223594650444, 0.008902663382564509, 0.7121164442779406, 1, 0.0009710381244695355],
[286.5860872874392, 709.1140967149288, 0, 1, 0.2878236761345799, 0, 0.001410210295681106, 0.008902579426908258, 0.7121763238654201, 1, 0.0009716362921927588],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009711796131814184],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009713961342029672],
[286.709555800385, 709.0106432580602, 0, 1, 0.2879418897713415, 0, 0.001410416062874289, 0.008903878423792887, 0.7120581102286585, 1, 0.0009717704572046159],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009718505783943753],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009717589896067164],
[286.5860872874392, 708.995373728956, 0, 1, 0.2878579990781083, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7121420009218917, 1, 0.0009713700029322241],
[286.4740515294102, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466832, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.0009718149239116062],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.3525013581398, 709.3133781601905, 0, 1, 0.2875989900313421, 0, 0.001409814097393439, 0.008900078249079985, 0.7124010099686579, 1, 0.0009714891114032347],
[286.393029705274, 709.3271693531713, 0, 1, 0.2876240031849185, 0, 0.001409786686885109, 0.008899905208060298, 0.7123759968150815, 1, 0.0009715728926257594],
[286.4740515294102, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466832, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.0009713195705479172],
[286.7791448696045, 708.995373728956, 0, 1, 0.2879960668939526, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7120039331060475, 1, 0.0009711974193939554],
[286.7405004702431, 708.9219823702884, 0, 1, 0.2879896605646919, 0, 0.001410592455683895, 0.008904991981822256, 0.7120103394353081, 1, 0.0009713305088436901],
[286.5860872874392, 708.995373728956, 0, 1, 0.2878579990781083, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7121420009218917, 1, 0.0009730181079779704],
[286.5860872874392, 709.3656474496652, 1, 0, 0.2877509795824471, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2877509795824471, 0.0009711796131814184],
[286.576503610163, 709.3752311269413, 0, 1, 0.287741356950203, 0, 0.001409691170653592, 0.008899302219385312, 0.712258643049797, 1, 0.0009717704643419511],
[286.5551426175812, 709.3581140230293, 1, 0, 0.2877310254752324, 0.003489729728335528, 0, -0.02203047033488359, 1, 0.2877310254752323, 0.000971393166575362],
[286.4740515294103, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466831, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.000971850583674922],
[286.5860872874392, 709.134111771006, 0, 1, 0.2878178905664819, 0, 0.001410170493001076, 0.008902328154795545, 0.7121821094335181, 1, 0.0009730181079779704],
[286.6981230454682, 709.0763955530922, 1, 0, 0.2879147012608469, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.287914701260847, 0.0009710381187498524],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009711788090388364],
[286.5860872874392, 709.2894794512996, 0, 1, 0.2877729877698899, 0, 0.0014098615994891, 0.00890037812717679, 0.7122270122301102, 1, 0.0009717516447259358],
[286.5860872874392, 709.134111771006, 0, 1, 0.2878178905664819, 0, 0.001410170493001076, 0.008902328154795545, 0.7121821094335181, 1, 0.0009730181079779704],
[286.4473492453891, 709.3271693531713, 0, 1, 0.2876628633242506, 0, 0.001409786686885109, 0.008899905208060298, 0.7123371366757494, 1, 0.0009718505783943753],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009717704643419511],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009714108581599694],
[286.5860872874392, 709.0873831709428, 0, 1, 0.2878313983353423, 0, 0.001410263422722508, 0.008902914814975729, 0.7121686016646577, 1, 0.000971410817312897],
[286.5860872874392, 709.5312414886195, 0, 1, 0.2877031440057076, 0, 0.001409381210476325, 0.00889734545796771, 0.7122968559942924, 1, 0.0009720614447643086],
[287.0050654633029, 708.7694531352574, 0, 1, 0.2882229461617776, 0, 0.001410896019257712, 0.008906908361836852, 0.7117770538382224, 1, 0.0009717971531159365],
[286.5097260507737, 709.2647925477867, 0, 1, 0.2877255048201109, 0, 0.001409910671595369, 0.008900687916663541, 0.7122744951798891, 1, 0.0009713497429769431],
[286.7791448696045, 708.995373728956, 0, 1, 0.2879960668939526, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7120039331060475, 1, 0.000971410817312897],
[285.6671091115755, 710.1074094869849, 0, 1, 0.2868793123102, 0, 0.001408237664668852, 0.008890126316673314, 0.7131206876898, 1, 0.0009720614447412462],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009718505426686572],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009713931606760376],
[286.5860872874392, 708.9953737289561, 0, 1, 0.2878579990781083, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313157, 0.7121420009218917, 1, 0.0009717704572274199],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.000971178802977245],
[286.6575946983339, 709.2941400387705, 0, 1, 0.2878227776509685, 0, 0.001409852335654908, 0.008900319645105044, 0.7121772223490315, 1, 0.0009711973168161633],
[286.5551426175812, 709.2193759809792, 1, 0, 0.2877711141081166, 0.003489729728335528, 0, -0.02203047033488359, 1, 0.2877711141081165, 0.0009712149862504837],
[286.393029705274, 709.3814888932864, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.008899223714723441, 0.7123916867160452, 1, 0.0009712963135495525],
[286.2309167929668, 709.5436018055937, 1, 0, 0.2874455124597929, 0.003493682692297381, 0, -0.02205542517725701, 1, 0.287445512459793, 0.0009716420701787075],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.393029705274, 709.3814888932864, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.008899223714723441, 0.7123916867160452, 1, 0.0009715729332828862],
[286.5860872874392, 709.195118539065, 0, 1, 0.2878002573362198, 0, 0.001410049186548252, 0.008901562353883036, 0.7121997426637802, 1, 0.0009710207101661449],
[286.6981230454682, 709.0763955530923, 1, 0, 0.2879147012608469, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.287914701260847, 0.0009711788090288345],
[286.5860872874392, 709.1074094869849, 0, 1, 0.2878256092018704, 0, 0.001410223594650444, 0.008902663382564509, 0.7121743907981296, 1, 0.0009727704159544025],
[286.393029705274, 709.3814888932864, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.008899223714723441, 0.7123916867160452, 1, 0.0009713961342029672],
[286.7248253294893, 709.0496932690711, 0, 1, 0.2879415168536567, 0, 0.001410338386001556, 0.008903388054001052, 0.7120584831463432, 1, 0.0009711966091926547],
[286.7386165224702, 709.0359020760902, 0, 1, 0.2879553665683495, 0, 0.001410365817967684, 0.008903561230482634, 0.7120446334316506, 1, 0.0009714108579797669],
[286.576503610163, 709.2741829867629, 0, 1, 0.287770553826164, 0, 0.001409892005076213, 0.008900570075962818, 0.7122294461738361, 1, 0.0009717528123902138],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.000970906567022404],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009718683959598818],
[286.6981230454682, 709.0763955530923, 1, 0, 0.2879147012608469, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.287914701260847, 0.0009710381244534028],
[286.6404068275543, 709.134111771006, 0, 1, 0.2878567401292495, 0, 0.001410170493001076, 0.008902328154795545, 0.7121432598707504, 1, 0.0009727521982496023],
[286.5551426175812, 709.3581140230293, 1, 0, 0.2877310254752324, 0.003489729728335528, 0, -0.02203047033488359, 1, 0.2877310254752323, 0.0009711796192314408],
[286.5860872874392, 709.195118539065, 1, 0, 0.2878002573362198, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878002573362198, 0.0009713932015126599],
[286.688539368192, 709.5049574062323, 0, 1, 0.2877839900546039, 0, 0.001409433421939352, 0.008897675066039652, 0.7122160099453961, 1, 0.0009813604103281375],
[286.3215222943793, 709.2599387220159, 1, 0, 0.2875922599061577, 0.003492577127931926, 0, -0.02204844581070071, 1, 0.2875922599061577, 0.0009718505838651347],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.000972045263644634],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.000971681188655633],
[286.5551426175812, 709.3581140230293, 1, 0, 0.2877310254752324, 0.003489729728335527, 0, -0.02203047033488358, 1, 0.2877310254752324, 0.0009709242061786959],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.0031815155301, 709.7713370830303, 1, 0, 0.2872168108077792, 0.003496464601201297, 0, -0.02207298721396273, 1, 0.2872168108077792, 0.0009718472889320558],
[286.2386165224702, 709.5359020760902, 0, 1, 0.2874532448624198, 0, 0.00140937195295406, 0.008897287015742807, 0.7125467551375801, 1, 0.0009713459870278156],
[286.6266156345735, 709.0717349656215, 0, 1, 0.287864909549964, 0, 0.001410294545231709, 0.008903111289651156, 0.7121350904500361, 1, 0.0009730156599296057],
[286.4473492453891, 709.3271693531713, 0, 1, 0.2876628633242506, 0, 0.001409786686885109, 0.008899905208060298, 0.7123371366757494, 1, 0.0009713319466384183],
[286.4335580524082, 709.2647925477867, 0, 1, 0.2876710179139591, 0, 0.001409910671595369, 0.008900687916663541, 0.7123289820860409, 1, 0.0009720452204838639],
[286.2386165224702, 709.5359020760902, 0, 1, 0.2874532448624198, 0, 0.00140937195295406, 0.008897287015742807, 0.7125467551375801, 1, 0.0009716811821644079],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009711788029872374],
[286.2386165224702, 709.5359020760902, 0, 1, 0.2874532448624198, 0, 0.00140937195295406, 0.008897287015742807, 0.7125467551375801, 1, 0.0009717589896039946],
[286.7405004702431, 708.8409605461521, 0, 1, 0.2880130975696433, 0, 0.001410753688993246, 0.008906009838766825, 0.7119869024303567, 1, 0.0009713700029322241],
[286.5860872874392, 708.995373728956, 0, 1, 0.2878579990781083, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7121420009218917, 1, 0.0009718149595972335],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009719040103137906],
[287.352536228272, 708.4219823702883, 0, 1, 0.2885718913883116, 0, 0.001411588043406176, 0.008911277071926342, 0.7114281086116885, 1, 0.000971400081320209],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009718205324384466],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.6981230454682, 709.0763955530922, 1, 0, 0.2879147012608469, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.287914701260847, 0.0005158445037830769],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 0, 0.2878021900889537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004548634409812107],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.1804950782998, 708.4853844400302, 0, 1, 0.2884305879972789, 0, 0.001411461720964612, 0.008910479605354961, 0.7115694120027211, 1, 0.0009710917498962236],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.6399667311656, 709.0259127871644, 0, 1, 0.287887706737357, 0, 0.001410385688259295, 0.008903686670532138, 0.712112293262643, 1, 0.0009724658238253526],
[286.709555800385, 709.0106432580603, 0, 1, 0.2879418897713414, 0, 0.001410416062874288, 0.008903878423792885, 0.7120581102286585, 1, 0.0009717109594627845],
[286.3282787863578, 709.0272616363389, 0, 1, 0.287664324111526, 0, 0.001410383005150092, 0.008903669732212462, 0.712335675888474, 1, 0.0009713319520717607],
[286.4335580524083, 709.3409605461522, 0, 1, 0.2876490136095579, 0, 0.001409759277442623, 0.008899732173769225, 0.712350986390442, 1, 0.0009713961341946465],
[286.5860872874392, 708.995373728956, 0, 1, 0.2878579990781083, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7121420009218917, 1, 0.0009717704572046159],
[286.5860872874392, 709.2894794512997, 0, 1, 0.2877729877698899, 0, 0.001409861599489099, 0.008900378127176789, 0.7122270122301102, 1, 0.0009713497429769431],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009714108579636595],
[286.393029705274, 709.3814888932864, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.008899223714723441, 0.7123916867160452, 1, 0.0009717528124580953],
[286.5860872874392, 709.195118539065, 0, 1, 0.2878002573362198, 0, 0.001410049186548252, 0.008901562353883036, 0.7121997426637802, 1, 0.0009711974193776776],
[286.6981230454682, 709.0763955530923, 1, 0, 0.2879147012608469, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.287914701260847, 0.0009710381244695355],
[286.5860872874392, 708.995373728956, 0, 1, 0.2878579990781083, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7121420009218917, 1, 0.000971752805237984],
[286.4740515294103, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466831, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.000971850583683731],
[286.7248253294892, 709.0496932690711, 0, 1, 0.2879415168536567, 0, 0.001410338386001556, 0.008903388054001052, 0.7120584831463432, 1, 0.0009713875840720159],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009716502072971487],
[286.2386165224702, 709.5359020760902, 0, 1, 0.2874532448624198, 0, 0.00140937195295406, 0.008897287015742807, 0.7125467551375801, 1, 0.0009718149595972335],
[286.5860872874392, 709.107409486985, 0, 1, 0.2878256092018704, 0, 0.001410223594650443, 0.008902663382564508, 0.7121743907981296, 1, 0.0009718354220133858],
[286.5551426175812, 709.0263183988142, 1, 1, 0.287826917071191, 0.003489729728335528, 0.001410384881422016, -0.01312678875787047, 0.917155665809294, 0.4928094999516756, 0.001944356806371556],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.4026133825502, 709.2957372176447, 0, 1, 0.2876399395559008, 0, 0.001409849160975789, 0.008900299603531742, 0.7123600604440992, 1, 0.0009720569817223568],
[286.0860872874392, 709.6884313111212, 0, 1, 0.287300068383024, 0, 0.00140906904478144, 0.008895374773239637, 0.712699931616976, 1, 0.000971767615940157],
[286.393029705274, 709.3814888932865, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.00889922371472344, 0.7123916867160451, 1, 0.0009718327359769097],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5669199328868, 710.0455550174012, 0, 0, 0.2875409721789616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003544660121832938],
[286.576503610163, 709.6169931642612, 0, 1, 0.2876715262025594, 0, 0.00140921089775611, 0.008896270283205641, 0.7123284737974407, 1, 0.0006168841584439989],
[286.454036473333, 709.3204821252275, 1, 0, 0.2876695789288568, 0.003490961455148123, 0, -0.02203824615797534, 1, 0.2876695789288568, 0.0009713907572096829],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009718149649023802],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.3620157713813, 709.4125028271791, 0, 1, 0.2875771677451672, 0, 0.001409617107134086, 0.008898834660492108, 0.7124228322548328, 1, 0.0009722860834352467],
[286.4740515294102, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466832, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.0009716726727911756],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.00097185748672647],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009713700029322241],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009713141148793972],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009713121980348357],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009716505594726609],
[286.6981230454682, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878823112846369, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.2878823112846369, 0.0009710911045405015],
[286.4740515294102, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2877220508621824, 0.003490717552466832, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2877220508621825, 0.0009718149239116062],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009727960805190378],
[286.6981230454682, 709.0763955530923, 2, 0, 0.2879147012608469, 0.006975978701063261, 0, -0.04403896685255782, 0.9999999999999997, 0.08289487520212302, 0.001942741026689231],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.000971552896844977],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009720478713252816],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.1999721231088, 709.4659073952214, 0, 0, 0.2874457968385567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003518323980816113],
[286.393029705274, 709.3271693531713, 0, 1, 0.2876240031849185, 0, 0.001409786686885109, 0.008899905208060298, 0.7123759968150815, 1, 0.0006194521694689999],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 0, 0.2878021900889537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003518311561629567],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0006194534256714939],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 0, 0.2878021900889537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003518668558621801],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0006194222800973157],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.3620157713813, 709.4125028271791, 0, 0, 0.2875771677451672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003519012723754063],
[286.4740515294103, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466831, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.0006193929423382227],
[285.3995219724594, 707.3931355908826, 0, 1.75, 0.2874714269875132, 0, 0.00247387189944702, 0.01561741617138484, 0.5525912427109186, 1, 0.0009734262818417448],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009716752602033394],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009716846028845635],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.4740515294102, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466832, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.0009717971174398363],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009711966091926547],
[286.393029705274, 709.3814888932865, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.00889922371472344, 0.7123916867160452, 1, 0.000971330508859647],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009727521982496023],
[286.5860872874392, 709.1074094869849, 0, 1, 0.2878256092018704, 0, 0.001410223594650444, 0.008902663382564509, 0.7121743907981296, 1, 0.0009718505836998222],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009716502073055759],
[286.393029705274, 709.3814888932865, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.00889922371472344, 0.7123916867160451, 1, 0.0009717704572274199],
[286.6981230454682, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878823112846369, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.2878823112846369, 0.0009711787681395056],
[286.6170319572972, 709.1574866412633, 1, 0, 0.2878332660697907, 0.003488976189485449, 0, -0.02202571328589265, 1, 0.2878332660697906, 0.0009717589902096213],
[286.576503610163, 709.274182986763, 0, 1, 0.287770553826164, 0, 0.001409892005076213, 0.008900570075962818, 0.7122294461738361, 1, 0.0009713700029322241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.7248253294892, 709.0496932690711, 0, 1, 0.2879415168536567, 0, 0.001410338386001556, 0.008903388054001052, 0.7120584831463432, 1, 0.0009709242061687089],
[286.7248253294893, 708.8876496207985, 0, 1, 0.2879883815676434, 0, 0.00141066077330438, 0.008905423267173449, 0.7120116184323566, 1, 0.0009718480840400631],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5860872874392, 709.1074094869849, 0, 1, 0.2878256092018704, 0, 0.001410223594650444, 0.008902663382564509, 0.7121743907981296, 1, 0.0009713460279234479],
[286.5860872874392, 708.995373728956, 0, 1, 0.2878579990781083, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7121420009218917, 1, 0.0009714875090969228],
[286.5551426175812, 709.2193759809793, 1, 0, 0.2877711141081166, 0.003489729728335528, 0, -0.02203047033488359, 1, 0.2877711141081165, 0.000971179613207698],
[286.393029705274, 709.3814888932865, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.00889922371472344, 0.7123916867160452, 1, 0.0009717704643419511],
[286.6981230454682, 709.0763955530923, 1, 0, 0.2879147012608469, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.287914701260847, 0.0009710204747840433],
[286.5860872874392, 709.195118539065, 1, 0, 0.2878002573362198, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878002573362198, 0.0009711784410454232],
[286.7405004702431, 708.8409605461521, 0, 1, 0.2880130975696433, 0, 0.001410753688993246, 0.008906009838766825, 0.7119869024303567, 1, 0.0009717704643419511],
[286.7791448696045, 708.995373728956, 0, 1, 0.2879960668939526, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7120039331060475, 1, 0.0009713932015126599],
[286.4740515294102, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2877220508621824, 0.003490717552466832, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2877220508621825, 0.000971850583674922],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009717528123727682],
[286.2386165224702, 709.5359020760902, 0, 1, 0.2874532448624198, 0, 0.00140937195295406, 0.008897287015742807, 0.7125467551375801, 1, 0.0009713305088436901],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.8854599056731, 709.1665347769874, 0, 1, 0.2880225745615559, 0, 0.001410106020181101, 0.008901921141456848, 0.7119774254384441, 1, 0.0009710725089026729],
[286.5241979477232, 709.5277967349374, 0, 1, 0.2876598806862578, 0, 0.001409388053014611, 0.008897388654532618, 0.7123401193137422, 1, 0.0009709055843471537],
[286.5241979477232, 709.5277967349374, 0, 1, 0.2876598806862578, 0, 0.001409388053014611, 0.008897388654532618, 0.7123401193137422, 1, 0.0009705528257771663],
[286.5241979477232, 709.5277967349374, 0, 1, 0.2876598806862578, 0, 0.001409388053014611, 0.008897388654532618, 0.7123401193137422, 1, 0.0009708360058047908],
[286.5551426175812, 709.3581140230293, 1, 0, 0.2877310254752324, 0.003489729728335528, 0, -0.02203047033488359, 1, 0.2877310254752323, 0.0009706391766996007],
[286.3310711015233, 709.5821855390872, 1, 0, 0.2875060344787136, 0.003492460654559679, 0, -0.02204771052075798, 1, 0.2875060344787136, 0.0009717389213220615],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.4740515294103, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466831, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.0009718415742285606],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[285.4794073690486, 707.3319507415587, 1, 1.75, 0.2875464760116532, 0.003502879626996238, 0.00247408589158926, -0.006494717824296316, 0.830505551714436, 0.6063769863037101, 0.001945183775213564],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.0842033396663, 709.8833728410593, 0, 1, 0.2872424867852869, 0, 0.001408682099424094, 0.008892932008647577, 0.712757513214713, 1, 0.0009800430876627903],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[285.193528816315, 707.7073455078083, 0.25, 1.5, 0.2872326293502852, 0.0008765977301014353, 0.002119520179522356, 0.007846500526442981, 0.6503969855211934, 0.4470846234569325, 0.0009731480778974043],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2386165224702, 709.5359020760902, 0, 1, 0.2874532448624198, 0, 0.00140937195295406, 0.008897287015742807, 0.7125467551375801, 1, 0.0009719530691406057],
[286.4316741046354, 709.5359020760902, 0, 1, 0.2875913643725488, 0, 0.00140937195295406, 0.008897287015742807, 0.7124086356274512, 1, 0.0009720392682201392],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009721694350765506],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5978262582389, 709.4298218817431, 0.5, 2.5, 0.2877408340957623, 0.001744604997629937, 0.003523956736649185, 0.01123294889672845, 0.5803004694786404, 0.6386615807134799, 0.002927513080789181]
],
"NAMES": [
["epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1"],
["epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2"],
["epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1"],
["epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2"],
["epi_isl_425585_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_425485_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2"],
["epi_isl_420911_Munich_20200319_null_3"],
["epi_isl_421954_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24"],
["epi_isl_425501_England_20200315_null_3"],
["epi_isl_426887_Czech_Republic_20200331_null_2"],
["epi_isl_425170_Wisconsin_20200331_null_1"],
["epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1"],
["Node400"],
["epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1"],
["epi_isl_417950_Kinshasa_20200320_null_1"],
["epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1"],
["epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1"],
["epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1"],
["epi_isl_423346_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_23"],
["epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1"],
["epi_isl_422342_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_427010_Victoria_20200330_null_3"],
["epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_420839_Kinshasa_20200322_null_3"],
["epi_isl_425197_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3"],
["epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5"],
["epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1"],
["epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3"],
["epi_isl_420640_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1"],
["epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1"],
["epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1"],
["epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1"],
["epi_isl_420312_Norway_20200318_null_5"],
["epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1"],
["epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1"],
["epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1"],
["epi_isl_427547_New_York_20200314_null_11"],
["epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3"],
["Node361"],
["epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1"],
["epi_isl_425666_Scotland_20200313_null_1"],
["epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1"],
["epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2"],
["epi_isl_420725_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_426721_Victoria_20200325_null_2"],
["epi_isl_423913_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_420903_Munich_20200314_null_1"],
["epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1"],
["epi_isl_423752_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425240_England_20200331_null_4"],
["epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1"],
["epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1"],
["epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1"],
["epi_isl_422239_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_427631_New_York_20200406_null_6"],
["epi_isl_424510_Reykjavik_20200320_null_5"],
["epi_isl_425404_England_20200319_null_1"],
["Node322"],
["epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_419798_Victoria_20200315_null_2"],
["epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1"],
["epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_2"],
["epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_2"],
["epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2"],
["epi_isl_423548_England_20200331_null_3"],
["epi_isl_428322_Wisconsin_20200326_null_2"],
["epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2"],
["epi_isl_427715_New_South_Wales_20200322_null_78"],
["Node270"],
["epi_isl_421775_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_421895_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_425336_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_427088_Victoria_20200402_null_46"],
["epi_isl_423446_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_423453_England_20200329_null_1"],
["Node273"],
["epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1"],
["epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_421669_India_20200312_null_1"],
["epi_isl_420443_Hasselt_20200304_null_3"],
["epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1"],
["epi_isl_424239_Washington_20200321_null_7"],
["epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2"],
["epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1"],
["epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2"],
["epi_isl_424332_Washington_20200322_null_1"],
["epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_427253_Washington_20200331_null_2"],
["epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2"],
["epi_isl_417240_England_20200303_null_4"],
["epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_418677_England_20200315_null_1"],
["epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3"],
["epi_isl_426883_Czech_Republic_20200327_null_2"],
["epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4"],
["epi_isl_421964_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_3"],
["Node248"],
["epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_426517_Arizona_20200314_null_4"],
["epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1"],
["Node230"],
["epi_isl_423412_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_425549_England_20200322_null_4"],
["epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1"],
["epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1"],
["Node216"],
["epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1"],
["epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1"],
["epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1"],
["epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2"],
["epi_isl_417236_England_20200301_null_1"],
["epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1"],
["epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_10"],
["epi_isl_420726_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_424188_Washington_20200320_null_3"],
["Node210"],
["epi_isl_424371_Reykjavik_20200301_null_3"],
["epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1"],
["Node207"],
["epi_isl_423373_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_426515_Arizona_20200313_null_5"],
["Node204"],
["epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_426819_Victoria_20200325_null_10"],
["Node201"],
["epi_isl_423324_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_423465_England_20200330_null_4"],
["Node197"],
["epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1"],
["epi_isl_425023_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2"],
["epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_414010_England_20200226_null_1"],
["epi_isl_423068_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423130_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423164_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_423173_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423481_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423579_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_422729_Netherlands_20200323_null_1"],
["epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1"],
["epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1"],
["epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2"],
["epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3"],
["epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1"],
["epi_isl_423354_England_20200329_null_2"],
["epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1"],
["epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1"],
["epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1"],
["epi_isl_423740_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423772_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_423933_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_424138_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423227_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423328_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_423780_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423825_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1"],
["epi_isl_423060_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_421963_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_421956_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3"],
["epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1"],
["epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_1"],
["Node14"],
["epi_isl_425056_Ghent_20200325_null_1"],
["epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2"],
["epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_46"],
["epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1"],
["epi_isl_427482_New_York_20200401_null_7"],
["epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1"],
["epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4"],
["epi_isl_421948_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421847_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_346"],
["epi_isl_420697_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_420696_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1"],
["epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1"],
["epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2"],
["Node106"],
["epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1"],
["epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1"],
["Node117"],
["epi_isl_420694_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_418715_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_428385_Connecticut_20200404_null_8233"],
["epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1"],
["epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2"],
["epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1"],
["epi_isl_417312_England_20200308_null_1"],
["epi_isl_423052_England_20200319_null_5"],
["epi_isl_423648_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1"],
["epi_isl_422002_England_20200330_null_2"],
["epi_isl_424062_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_426429_Nevada_20200307_null_76"],
["epi_isl_423639_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_417288_England_20200305_null_1"],
["epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1"],
["Node146"],
["epi_isl_424007_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_421953_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421947_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1"],
["epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_423927_England_20200318_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[286.4473492453891, 709.3271693531713, 0, 1, 0.2876628633242506, 0, 0.001409786686885109, 0.008899905208060298, 0.7123371366757494, 1, 0.0009713319108836175],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009709065608074671],
[286.6170319572973, 709.1574866412633, 1, 0, 0.2878332660697908, 0.003488976189485448, 0, -0.02202571328589264, 1, 0.2878332660697908, 0.0009713497017759323],
[286.6671091115755, 709.1074094869849, 0, 1, 0.2878835557220594, 0, 0.001410223594650444, 0.008902663382564509, 0.7121164442779406, 1, 0.0009710381244695355],
[286.5860872874392, 709.1140967149288, 0, 1, 0.2878236761345799, 0, 0.001410210295681106, 0.008902579426908258, 0.7121763238654201, 1, 0.0009716362921927588],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009711796131814184],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009713961342029672],
[286.709555800385, 709.0106432580602, 0, 1, 0.2879418897713415, 0, 0.001410416062874289, 0.008903878423792887, 0.7120581102286585, 1, 0.0009717704572046159],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009718505783943753],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009717589896067164],
[286.5860872874392, 708.995373728956, 0, 1, 0.2878579990781083, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7121420009218917, 1, 0.0009713700029322241],
[286.4740515294102, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466832, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.0009718149239116062],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.3525013581398, 709.3133781601905, 0, 1, 0.2875989900313421, 0, 0.001409814097393439, 0.008900078249079985, 0.7124010099686579, 1, 0.0009714891114032347],
[286.393029705274, 709.3271693531713, 0, 1, 0.2876240031849185, 0, 0.001409786686885109, 0.008899905208060298, 0.7123759968150815, 1, 0.0009715728926257594],
[286.4740515294102, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466832, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.0009713195705479172],
[286.7791448696045, 708.995373728956, 0, 1, 0.2879960668939526, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7120039331060475, 1, 0.0009711974193939554],
[286.7405004702431, 708.9219823702884, 0, 1, 0.2879896605646919, 0, 0.001410592455683895, 0.008904991981822256, 0.7120103394353081, 1, 0.0009713305088436901],
[286.5860872874392, 708.995373728956, 0, 1, 0.2878579990781083, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7121420009218917, 1, 0.0009730181079779704],
[286.5860872874392, 709.3656474496652, 1, 0, 0.2877509795824471, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2877509795824471, 0.0009711796131814184],
[286.576503610163, 709.3752311269413, 0, 1, 0.287741356950203, 0, 0.001409691170653592, 0.008899302219385312, 0.712258643049797, 1, 0.0009717704643419511],
[286.5551426175812, 709.3581140230293, 1, 0, 0.2877310254752324, 0.003489729728335528, 0, -0.02203047033488359, 1, 0.2877310254752323, 0.000971393166575362],
[286.4740515294103, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466831, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.000971850583674922],
[286.5860872874392, 709.134111771006, 0, 1, 0.2878178905664819, 0, 0.001410170493001076, 0.008902328154795545, 0.7121821094335181, 1, 0.0009730181079779704],
[286.6981230454682, 709.0763955530922, 1, 0, 0.2879147012608469, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.287914701260847, 0.0009710381187498524],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009711788090388364],
[286.5860872874392, 709.2894794512996, 0, 1, 0.2877729877698899, 0, 0.0014098615994891, 0.00890037812717679, 0.7122270122301102, 1, 0.0009717516447259358],
[286.5860872874392, 709.134111771006, 0, 1, 0.2878178905664819, 0, 0.001410170493001076, 0.008902328154795545, 0.7121821094335181, 1, 0.0009730181079779704],
[286.4473492453891, 709.3271693531713, 0, 1, 0.2876628633242506, 0, 0.001409786686885109, 0.008899905208060298, 0.7123371366757494, 1, 0.0009718505783943753],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009717704643419511],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009714108581599694],
[286.5860872874392, 709.0873831709428, 0, 1, 0.2878313983353423, 0, 0.001410263422722508, 0.008902914814975729, 0.7121686016646577, 1, 0.000971410817312897],
[286.5860872874392, 709.5312414886195, 0, 1, 0.2877031440057076, 0, 0.001409381210476325, 0.00889734545796771, 0.7122968559942924, 1, 0.0009720614447643086],
[287.0050654633029, 708.7694531352574, 0, 1, 0.2882229461617776, 0, 0.001410896019257712, 0.008906908361836852, 0.7117770538382224, 1, 0.0009717971531159365],
[286.5097260507737, 709.2647925477867, 0, 1, 0.2877255048201109, 0, 0.001409910671595369, 0.008900687916663541, 0.7122744951798891, 1, 0.0009713497429769431],
[286.7791448696045, 708.995373728956, 0, 1, 0.2879960668939526, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7120039331060475, 1, 0.000971410817312897],
[285.6671091115755, 710.1074094869849, 0, 1, 0.2868793123102, 0, 0.001408237664668852, 0.008890126316673314, 0.7131206876898, 1, 0.0009720614447412462],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009718505426686572],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009713931606760376],
[286.5860872874392, 708.9953737289561, 0, 1, 0.2878579990781083, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313157, 0.7121420009218917, 1, 0.0009717704572274199],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.000971178802977245],
[286.6575946983339, 709.2941400387705, 0, 1, 0.2878227776509685, 0, 0.001409852335654908, 0.008900319645105044, 0.7121772223490315, 1, 0.0009711973168161633],
[286.5551426175812, 709.2193759809792, 1, 0, 0.2877711141081166, 0.003489729728335528, 0, -0.02203047033488359, 1, 0.2877711141081165, 0.0009712149862504837],
[286.393029705274, 709.3814888932864, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.008899223714723441, 0.7123916867160452, 1, 0.0009712963135495525],
[286.2309167929668, 709.5436018055937, 1, 0, 0.2874455124597929, 0.003493682692297381, 0, -0.02205542517725701, 1, 0.287445512459793, 0.0009716420701787075],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.393029705274, 709.3814888932864, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.008899223714723441, 0.7123916867160452, 1, 0.0009715729332828862],
[286.5860872874392, 709.195118539065, 0, 1, 0.2878002573362198, 0, 0.001410049186548252, 0.008901562353883036, 0.7121997426637802, 1, 0.0009710207101661449],
[286.6981230454682, 709.0763955530923, 1, 0, 0.2879147012608469, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.287914701260847, 0.0009711788090288345],
[286.5860872874392, 709.1074094869849, 0, 1, 0.2878256092018704, 0, 0.001410223594650444, 0.008902663382564509, 0.7121743907981296, 1, 0.0009727704159544025],
[286.393029705274, 709.3814888932864, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.008899223714723441, 0.7123916867160452, 1, 0.0009713961342029672],
[286.7248253294893, 709.0496932690711, 0, 1, 0.2879415168536567, 0, 0.001410338386001556, 0.008903388054001052, 0.7120584831463432, 1, 0.0009711966091926547],
[286.7386165224702, 709.0359020760902, 0, 1, 0.2879553665683495, 0, 0.001410365817967684, 0.008903561230482634, 0.7120446334316506, 1, 0.0009714108579797669],
[286.576503610163, 709.2741829867629, 0, 1, 0.287770553826164, 0, 0.001409892005076213, 0.008900570075962818, 0.7122294461738361, 1, 0.0009717528123902138],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.000970906567022404],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009718683959598818],
[286.6981230454682, 709.0763955530923, 1, 0, 0.2879147012608469, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.287914701260847, 0.0009710381244534028],
[286.6404068275543, 709.134111771006, 0, 1, 0.2878567401292495, 0, 0.001410170493001076, 0.008902328154795545, 0.7121432598707504, 1, 0.0009727521982496023],
[286.5551426175812, 709.3581140230293, 1, 0, 0.2877310254752324, 0.003489729728335528, 0, -0.02203047033488359, 1, 0.2877310254752323, 0.0009711796192314408],
[286.5860872874392, 709.195118539065, 1, 0, 0.2878002573362198, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878002573362198, 0.0009713932015126599],
[286.688539368192, 709.5049574062323, 0, 1, 0.2877839900546039, 0, 0.001409433421939352, 0.008897675066039652, 0.7122160099453961, 1, 0.0009813604103281375],
[286.3215222943793, 709.2599387220159, 1, 0, 0.2875922599061577, 0.003492577127931926, 0, -0.02204844581070071, 1, 0.2875922599061577, 0.0009718505838651347],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.000972045263644634],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.000971681188655633],
[286.5551426175812, 709.3581140230293, 1, 0, 0.2877310254752324, 0.003489729728335527, 0, -0.02203047033488358, 1, 0.2877310254752324, 0.0009709242061786959],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.0031815155301, 709.7713370830303, 1, 0, 0.2872168108077792, 0.003496464601201297, 0, -0.02207298721396273, 1, 0.2872168108077792, 0.0009718472889320558],
[286.2386165224702, 709.5359020760902, 0, 1, 0.2874532448624198, 0, 0.00140937195295406, 0.008897287015742807, 0.7125467551375801, 1, 0.0009713459870278156],
[286.6266156345735, 709.0717349656215, 0, 1, 0.287864909549964, 0, 0.001410294545231709, 0.008903111289651156, 0.7121350904500361, 1, 0.0009730156599296057],
[286.4473492453891, 709.3271693531713, 0, 1, 0.2876628633242506, 0, 0.001409786686885109, 0.008899905208060298, 0.7123371366757494, 1, 0.0009713319466384183],
[286.4335580524082, 709.2647925477867, 0, 1, 0.2876710179139591, 0, 0.001409910671595369, 0.008900687916663541, 0.7123289820860409, 1, 0.0009720452204838639],
[286.2386165224702, 709.5359020760902, 0, 1, 0.2874532448624198, 0, 0.00140937195295406, 0.008897287015742807, 0.7125467551375801, 1, 0.0009716811821644079],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009711788029872374],
[286.2386165224702, 709.5359020760902, 0, 1, 0.2874532448624198, 0, 0.00140937195295406, 0.008897287015742807, 0.7125467551375801, 1, 0.0009717589896039946],
[286.7405004702431, 708.8409605461521, 0, 1, 0.2880130975696433, 0, 0.001410753688993246, 0.008906009838766825, 0.7119869024303567, 1, 0.0009713700029322241],
[286.5860872874392, 708.995373728956, 0, 1, 0.2878579990781083, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7121420009218917, 1, 0.0009718149595972335],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009719040103137906],
[287.352536228272, 708.4219823702883, 0, 1, 0.2885718913883116, 0, 0.001411588043406176, 0.008911277071926342, 0.7114281086116885, 1, 0.000971400081320209],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009718205324384466],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.6981230454682, 709.0763955530922, 1, 0, 0.2879147012608469, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.287914701260847, 0.0005158445037830769],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 0, 0.2878021900889537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004548634409812107],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[287.1804950782998, 708.4853844400302, 0, 1, 0.2884305879972789, 0, 0.001411461720964612, 0.008910479605354961, 0.7115694120027211, 1, 0.0009710917498962236],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.6399667311656, 709.0259127871644, 0, 1, 0.287887706737357, 0, 0.001410385688259295, 0.008903686670532138, 0.712112293262643, 1, 0.0009724658238253526],
[286.709555800385, 709.0106432580603, 0, 1, 0.2879418897713414, 0, 0.001410416062874288, 0.008903878423792885, 0.7120581102286585, 1, 0.0009717109594627845],
[286.3282787863578, 709.0272616363389, 0, 1, 0.287664324111526, 0, 0.001410383005150092, 0.008903669732212462, 0.712335675888474, 1, 0.0009713319520717607],
[286.4335580524083, 709.3409605461522, 0, 1, 0.2876490136095579, 0, 0.001409759277442623, 0.008899732173769225, 0.712350986390442, 1, 0.0009713961341946465],
[286.5860872874392, 708.995373728956, 0, 1, 0.2878579990781083, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7121420009218917, 1, 0.0009717704572046159],
[286.5860872874392, 709.2894794512997, 0, 1, 0.2877729877698899, 0, 0.001409861599489099, 0.008900378127176789, 0.7122270122301102, 1, 0.0009713497429769431],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009714108579636595],
[286.393029705274, 709.3814888932864, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.008899223714723441, 0.7123916867160452, 1, 0.0009717528124580953],
[286.5860872874392, 709.195118539065, 0, 1, 0.2878002573362198, 0, 0.001410049186548252, 0.008901562353883036, 0.7121997426637802, 1, 0.0009711974193776776],
[286.6981230454682, 709.0763955530923, 1, 0, 0.2879147012608469, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.287914701260847, 0.0009710381244695355],
[286.5860872874392, 708.995373728956, 0, 1, 0.2878579990781083, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7121420009218917, 1, 0.000971752805237984],
[286.4740515294103, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466831, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.000971850583683731],
[286.7248253294892, 709.0496932690711, 0, 1, 0.2879415168536567, 0, 0.001410338386001556, 0.008903388054001052, 0.7120584831463432, 1, 0.0009713875840720159],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009716502072971487],
[286.2386165224702, 709.5359020760902, 0, 1, 0.2874532448624198, 0, 0.00140937195295406, 0.008897287015742807, 0.7125467551375801, 1, 0.0009718149595972335],
[286.5860872874392, 709.107409486985, 0, 1, 0.2878256092018704, 0, 0.001410223594650443, 0.008902663382564508, 0.7121743907981296, 1, 0.0009718354220133858],
[286.5551426175812, 709.0263183988142, 1, 1, 0.287826917071191, 0.003489729728335528, 0.001410384881422016, -0.01312678875787047, 0.917155665809294, 0.4928094999516756, 0.001944356806371556],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.4026133825502, 709.2957372176447, 0, 1, 0.2876399395559008, 0, 0.001409849160975789, 0.008900299603531742, 0.7123600604440992, 1, 0.0009720569817223568],
[286.0860872874392, 709.6884313111212, 0, 1, 0.287300068383024, 0, 0.00140906904478144, 0.008895374773239637, 0.712699931616976, 1, 0.000971767615940157],
[286.393029705274, 709.3814888932865, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.00889922371472344, 0.7123916867160451, 1, 0.0009718327359769097],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5669199328868, 710.0455550174012, 0, 0, 0.2875409721789616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003544660121832938],
[286.576503610163, 709.6169931642612, 0, 1, 0.2876715262025594, 0, 0.00140921089775611, 0.008896270283205641, 0.7123284737974407, 1, 0.0006168841584439989],
[286.454036473333, 709.3204821252275, 1, 0, 0.2876695789288568, 0.003490961455148123, 0, -0.02203824615797534, 1, 0.2876695789288568, 0.0009713907572096829],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009718149649023802],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.3620157713813, 709.4125028271791, 0, 1, 0.2875771677451672, 0, 0.001409617107134086, 0.008898834660492108, 0.7124228322548328, 1, 0.0009722860834352467],
[286.4740515294102, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466832, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.0009716726727911756],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.00097185748672647],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009713700029322241],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009713141148793972],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009713121980348357],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009716505594726609],
[286.6981230454682, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878823112846369, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.2878823112846369, 0.0009710911045405015],
[286.4740515294102, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2877220508621824, 0.003490717552466832, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2877220508621825, 0.0009718149239116062],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009727960805190378],
[286.6981230454682, 709.0763955530923, 2, 0, 0.2879147012608469, 0.006975978701063261, 0, -0.04403896685255782, 0.9999999999999997, 0.08289487520212302, 0.001942741026689231],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.000971552896844977],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009720478713252816],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.1999721231088, 709.4659073952214, 0, 0, 0.2874457968385567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003518323980816113],
[286.393029705274, 709.3271693531713, 0, 1, 0.2876240031849185, 0, 0.001409786686885109, 0.008899905208060298, 0.7123759968150815, 1, 0.0006194521694689999],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 0, 0.2878021900889537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003518311561629567],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0006194534256714939],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 0, 0.2878021900889537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003518668558621801],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0006194222800973157],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.3620157713813, 709.4125028271791, 0, 0, 0.2875771677451672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003519012723754063],
[286.4740515294103, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466831, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.0006193929423382227],
[285.3991748914331, 707.3937792656044, 0, 1, 0.2874709915057368, 0, 0.001413639799092057, 0.008924229691839914, 0.7125290084942633, 1, 0.0009734262818417448],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009716752602033394],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009716846028845635],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.4740515294102, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466832, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.0009717971174398363],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009711966091926547],
[286.393029705274, 709.3814888932865, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.00889922371472344, 0.7123916867160452, 1, 0.000971330508859647],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009727521982496023],
[286.5860872874392, 709.1074094869849, 0, 1, 0.2878256092018704, 0, 0.001410223594650444, 0.008902663382564509, 0.7121743907981296, 1, 0.0009718505836998222],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009716502073055759],
[286.393029705274, 709.3814888932865, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.00889922371472344, 0.7123916867160451, 1, 0.0009717704572274199],
[286.6981230454682, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878823112846369, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.2878823112846369, 0.0009711787681395056],
[286.6170319572972, 709.1574866412633, 1, 0, 0.2878332660697907, 0.003488976189485449, 0, -0.02202571328589265, 1, 0.2878332660697906, 0.0009717589902096213],
[286.576503610163, 709.274182986763, 0, 1, 0.287770553826164, 0, 0.001409892005076213, 0.008900570075962818, 0.7122294461738361, 1, 0.0009713700029322241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.7248253294892, 709.0496932690711, 0, 1, 0.2879415168536567, 0, 0.001410338386001556, 0.008903388054001052, 0.7120584831463432, 1, 0.0009709242061687089],
[286.7248253294893, 708.8876496207985, 0, 1, 0.2879883815676434, 0, 0.00141066077330438, 0.008905423267173449, 0.7120116184323566, 1, 0.0009718480840400631],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5860872874392, 709.1074094869849, 0, 1, 0.2878256092018704, 0, 0.001410223594650444, 0.008902663382564509, 0.7121743907981296, 1, 0.0009713460279234479],
[286.5860872874392, 708.995373728956, 0, 1, 0.2878579990781083, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7121420009218917, 1, 0.0009714875090969228],
[286.5551426175812, 709.2193759809793, 1, 0, 0.2877711141081166, 0.003489729728335528, 0, -0.02203047033488359, 1, 0.2877711141081165, 0.000971179613207698],
[286.393029705274, 709.3814888932865, 0, 1, 0.2876083132839548, 0, 0.001409678735147305, 0.00889922371472344, 0.7123916867160452, 1, 0.0009717704643419511],
[286.6981230454682, 709.0763955530923, 1, 0, 0.2879147012608469, 0.003487989350531631, 0, -0.02201948342627891, 1, 0.287914701260847, 0.0009710204747840433],
[286.5860872874392, 709.195118539065, 1, 0, 0.2878002573362198, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878002573362198, 0.0009711784410454232],
[286.7405004702431, 708.8409605461521, 0, 1, 0.2880130975696433, 0, 0.001410753688993246, 0.008906009838766825, 0.7119869024303567, 1, 0.0009717704643419511],
[286.7791448696045, 708.995373728956, 0, 1, 0.2879960668939526, 0, 0.001410446438797629, 0.008904070185313159, 0.7120039331060475, 1, 0.0009713932015126599],
[286.4740515294102, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2877220508621824, 0.003490717552466832, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2877220508621825, 0.000971850583674922],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 1, 0, 0.2878021900889537, 0.003489352918228103, 0, -0.02202809155356247, 1, 0.2878021900889537, 0.0009717528123727682],
[286.2386165224702, 709.5359020760902, 0, 1, 0.2874532448624198, 0, 0.00140937195295406, 0.008897287015742807, 0.7125467551375801, 1, 0.0009713305088436901],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.8854599056731, 709.1665347769874, 0, 1, 0.2880225745615559, 0, 0.001410106020181101, 0.008901921141456848, 0.7119774254384441, 1, 0.0009710725089026729],
[286.5241979477232, 709.5277967349374, 0, 1, 0.2876598806862578, 0, 0.001409388053014611, 0.008897388654532618, 0.7123401193137422, 1, 0.0009709055843471537],
[286.5241979477232, 709.5277967349374, 0, 1, 0.2876598806862578, 0, 0.001409388053014611, 0.008897388654532618, 0.7123401193137422, 1, 0.0009705528257771663],
[286.5241979477232, 709.5277967349374, 0, 1, 0.2876598806862578, 0, 0.001409388053014611, 0.008897388654532618, 0.7123401193137422, 1, 0.0009708360058047908],
[286.5551426175812, 709.3581140230293, 1, 0, 0.2877310254752324, 0.003489729728335528, 0, -0.02203047033488359, 1, 0.2877310254752323, 0.0009706391766996007],
[286.3310711015233, 709.5821855390872, 1, 0, 0.2875060344787136, 0.003492460654559679, 0, -0.02204771052075798, 1, 0.2875060344787136, 0.0009717389213220615],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.4740515294103, 709.3004670691502, 1, 0, 0.2876896789170604, 0.003490717552466831, 0, -0.02203670641386818, 1, 0.2876896789170604, 0.0009718415742285606],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[285.4800000479756, 707.3313580626317, 1, 1, 0.2875470729819862, 0.003502872354742706, 0.001413764551226716, -0.01318842176172898, 0.9173166808194922, 0.4924108267834647, 0.001945183775213564],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.0842033396663, 709.8833728410593, 0, 1, 0.2872424867852869, 0, 0.001408682099424094, 0.008892932008647577, 0.712757513214713, 1, 0.0009800430876627903],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[285.1942814966912, 707.7066390551474, 0, 1, 0.2872333740391586, 0, 0.001413014863524653, 0.008920284508243856, 0.7127666259608414, 1, 0.0009731480778974043],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.2386165224702, 709.5359020760902, 0, 1, 0.2874532448624198, 0, 0.00140937195295406, 0.008897287015742807, 0.7125467551375801, 1, 0.0009719530691406057],
[286.4316741046354, 709.5359020760902, 0, 1, 0.2875913643725488, 0, 0.00140937195295406, 0.008897287015742807, 0.7124086356274512, 1, 0.0009720392682201392],
[286.5860872874392, 709.1884313111212, 0, 1, 0.2878021900889537, 0, 0.001410062482479074, 0.008901646290357303, 0.7121978099110463, 1, 0.0009721694350765506],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[286.5978262582389, 709.4298218817431, 0.5, 2.5, 0.2877408340957623, 0.001744604997629937, 0.003523956736649185, 0.01123294889672845, 0.5803004694786404, 0.6386615807134799, 0.002927513080789181]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.6138848356695824, 2.385781500613789, 0, 1, 0.2046510400987445, 0, 0.4191498675560736, 2.646069879878283, 0.7953489599012554, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6141337848485061, 2.385398346067407, 0, 1, 0.2047431926195034, 0, 0.4192171934924875, 2.646494904782903, 0.7952568073804966, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9964474835030925, 2.003552516496911, 0, 2, 0.3321491611676972, 0, 0.9982268912505863, 6.301751031495552, 0.4460247429290105, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 1, 0.2046282785565273, 0, 0.4190912555055218, 2.645699865252089, 0.7953717214434727, 1, 0.1584046856598338],
[0.6329933979880399, 2.215137867132021, 0, 1, 0.2222486743290452, 0, 0.4514391699216077, 2.849910455875345, 0.7777513256709547, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 1.645567722912146, 0, 0, 0.3779907017081524, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8358937631124278, 2.164106236887574, 1, 0, 0.2786312543708091, 1.196324274841491, 0, -7.552328833318338, 1, 0.2786312543708092, 0.1584046856598338],
[0.6145721994760905, 2.385427800523912, 1, 0, 0.2048573998253634, 1.627148121656786, 0, -10.27209589715676, 1, 0.2048573998253633, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 1.645567722912146, 0, 0, 0.3779907017081524, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6329719767209648, 1.532578436793343, 0, 1, 0.2922914990899531, 0, 0.6524951519560253, 4.119165725673206, 0.7077085009100469, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000947283659753, 1.997868359605574, 0, 1, 0.3337808664256032, 0, 0.5005334786909702, 3.15984010577718, 0.6662191335743968, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.986625544112403, 2.013374455887599, 0, 0, 0.3288751813708007, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.7233745341466794, 2.276625465853325, 0, 1, 0.2411248447155594, 0, 0.4392466020427211, 2.772939450705274, 0.7588751552844406, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.162043648272543, 0, 1, 0.2793187839091527, 0, 0.462525352251326, 2.919896910401857, 0.7206812160908473, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3333333333333333, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2952675263019445, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9936056728954737, 2.006394327104529, 1, 1, 0.3312018909651576, 1.006435477653718, 0.4984065128628635, -3.207158694041549, 0.890305307421104, 0.5527090893514189, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.384930807604443, 0, 1, 0.2047090947542743, 0, 0.41929937623828, 2.647013719901598, 0.7952909052457258, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.246184345515469, 1.645130346538964, 0.25, 0.5, 0.4310095849960865, 0.2006123740036154, 0.3039272851855801, 0.6522213074165518, 0.7700878991895965, 0.3448681512156052, 0.1584046856598338],
[0.6145716271698209, 2.385428372830181, 1, 0, 0.2048572090566068, 1.627149636902577, 0, -10.27210546281945, 1, 0.2048572090566068, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.615258888859186, 2.384741111140817, 1, 0, 0.2050862962863952, 1.62533206444884, 0, -10.26063122866933, 1, 0.2050862962863952, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.996932564743622, 2.002600032802618, 0, 2, 0.3323626372852757, 0, 0.998701671447104, 6.304748292558506, 0.4457396480926724, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6329933969200752, 2.013661499698609, 0, 1, 0.239167334482775, 0, 0.4966077963697836, 3.135057490889027, 0.7608326655172249, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0, 1.73389561955592, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6332420024296573, 2.21442200083942, 1, 0, 0.2223724434142176, 1.579175096034605, 0, -9.969244845608959, 1, 0.2223724434142176, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.162043648272543, 0, 0, 0.2793187839091527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.002570389864581, 1.995938606033046, 1, 2, 0.3343563054959101, 0.9974362001006946, 1.002034829104802, 0.02903088999515461, 0.7393757335262834, 0.7050655747135602, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3333333333333333, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6330521902220412, 2.012515532690106, 0, 0, 0.2392878415999118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000757446364519, 1.998909317758572, 0, 1, 0.3336228738251452, 0, 0.5002728193399617, 3.158194577742939, 0.6663771261748548, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.3050584700619183, 2.694941529938082, 0, 0, 0.1016861566873061, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6142496798644727, 2.385750320135529, 1, 0, 0.2047498932881574, 1.628002476485847, 0, -10.27748939183467, 1, 0.2047498932881574, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.246937025891623, 1.644423893878107, 0, 0, 0.4312630143700394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9988160994846047, 2.001183900515398, 0, 1, 0.3329386998282012, 0, 0.4997041999700543, 3.154604915179999, 0.6670613001717988, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8372690234060191, 2.162730976593983, 1, 0, 0.2790896744686728, 1.194359246603905, 0, -7.53992371897844, 1, 0.2790896744686728, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.156472284372475, 0.6666666666666667, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3333333333333333, 0.1584046856598338],
[0.986625544112403, 2.013374455887599, 0, 0, 0.3288751813708007, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0, 1.73389561955592, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.162043648272543, 0, 0, 0.2793187839091527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8372689855906593, 2.000040992706752, 1, 1, 0.2950925320091676, 1.194359300547291, 0.499989752033358, -4.383516469992923, 0.9129203975524185, 0.5031054615707535, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.847664003269077, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2976699506318057, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.384931152450792, 0, 1, 0.2047090712139223, 0, 0.4192993156101738, 2.647013337159724, 0.7952909287860778, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.156472284372475, 0.6666666666666667, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.3050584700619183, 2.694941529938082, 0, 0, 0.1016861566873061, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2123169167405333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8372693611632503, 2.162730638836752, 1, 0, 0.2790897870544166, 1.194358764795432, 0, -7.539920677348258, 1, 0.2790897870544166, 0.1584046856598338],
[0.3118887892039148, 2.688111210796085, 0, 2, 0.1039629297346383, 0, 0.7440168367913986, 4.696937048877063, 0.8028824312897328, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6330521902220412, 2.21399213910223, 0, 1, 0.2223541740118575, 0, 0.4516727870612487, 2.851385267928208, 0.7776458259881425, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9988147957877392, 2.001185204212264, 0, 1, 0.3329382652625795, 0, 0.4997038744315697, 3.15460286007359, 0.6670617347374206, 1, 0.1584046856598338],
[0.695190221309291, 1.951464034097354, 1, 1, 0.2626675622209212, 1.438455216065387, 0.512435782841649, -5.845909351522078, 0.9310057517569185, 0.456340876198761, 0.1584046856598338],
[0.9958067471589349, 2.00372584473198, 2, 3, 0.3319873069060987, 2.008421820504889, 1.497210812490809, -3.227246756525124, 0.7921135357094005, 0.5364331593087156, 0.1584046856598338],
[0.7233747014111813, 2.276625298588823, 0, 1, 0.2411249004703934, 0, 0.4392466343143313, 2.77293965443416, 0.7588750995296065, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2123169167405333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3333333333333333, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6142184082014479, 2.385781591798554, 0, 1, 0.2047394694004825, 0, 0.4191498515361317, 2.646069778745278, 0.7952605305995175, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.847664003269077, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2976699506318057, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9988156647787672, 2.001184335221236, 0, 1, 0.3329385549262553, 0, 0.4997040914221665, 3.1546042299232, 0.6670614450737447, 1, 0.1584046856598338],
[0.6150687326107276, 2.384931267389275, 0, 2, 0.2050229108702424, 0, 0.8385985908052397, 5.294026419181113, 0.6319885722412226, 1, 0.1584046856598338],
[0.9976298463603887, 2.002370153639614, 0, 3, 0.3325432821201292, 0, 1.498224488887352, 9.4582081498821, 0.2973509467688756, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.00034708102636, 1.999356325278189, 0, 0.75, 0.3334819965613621, 0, 0.3751207278650771, 2.368116361599494, 0.7376645508471462, 1, 0.1584046856598338],
[0.8372690108119373, 2.162730989188065, 1, 0, 0.2790896702706456, 1.194359264569287, 0, -7.539923832392905, 1, 0.2790896702706456, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8471957502795934, 2.000468252989485, 0, 1, 0.2975055165591953, 0, 0.4998829641538211, 3.155733443562995, 0.7024944834408047, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0, -12.6258891374899, 1, 0.1111111111111109, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3333333333333333, 0.1584046856598338],
[0.7233742955636979, 2.276625704436306, 0, 1, 0.2411247651878989, 0, 0.4392465560111035, 2.772939160110224, 0.7588752348121011, 1, 0.1584046856598338],
[0.9978693246759739, 2.002130675324029, 1, 1, 0.3326231082253243, 1.002135224794808, 0.4994678980372536, -3.173310970339648, 0.8893618678745241, 0.5546080843251728, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.385781500613789, 0, 1, 0.2046510400987445, 0, 0.4191498675560736, 2.646069879878283, 0.7953489599012554, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3333333333333333, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.307878819917391, 1.307190700094772, 0, 1, 0.5001315681700531, 0, 0.7649993225376372, 4.82939831830755, 0.4998684318299469, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9990646343026823, 1.646503088609464, 0, 1, 0.3776371421718691, 0, 0.6073477826540482, 3.834152885845167, 0.6223628578281309, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9990629473410141, 1.646504775571133, 0, 1, 0.3776365045160444, 0, 0.6073471603828929, 3.834148957481857, 0.6223634954839556, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.951246084336531, 0, 1, 0.2626199012455823, 0, 0.512493020756028, 3.235340031901464, 0.7373800987544177, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -3.156472284372475, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1584046856598338],
[0.9988152780653651, 2.000000853267037, 0, 2, 0.333069863013436, 0, 0.9999995733666637, 6.312941875432355, 0.444795807620917, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6330521902220412, 1.528991458050502, 0, 0, 0.2928026872759231, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8370204879378301, 2.162979512062172, 1, 0, 0.2790068293126099, 1.194713886231988, 0, -7.542162539292411, 1, 0.2790068293126099, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.384929287015322, 0, 1, 0.20470919855478, 0, 0.4192996435762145, 2.64701540759116, 0.79529080144522, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2348553491310671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6145717266476927, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2350563652104023, 1.627149373523421, 0, -10.27210380012144, 1, 0.2350563652104023, 0.1584046856598338],
[0.6330521902220412, 2.214611813047036, 0, 0, 0.2223057880056447, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.384930829117986, 0, 1, 0.2047090932856885, 0, 0.4192993724559417, 2.647013696023906, 0.7952909067143115, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3333333333333333, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2952675263019445, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6330521902220412, 1.528991458050502, 0, 0, 0.2928026872759231, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6177065600196514, 2.400969863283268, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.157424642572171],
[0.8529411138503099, 2.012450948868614, 0, 0, 0.2976699506318057, 0, 0, 0, 1, 1, 0.157424642572171],
[0.6177065600196514, 2.400969863283268, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.157424642572171],
[1.30572123085881, 1.309358043902861, 0, 1, 0.4993046457369094, 0, 0.7637330405205714, 4.821404350125414, 0.5006953542630906, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6145717266766125, 2.38542827332339, 1, 0, 0.2048572422255374, 1.627149373446852, 0, -10.27210379963806, 1, 0.2048572422255374, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 2, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0.9999999999999989, -6.312944568744951, 0.8888888888888891, 0.4074074074074072, 0.1584046856598338],
[0.7857746635530352, 2.214225336446967, 0, 0, 0.2619248878510116, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.469205796991633, 0, 1, 0.3211156289086835, 0, 0.6806398409587099, 4.296841587251719, 0.6788843710913165, 1, 0.1584046856598338],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.7233751047380379, 2.276624895261966, 0, 1, 0.2411250349126789, 0, 0.4392467121312632, 2.772940145688138, 0.758874965087321, 1, 0.1584046856598338],
[0.6157552730200506, 2.384244726979952, 1, 1, 0.20525175767335, 1.624021821356676, 0.4194200321317975, -7.604584322787655, 0.9578717159720005, 0.3683752313187004, 0.1584046856598338],
[0.8358944176413216, 2.16410558235868, 1, 0, 0.278631472547107, 1.196323338085858, 0, -7.552322919631954, 1, 0.2786314725471071, 0.1584046856598338],
[1.308636602023862, 1.306099024046462, 1, 0, 0.5004852456118506, 0.7641540810133676, 0, -4.824062355417634, 1, 0.5004852456118506, 0.1584046856598338],
[0.6951584805316067, 1.955087387099296, 0.5, 2.5, 0.2622996186965174, 0.7192604478012501, 1.278715220862416, 3.531806971054928, 0.6155738217875238, 0.5985420858491368, 0.1584046856598338],
[1.306929671311128, 1.315458847037133, 2, 0, 0.4983737772518587, 1.530304226694598, 0, -9.660725756439113, 1, 0.248376421852285, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.156472284372475, 0.6666666666666667, 1, 0.1584046856598338],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6157555455844648, 2.383060585747936, 1, 3, 0.2053328775815539, 1.624021102482832, 1.258885325006722, -2.305081923272273, 0.8109549429313387, 0.6012130098057529, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8384530244099783, 2.161546975590024, 0, 1, 0.2794843414699926, 0, 0.4626316297044788, 2.920567834072518, 0.7205156585300074, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6958769098130598, 1.949690813099085, 0, 1, 0.263035001442739, 0, 0.5129018371946235, 3.237920867417109, 0.7369649985572611, 1, 0.1584046856598338],
[1.147088319738576, 1.850342520847094, 0, 1, 0.382690504216753, 0, 0.540440479929195, 3.41177079249893, 0.617309495783247, 1, 0.1584046856598338],
[0.6145716646453742, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2350563470704218, 1.627149537681711, 0, -10.27210483644363, 1, 0.2350563470704219, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2348553491310671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8372689855906593, 2.162233455683487, 1, 1, 0.2791359573739834, 1.194359300547291, 0.4624847503730338, -4.620283466525238, 0.9220831173009099, 0.4803550320488764, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.384930753366626, 0, 1, 0.2047090984567275, 0, 0.4192993857739374, 2.647013780099675, 0.7952909015432725, 1, 0.1584046856598338],
[0.9858157641505885, 2.014184235849414, 1, 0, 0.3286052547168625, 1.014388323219434, 0, -6.403777255666427, 1, 0.3286052547168625, 0.1584046856598338],
[0.9991492632184723, 2.000850736781531, 0, 2, 0.3330497544061571, 0, 0.9995748124705698, 6.310260383440343, 0.4448226300976875, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2348553491310671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 1.645567722912146, 0, 0, 0.3779907017081524, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 1, 0.2046282785565273, 0, 0.4190912555055218, 2.645699865252089, 0.7953717214434727, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 1, 0.2046282785565273, 0, 0.4190912555055218, 2.645699865252089, 0.7953717214434727, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6336869089210976, 1.530952423897464, 0, 1, 0.2927448001676927, 0, 0.6531881620816293, 4.123540660181723, 0.7072551998323073, 1, 0.1584046856598338],
[1.308636643740759, 1.306098795295069, 1, 0, 0.5004852973665714, 0.7641540566535595, 0, -4.824062201635515, 1, 0.5004852973665714, 0.1584046856598338],
[0.9964478563932735, 2.002552696680189, 0, 1, 0.3322599775355443, 0, 0.4993626393241933, 3.152448661755813, 0.6677400224644557, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6145716271738664, 2.385428372826135, 1, 0, 0.2048572090579553, 1.627149636891866, 0, -10.27210546275184, 1, 0.2048572090579553, 0.1584046856598338],
[1.836333182299708, 1.162482363319002, 1, 0, 0.6123528287635442, 0.544563486429877, 0, -3.43779910399431, 1, 0.6123528287635442, 0.1584046856598338],
[1.832316977806197, 1.167683022193804, 0, 1, 0.6107723259353988, 0, 0.8563967968988991, 5.406385507673484, 0.3892276740646012, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 1.646654235600604, 1, 0, 0.3778355277953682, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3778355277953682, 0.1584046856598338],
[1.837956351727459, 1.162043648272542, 0, 0, 0.6126521172424861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.156472284372475, 0.6666666666666667, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9983874355657943, 2.001158846131671, 0, 1, 0.3328461513188587, 0, 0.4997104562354181, 3.154644410636448, 0.6671538486811412, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6332419453149094, 2.214422057954168, 1, 0, 0.2223724233575157, 1.579175238467033, 0, -9.969245744776979, 1, 0.2223724233575157, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.951245827958861, 0, 1, 0.2626199266896909, 0, 0.5124930880934002, 3.235340456998562, 0.7373800733103091, 1, 0.1584046856598338],
[1.000946854790314, 1.836322498636549, 0, 1, 0.3527852770063467, 0, 0.5445666546821105, 3.43781910499504, 0.6472147229936533, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.384930807604415, 0, 1, 0.2047090947542761, 0, 0.4192993762382848, 2.647013719901628, 0.7952909052457239, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 6.312944568744951, 0.4444444444444445, 1, 0.1584046856598338],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.161546567783265, 0, 1, 0.2793650728848583, 0, 0.4626317169865703, 2.920568385079523, 0.7206349271151418, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.999149263249788, 2.000850736750215, 0, 1, 0.3330497544165957, 0, 0.4997874062431072, 3.155130191769553, 0.6669502455834042, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.162043648272543, 0, 0, 0.2793187839091527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2348553491310671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8372689855906531, 2.162275054466464, 1, 1, 0.2791320862135799, 1.1943593005473, 0.4624758528913184, -4.620339635834164, 0.9220852784460545, 0.4803494508732146, 0.1584046856598338],
[0.3050584700619183, 2.694941529938082, 0, 0, 0.1016861566873061, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9978679590503188, 2.002132040949684, 0, 1, 0.3326226530167726, 0, 0.4994675573573377, 3.153111003483316, 0.6673773469832274, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.156472284372475, 0.6666666666666667, 1, 0.1584046856598338],
[0.6945616959754138, 1.467481952297128, 1, 0, 0.3212523930913069, 1.439756908269526, 0, -9.089105554373134, 1, 0.3212523930913069, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.156472284372475, 0.6666666666666667, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 1.837997351092991, 1, 0, 0.3523611463607861, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3523611463607861, 0.1584046856598338],
[0.9988161794662673, 2.001183820533736, 0, 1, 0.3329387264887554, 0, 0.4997042199418192, 3.154605041260643, 0.6670612735112446, 1, 0.1584046856598338],
[0.6330521902220412, 2.214611813047036, 0, 0, 0.2223057880056447, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2123169167405333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2123169167405333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.156472284372475, 0.6666666666666667, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9988156432653252, 2.001184356734678, 0, 1, 0.3329385477551081, 0, 0.4997040860501702, 3.154604196010085, 0.6670614522448919, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.3050584700619183, 2.694941529938082, 0, 0, 0.1016861566873061, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.3050584700619183, 2.694941529938082, 0, 0, 0.1016861566873061, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308636693636206, 1.306098521697232, 1, 0, 0.5004853592677548, 0.7641540275180414, 0, -4.824062017704605, 1, 0.5004853592677548, 0.1584046856598338],
[0.9988155673710345, 2.001184432628969, 0, 1, 0.3329385224570111, 0, 0.4997040670990497, 3.154604076372712, 0.6670614775429888, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9994073210730086, 2.000592678926994, 0, 0.75, 0.3331357736910026, 0, 0.3748889056228367, 2.366652880634428, 0.7379519171567052, 1, 0.1584046856598338],
[0.9985464715492723, 2.00145352845073, 1, 1, 0.3328488238497572, 1.00145564427109, 0.499636881788643, -3.167954031107879, 0.8892116604618334, 0.5549093081613476, 0.1584046856598338],
[0.6331832561966568, 2.214947824851638, 1, 1, 0.2223153493214943, 1.579321610629286, 0.4514779033528621, -7.120014806243879, 0.9505758854560619, 0.3952065840990506, 0.1584046856598338],
[0.9988156432739962, 2.001184356726007, 0, 1, 0.3329385477579984, 0, 0.4997040860523354, 3.154604196023754, 0.6670614522420016, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.003787211417283, 1.994546618175404, 2, 1, 0.3347816715771253, 1.992454154876239, 0.5013670730417885, -9.413150094792561, 0.962478082826542, 0.2611924685250058, 0.1584046856598338],
[0.9991488089771469, 2.000851191022856, 0, 1, 0.333049602992382, 0, 0.4997872927715277, 3.155129475429762, 0.666950397007618, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.162043648272543, 0, 0, 0.2793187839091527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2348553491310671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9978682620023969, 2.002131737997606, 0, 1, 0.3326227540007985, 0, 0.4994676329341499, 3.153111480595542, 0.6673772459992015, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 1.837997360159341, 1, 0, 0.3523611452351229, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3523611452351229, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.002214653906330001, 2.997785346093671, 0, 1, 0.0007382179687766667, 0, 0.3335795877790489, 2.105869446913929, 0.9992617820312233, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0, 1.73389561955592, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2123169167405333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -3.156472284372475, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.383745456500497, 0, 1, 0.204790042745789, 0, 0.4195078787766497, 2.648329984868769, 0.7952099572542111, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6956872632982261, 1.949880459613919, 1, 1, 0.2629633168235205, 1.437427494732388, 0.5128519520617189, -5.836794150497221, 0.9308502940051727, 0.4567769276522138, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8372690108119373, 2.000041000166726, 1, 1, 0.2950925374993271, 1.194359264569287, 0.499989750168441, -4.383516254638897, 0.9129203943122082, 0.5031054693108625, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 1.999502911755729, 0, 1, 0.3333885745137219, 0, 0.5001243029558368, 3.157257002042408, 0.6666114254862781, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338]
],
"RESOLVED": [
[0.6138848356695824, 2.385781500613789, 0, 1, 0.2046510400987445, 0, 0.4191498675560736, 2.646069879878283, 0.7953489599012554, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6141337848485061, 2.385398346067407, 0, 1, 0.2047431926195034, 0, 0.4192171934924875, 2.646494904782903, 0.7952568073804966, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9964474835030925, 2.003552516496911, 0, 2, 0.3321491611676972, 0, 0.9982268912505863, 6.301751031495552, 0.4460247429290105, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 1, 0.2046282785565273, 0, 0.4190912555055218, 2.645699865252089, 0.7953717214434727, 1, 0.1584046856598338],
[0.6329933979880399, 2.215137867132021, 0, 1, 0.2222486743290452, 0, 0.4514391699216077, 2.849910455875345, 0.7777513256709547, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 1.645567722912146, 0, 0, 0.3779907017081524, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8358937631124278, 2.164106236887574, 1, 0, 0.2786312543708091, 1.196324274841491, 0, -7.552328833318338, 1, 0.2786312543708092, 0.1584046856598338],
[0.6145721994760905, 2.385427800523912, 1, 0, 0.2048573998253634, 1.627148121656786, 0, -10.27209589715676, 1, 0.2048573998253633, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 1.645567722912146, 0, 0, 0.3779907017081524, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6329719767209648, 1.532578436793343, 0, 1, 0.2922914990899531, 0, 0.6524951519560253, 4.119165725673206, 0.7077085009100469, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000947283659753, 1.997868359605574, 0, 1, 0.3337808664256032, 0, 0.5005334786909702, 3.15984010577718, 0.6662191335743968, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.986625544112403, 2.013374455887599, 0, 0, 0.3288751813708007, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.7233745341466794, 2.276625465853325, 0, 1, 0.2411248447155594, 0, 0.4392466020427211, 2.772939450705274, 0.7588751552844406, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.162043648272543, 0, 1, 0.2793187839091527, 0, 0.462525352251326, 2.919896910401857, 0.7206812160908473, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3333333333333333, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2952675263019445, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9936056728954737, 2.006394327104529, 1, 1, 0.3312018909651576, 1.006435477653718, 0.4984065128628635, -3.207158694041549, 0.890305307421104, 0.5527090893514189, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.384930807604443, 0, 1, 0.2047090947542743, 0, 0.41929937623828, 2.647013719901598, 0.7952909052457258, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.246937025891623, 1.644423893878107, 0, 0, 0.4312630143700394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6145716271698209, 2.385428372830181, 1, 0, 0.2048572090566068, 1.627149636902577, 0, -10.27210546281945, 1, 0.2048572090566068, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.615258888859186, 2.384741111140817, 1, 0, 0.2050862962863952, 1.62533206444884, 0, -10.26063122866933, 1, 0.2050862962863952, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.996932564743622, 2.002600032802618, 0, 2, 0.3323626372852757, 0, 0.998701671447104, 6.304748292558506, 0.4457396480926724, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6329933969200752, 2.013661499698609, 0, 1, 0.239167334482775, 0, 0.4966077963697836, 3.135057490889027, 0.7608326655172249, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0, 1.73389561955592, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6332420024296573, 2.21442200083942, 1, 0, 0.2223724434142176, 1.579175096034605, 0, -9.969244845608959, 1, 0.2223724434142176, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.162043648272543, 0, 0, 0.2793187839091527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.002570389864581, 1.995938606033046, 1, 2, 0.3343563054959101, 0.9974362001006946, 1.002034829104802, 0.02903088999515461, 0.7393757335262834, 0.7050655747135602, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3333333333333333, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6330521902220412, 2.012515532690106, 0, 0, 0.2392878415999118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000757446364519, 1.998909317758572, 0, 1, 0.3336228738251452, 0, 0.5002728193399617, 3.158194577742939, 0.6663771261748548, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.3050584700619183, 2.694941529938082, 0, 0, 0.1016861566873061, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6142496798644727, 2.385750320135529, 1, 0, 0.2047498932881574, 1.628002476485847, 0, -10.27748939183467, 1, 0.2047498932881574, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.246937025891623, 1.644423893878107, 0, 0, 0.4312630143700394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9988160994846047, 2.001183900515398, 0, 1, 0.3329386998282012, 0, 0.4997041999700543, 3.154604915179999, 0.6670613001717988, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8372690234060191, 2.162730976593983, 1, 0, 0.2790896744686728, 1.194359246603905, 0, -7.53992371897844, 1, 0.2790896744686728, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.156472284372475, 0.6666666666666667, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3333333333333333, 0.1584046856598338],
[0.986625544112403, 2.013374455887599, 0, 0, 0.3288751813708007, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0, 1.73389561955592, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.162043648272543, 0, 0, 0.2793187839091527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8372689855906593, 2.000040992706752, 1, 1, 0.2950925320091676, 1.194359300547291, 0.499989752033358, -4.383516469992923, 0.9129203975524185, 0.5031054615707535, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.847664003269077, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2976699506318057, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.384931152450792, 0, 1, 0.2047090712139223, 0, 0.4192993156101738, 2.647013337159724, 0.7952909287860778, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.156472284372475, 0.6666666666666667, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.3050584700619183, 2.694941529938082, 0, 0, 0.1016861566873061, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2123169167405333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8372693611632503, 2.162730638836752, 1, 0, 0.2790897870544166, 1.194358764795432, 0, -7.539920677348258, 1, 0.2790897870544166, 0.1584046856598338],
[0.3118887892039148, 2.688111210796085, 0, 2, 0.1039629297346383, 0, 0.7440168367913986, 4.696937048877063, 0.8028824312897328, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6330521902220412, 2.21399213910223, 0, 1, 0.2223541740118575, 0, 0.4516727870612487, 2.851385267928208, 0.7776458259881425, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9988147957877392, 2.001185204212264, 0, 1, 0.3329382652625795, 0, 0.4997038744315697, 3.15460286007359, 0.6670617347374206, 1, 0.1584046856598338],
[0.695190221309291, 1.951464034097354, 1, 1, 0.2626675622209212, 1.438455216065387, 0.512435782841649, -5.845909351522078, 0.9310057517569185, 0.456340876198761, 0.1584046856598338],
[0.9958067471589349, 2.00372584473198, 2, 3, 0.3319873069060987, 2.008421820504889, 1.497210812490809, -3.227246756525124, 0.7921135357094005, 0.5364331593087156, 0.1584046856598338],
[0.7233747014111813, 2.276625298588823, 0, 1, 0.2411249004703934, 0, 0.4392466343143313, 2.77293965443416, 0.7588750995296065, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2123169167405333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3333333333333333, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6142184082014479, 2.385781591798554, 0, 1, 0.2047394694004825, 0, 0.4191498515361317, 2.646069778745278, 0.7952605305995175, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.847664003269077, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2976699506318057, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9988156647787672, 2.001184335221236, 0, 1, 0.3329385549262553, 0, 0.4997040914221665, 3.1546042299232, 0.6670614450737447, 1, 0.1584046856598338],
[0.6150687326107276, 2.384931267389275, 0, 2, 0.2050229108702424, 0, 0.8385985908052397, 5.294026419181113, 0.6319885722412226, 1, 0.1584046856598338],
[0.9976298463603887, 2.002370153639614, 0, 3, 0.3325432821201292, 0, 1.498224488887352, 9.4582081498821, 0.2973509467688756, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8372690108119373, 2.162730989188065, 1, 0, 0.2790896702706456, 1.194359264569287, 0, -7.539923832392905, 1, 0.2790896702706456, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8471957502795934, 2.000468252989485, 0, 1, 0.2975055165591953, 0, 0.4998829641538211, 3.155733443562995, 0.7024944834408047, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0, -12.6258891374899, 1, 0.1111111111111109, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3333333333333333, 0.1584046856598338],
[0.7233742955636979, 2.276625704436306, 0, 1, 0.2411247651878989, 0, 0.4392465560111035, 2.772939160110224, 0.7588752348121011, 1, 0.1584046856598338],
[0.9978693246759739, 2.002130675324029, 1, 1, 0.3326231082253243, 1.002135224794808, 0.4994678980372536, -3.173310970339648, 0.8893618678745241, 0.5546080843251728, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.385781500613789, 0, 1, 0.2046510400987445, 0, 0.4191498675560736, 2.646069879878283, 0.7953489599012554, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3333333333333333, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.307878819917391, 1.307190700094772, 0, 1, 0.5001315681700531, 0, 0.7649993225376372, 4.82939831830755, 0.4998684318299469, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9990646343026823, 1.646503088609464, 0, 1, 0.3776371421718691, 0, 0.6073477826540482, 3.834152885845167, 0.6223628578281309, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9990629473410141, 1.646504775571133, 0, 1, 0.3776365045160444, 0, 0.6073471603828929, 3.834148957481857, 0.6223634954839556, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.951246084336531, 0, 1, 0.2626199012455823, 0, 0.512493020756028, 3.235340031901464, 0.7373800987544177, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -3.156472284372475, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1584046856598338],
[0.9988152780653651, 2.000000853267037, 0, 2, 0.333069863013436, 0, 0.9999995733666637, 6.312941875432355, 0.444795807620917, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6330521902220412, 1.528991458050502, 0, 0, 0.2928026872759231, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8370204879378301, 2.162979512062172, 1, 0, 0.2790068293126099, 1.194713886231988, 0, -7.542162539292411, 1, 0.2790068293126099, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.384929287015322, 0, 1, 0.20470919855478, 0, 0.4192996435762145, 2.64701540759116, 0.79529080144522, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2348553491310671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6145717266476927, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2350563652104023, 1.627149373523421, 0, -10.27210380012144, 1, 0.2350563652104023, 0.1584046856598338],
[0.6330521902220412, 2.214611813047036, 0, 0, 0.2223057880056447, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.384930829117986, 0, 1, 0.2047090932856885, 0, 0.4192993724559417, 2.647013696023906, 0.7952909067143115, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3333333333333333, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2952675263019445, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6330521902220412, 1.528991458050502, 0, 0, 0.2928026872759231, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6177065600196514, 2.400969863283268, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.157424642572171],
[0.8529411138503099, 2.012450948868614, 0, 0, 0.2976699506318057, 0, 0, 0, 1, 1, 0.157424642572171],
[0.6177065600196514, 2.400969863283268, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.157424642572171],
[1.30572123085881, 1.309358043902861, 0, 1, 0.4993046457369094, 0, 0.7637330405205714, 4.821404350125414, 0.5006953542630906, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6145717266766125, 2.38542827332339, 1, 0, 0.2048572422255374, 1.627149373446852, 0, -10.27210379963806, 1, 0.2048572422255374, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 2, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0.9999999999999989, -6.312944568744951, 0.8888888888888891, 0.4074074074074072, 0.1584046856598338],
[0.7857746635530352, 2.214225336446967, 0, 0, 0.2619248878510116, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.469205796991633, 0, 1, 0.3211156289086835, 0, 0.6806398409587099, 4.296841587251719, 0.6788843710913165, 1, 0.1584046856598338],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.7233751047380379, 2.276624895261966, 0, 1, 0.2411250349126789, 0, 0.4392467121312632, 2.772940145688138, 0.758874965087321, 1, 0.1584046856598338],
[0.6157552730200506, 2.384244726979952, 1, 1, 0.20525175767335, 1.624021821356676, 0.4194200321317975, -7.604584322787655, 0.9578717159720005, 0.3683752313187004, 0.1584046856598338],
[0.8358944176413216, 2.16410558235868, 1, 0, 0.278631472547107, 1.196323338085858, 0, -7.552322919631954, 1, 0.2786314725471071, 0.1584046856598338],
[1.308636602023862, 1.306099024046462, 1, 0, 0.5004852456118506, 0.7641540810133676, 0, -4.824062355417634, 1, 0.5004852456118506, 0.1584046856598338],
[0.6951584805316067, 1.955087387099296, 0.5, 2.5, 0.2622996186965174, 0.7192604478012501, 1.278715220862416, 3.531806971054928, 0.6155738217875238, 0.5985420858491368, 0.1584046856598338],
[1.306929671311128, 1.315458847037133, 2, 0, 0.4983737772518587, 1.530304226694598, 0, -9.660725756439113, 1, 0.248376421852285, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.156472284372475, 0.6666666666666667, 1, 0.1584046856598338],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6157555455844648, 2.383060585747936, 1, 3, 0.2053328775815539, 1.624021102482832, 1.258885325006722, -2.305081923272273, 0.8109549429313387, 0.6012130098057529, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8384530244099783, 2.161546975590024, 0, 1, 0.2794843414699926, 0, 0.4626316297044788, 2.920567834072518, 0.7205156585300074, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6958769098130598, 1.949690813099085, 0, 1, 0.263035001442739, 0, 0.5129018371946235, 3.237920867417109, 0.7369649985572611, 1, 0.1584046856598338],
[1.147088319738576, 1.850342520847094, 0, 1, 0.382690504216753, 0, 0.540440479929195, 3.41177079249893, 0.617309495783247, 1, 0.1584046856598338],
[0.6145716646453742, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2350563470704218, 1.627149537681711, 0, -10.27210483644363, 1, 0.2350563470704219, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2348553491310671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8372689855906593, 2.162233455683487, 1, 1, 0.2791359573739834, 1.194359300547291, 0.4624847503730338, -4.620283466525238, 0.9220831173009099, 0.4803550320488764, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.384930753366626, 0, 1, 0.2047090984567275, 0, 0.4192993857739374, 2.647013780099675, 0.7952909015432725, 1, 0.1584046856598338],
[0.9858157641505885, 2.014184235849414, 1, 0, 0.3286052547168625, 1.014388323219434, 0, -6.403777255666427, 1, 0.3286052547168625, 0.1584046856598338],
[0.9991492632184723, 2.000850736781531, 0, 2, 0.3330497544061571, 0, 0.9995748124705698, 6.310260383440343, 0.4448226300976875, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2348553491310671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 1.645567722912146, 0, 0, 0.3779907017081524, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 1, 0.2046282785565273, 0, 0.4190912555055218, 2.645699865252089, 0.7953717214434727, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 1, 0.2046282785565273, 0, 0.4190912555055218, 2.645699865252089, 0.7953717214434727, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6336869089210976, 1.530952423897464, 0, 1, 0.2927448001676927, 0, 0.6531881620816293, 4.123540660181723, 0.7072551998323073, 1, 0.1584046856598338],
[1.308636643740759, 1.306098795295069, 1, 0, 0.5004852973665714, 0.7641540566535595, 0, -4.824062201635515, 1, 0.5004852973665714, 0.1584046856598338],
[0.9964478563932735, 2.002552696680189, 0, 1, 0.3322599775355443, 0, 0.4993626393241933, 3.152448661755813, 0.6677400224644557, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6145716271738664, 2.385428372826135, 1, 0, 0.2048572090579553, 1.627149636891866, 0, -10.27210546275184, 1, 0.2048572090579553, 0.1584046856598338],
[1.836333182299708, 1.162482363319002, 1, 0, 0.6123528287635442, 0.544563486429877, 0, -3.43779910399431, 1, 0.6123528287635442, 0.1584046856598338],
[1.832316977806197, 1.167683022193804, 0, 1, 0.6107723259353988, 0, 0.8563967968988991, 5.406385507673484, 0.3892276740646012, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 1.646654235600604, 1, 0, 0.3778355277953682, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3778355277953682, 0.1584046856598338],
[1.837956351727459, 1.162043648272542, 0, 0, 0.6126521172424861, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.156472284372475, 0.6666666666666667, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9983874355657943, 2.001158846131671, 0, 1, 0.3328461513188587, 0, 0.4997104562354181, 3.154644410636448, 0.6671538486811412, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6332419453149094, 2.214422057954168, 1, 0, 0.2223724233575157, 1.579175238467033, 0, -9.969245744776979, 1, 0.2223724233575157, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.951245827958861, 0, 1, 0.2626199266896909, 0, 0.5124930880934002, 3.235340456998562, 0.7373800733103091, 1, 0.1584046856598338],
[1.000946854790314, 1.836322498636549, 0, 1, 0.3527852770063467, 0, 0.5445666546821105, 3.43781910499504, 0.6472147229936533, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.384930807604415, 0, 1, 0.2047090947542761, 0, 0.4192993762382848, 2.647013719901628, 0.7952909052457239, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 6.312944568744951, 0.4444444444444445, 1, 0.1584046856598338],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.161546567783265, 0, 1, 0.2793650728848583, 0, 0.4626317169865703, 2.920568385079523, 0.7206349271151418, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.999149263249788, 2.000850736750215, 0, 1, 0.3330497544165957, 0, 0.4997874062431072, 3.155130191769553, 0.6669502455834042, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.162043648272543, 0, 0, 0.2793187839091527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2348553491310671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8372689855906531, 2.162275054466464, 1, 1, 0.2791320862135799, 1.1943593005473, 0.4624758528913184, -4.620339635834164, 0.9220852784460545, 0.4803494508732146, 0.1584046856598338],
[0.3050584700619183, 2.694941529938082, 0, 0, 0.1016861566873061, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9978679590503188, 2.002132040949684, 0, 1, 0.3326226530167726, 0, 0.4994675573573377, 3.153111003483316, 0.6673773469832274, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.156472284372475, 0.6666666666666667, 1, 0.1584046856598338],
[0.6945616959754138, 1.467481952297128, 1, 0, 0.3212523930913069, 1.439756908269526, 0, -9.089105554373134, 1, 0.3212523930913069, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.156472284372475, 0.6666666666666667, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 1.837997351092991, 1, 0, 0.3523611463607861, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3523611463607861, 0.1584046856598338],
[0.9988161794662673, 2.001183820533736, 0, 1, 0.3329387264887554, 0, 0.4997042199418192, 3.154605041260643, 0.6670612735112446, 1, 0.1584046856598338],
[0.6330521902220412, 2.214611813047036, 0, 0, 0.2223057880056447, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2123169167405333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2123169167405333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 3.156472284372475, 0.6666666666666667, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9988156432653252, 2.001184356734678, 0, 1, 0.3329385477551081, 0, 0.4997040860501702, 3.154604196010085, 0.6670614522448919, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.3050584700619183, 2.694941529938082, 0, 0, 0.1016861566873061, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.3050584700619183, 2.694941529938082, 0, 0, 0.1016861566873061, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308636693636206, 1.306098521697232, 1, 0, 0.5004853592677548, 0.7641540275180414, 0, -4.824062017704605, 1, 0.5004853592677548, 0.1584046856598338],
[0.9988155673710345, 2.001184432628969, 0, 1, 0.3329385224570111, 0, 0.4997040670990497, 3.154604076372712, 0.6670614775429888, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9985464715492723, 2.00145352845073, 1, 1, 0.3328488238497572, 1.00145564427109, 0.499636881788643, -3.167954031107879, 0.8892116604618334, 0.5549093081613476, 0.1584046856598338],
[0.6331832561966568, 2.214947824851638, 1, 1, 0.2223153493214943, 1.579321610629286, 0.4514779033528621, -7.120014806243879, 0.9505758854560619, 0.3952065840990506, 0.1584046856598338],
[0.9988156432739962, 2.001184356726007, 0, 1, 0.3329385477579984, 0, 0.4997040860523354, 3.154604196023754, 0.6670614522420016, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.003787211417283, 1.994546618175404, 2, 1, 0.3347816715771253, 1.992454154876239, 0.5013670730417885, -9.413150094792561, 0.962478082826542, 0.2611924685250058, 0.1584046856598338],
[0.9991488089771469, 2.000851191022856, 0, 1, 0.333049602992382, 0, 0.4997872927715277, 3.155129475429762, 0.666950397007618, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8379563517274585, 2.162043648272543, 0, 0, 0.2793187839091527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2348553491310671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.9978682620023969, 2.002131737997606, 0, 1, 0.3326227540007985, 0, 0.4994676329341499, 3.153111480595542, 0.6673772459992015, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.950626192974064, 0, 0, 0.2626814365474323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.722523915899853, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2408413052999506, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 1.837997360159341, 1, 0, 0.3523611452351229, 0.9999999999999989, 0, -6.312944568744951, 1, 0.3523611452351229, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.002214653906330001, 2.997785346093671, 0, 1, 0.0007382179687766667, 0, 0.3335795877790489, 2.105869446913929, 0.9992617820312233, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0, 1.73389561955592, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.277476084100151, 0, 0, 0.2123169167405333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -3.156472284372475, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.383745456500497, 0, 1, 0.204790042745789, 0, 0.4195078787766497, 2.648329984868769, 0.7952099572542111, 1, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6956872632982261, 1.949880459613919, 1, 1, 0.2629633168235205, 1.437427494732388, 0.5128519520617189, -5.836794150497221, 0.9308502940051727, 0.4567769276522138, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6138848356695824, 2.38611516433042, 0, 0, 0.2046282785565273, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.8372690108119373, 2.000041000166726, 1, 1, 0.2950925374993271, 1.194359264569287, 0.499989750168441, -4.383516254638897, 0.9129203943122082, 0.5031054693108625, 0.1584046856598338],
[1.000000000000001, 1.999502911755729, 0, 1, 0.3333885745137219, 0, 0.5001243029558368, 3.157257002042408, 0.6666114254862781, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 2.152722473330995, 0, 0, 0.2440391595147107, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[1.308826365607665, 1.305058470061919, 0, 0, 0.500720746280465, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338],
[0.6949415299380818, 1.46710211833446, 0, 0, 0.3214280759286869, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1584046856598338]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node106":{
"Global MG94xREV":0.0009706391766996007,
"Nucleotide GTR":0.0009630381211383792,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node117":{
"Global MG94xREV":0.0009718415742285606,
"Nucleotide GTR":0.0009642311027168553,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node14":{
"Global MG94xREV":0.0009713460279234479,
"Nucleotide GTR":0.0009637394370247346,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node146":{
"Global MG94xREV":0.0009721694350765506,
"Nucleotide GTR":0.0009645563960932438,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node197":{
"Global MG94xREV":0.0009716752602033394,
"Nucleotide GTR":0.0009640660910933682,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node201":{
"Global MG94xREV":0.0006193929423382227,
"Nucleotide GTR":0.0006145424888618344,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTT", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node204":{
"Global MG94xREV":0.0006194222800973157,
"Nucleotide GTR":0.0006145715968775351,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "V", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GTT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node207":{
"Global MG94xREV":0.0006194534256714939,
"Nucleotide GTR":0.0006146024985513594,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node210":{
"Global MG94xREV":0.0006194521694689999,
"Nucleotide GTR":0.0006146012521861594,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "C", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "TGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node216":{
"Global MG94xREV":0.0009716505594726609,
"Nucleotide GTR":0.0009640415837936072,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACT", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node230":{
"Global MG94xREV":0.0009716726727911756,
"Nucleotide GTR":0.000964063523943176,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node235":{
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node248":{
"Global MG94xREV":0.0006168841584439989,
"Nucleotide GTR":0.0006120533512030286,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "H", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAT", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node270":{
"Global MG94xREV":0.0004548634409812107,
"Nucleotide GTR":0.0004513014146683814,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node273":{
"Global MG94xREV":0.0009717109594627845,
"Nucleotide GTR":0.0009641015107926432,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node322":{
"Global MG94xREV":0.0009713459870278156,
"Nucleotide GTR":0.0009637393964493552,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node361":{
"Global MG94xREV":0.0009715729332828862,
"Nucleotide GTR":0.0009639645654929387,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node400":{
"Global MG94xREV":0.0009715728926257594,
"Nucleotide GTR":0.0009639645251541975,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009727704159544025,
"Nucleotide GTR":0.0009651526707021201,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "Y", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TAC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711973168161633,
"Nucleotide GTR":0.0009635918904710931,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "D", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAC", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713931606760376,
"Nucleotide GTR":0.0009637862006817011,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "D", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "GAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "ILVF", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "NTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414010_England_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000972045263644634,
"Nucleotide GTR":0.000964433197045275,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCA", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009712149862504837,
"Nucleotide GTR":0.0009636094215364354,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAG", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713961341946465,
"Nucleotide GTR":0.0009637891509147467,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "E", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GAA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716502073055759,
"Nucleotide GTR":0.0009640412343843356,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "L", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CTC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009717704643419511,
"Nucleotide GTR":0.000964160549690315,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "F", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "TTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717704643419511,
"Nucleotide GTR":0.000964160549690315,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "S", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "TCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009713961342029672,
"Nucleotide GTR":0.0009637891509230021,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "N", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "AAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713932015126599,
"Nucleotide GTR":0.0009637862411985332,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCG", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971410817312897,
"Nucleotide GTR":0.0009638037190497974,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "E", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "GAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009730181079779704,
"Nucleotide GTR":0.000965398423054514,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "C", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "TGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717516447259358,
"Nucleotide GTR":0.0009641418774503302,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "K", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "AAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717528123727682,
"Nucleotide GTR":0.0009641430359533426,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTT", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717589896039946,
"Nucleotide GTR":0.000964149164810799,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "I", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "ATA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009710381244695355,
"Nucleotide GTR":0.0009634339447564794,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAC", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009710381244695355,
"Nucleotide GTR":0.0009634339447564794,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "L", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "CTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417236_England_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCN", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417236_England_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417240_England_20200303_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009718354220133858,
"Nucleotide GTR":0.0009642249986795536,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "Y", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "TAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417240_England_20200303_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719530691406057,
"Nucleotide GTR":0.0009643417245145234,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "I", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ATA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417288_England_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417312_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCN", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417312_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009714108579636595,
"Nucleotide GTR":0.0009638037593822249,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCG", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009720452204838639,
"Nucleotide GTR":0.0009644331542224949,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "K", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "AAA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "NHDY", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "NAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009714108579797669,
"Nucleotide GTR":0.0009638037593982082,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "G", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GGA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971552896844977,
"Nucleotide GTR":0.0009639446859599646,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCT", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417950_Kinshasa_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713305088436901,
"Nucleotide GTR":0.0009637240394745738,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "L", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TTA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417950_Kinshasa_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009727960805190378,
"Nucleotide GTR":0.0009651781342880737,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACT", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009730156599296057,
"Nucleotide GTR":0.0009653959941767657,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "K", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAA", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "DAGV", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GNT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971330508859647,
"Nucleotide GTR":0.0009637240394904053,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "F", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TTT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418677_England_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "KTRM", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ANG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418677_England_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418715_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "LF", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTN", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418715_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971410817312897,
"Nucleotide GTR":0.0009638037190497974,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "G", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GGT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000971752805237984,
"Nucleotide GTR":0.0009641430288744312,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "Y", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "TAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009710204747840433,
"Nucleotide GTR":0.0009634164332853136,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAC", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCN", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001945183775213564,
"Nucleotide GTR":0.001929951080812687,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "DAGV", "F", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GNT", "TTC", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "ILVF", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "NTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "MLV", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "NTG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "LF", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTN", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009720392682201392,
"Nucleotide GTR":0.0009644272485708264,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "V", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "GTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACN", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009705528257771663,
"Nucleotide GTR":0.0009629524464282546,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "S", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AGT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711974193939554,
"Nucleotide GTR":0.0009635919922455991,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "G", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GGT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717704643419511,
"Nucleotide GTR":0.000964160549690315,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "D", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAT", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419798_Victoria_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009716811821644079,
"Nucleotide GTR":0.0009640719666796811,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "I", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ATA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419798_Victoria_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971178802977245,
"Nucleotide GTR":0.0009635735216136673,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTC", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718505426686572,
"Nucleotide GTR":0.0009642400009252818,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCT", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420312_Norway_20200318_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009717704572274199,
"Nucleotide GTR":0.0009641605426314992,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "Y", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "TAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420312_Norway_20200318_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009710911045405015,
"Nucleotide GTR":0.0009634865099415911,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAC", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420443_Hasselt_20200304_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009713497429769431,
"Nucleotide GTR":0.0009637431229857221,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "K", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "AAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420443_Hasselt_20200304_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009713497429769431,
"Nucleotide GTR":0.0009637431229857221,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "K", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AAA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420640_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "KN", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAN", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420694_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420696_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009710725089026729,
"Nucleotide GTR":0.0009634680599258235,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "I", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATT", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420696_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420697_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "QPRL", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CNA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420697_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420725_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711966091926547,
"Nucleotide GTR":0.000963591188388969,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "T", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ACT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420725_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420726_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "SRGC", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "NGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420726_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009813604103281375,
"Nucleotide GTR":0.0009736753970054201,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "H", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAC", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420839_Kinshasa_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009730181079779704,
"Nucleotide GTR":0.000965398423054514,
"amino-acid": [
["C", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420839_Kinshasa_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420903_Munich_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718683959598818,
"Nucleotide GTR":0.0009642577144077472,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "L", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CTT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420903_Munich_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420911_Munich_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009717704572046159,
"Nucleotide GTR":0.0009641605426088748,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "L", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "TTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420911_Munich_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "NTSI", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ANT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009720614447643086,
"Nucleotide GTR":0.0009644492514509316,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "K", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "AAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711966091926547,
"Nucleotide GTR":0.000963591188388969,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "A", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GCT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713497017759323,
"Nucleotide GTR":0.000963743082107355,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAA", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713319466384183,
"Nucleotide GTR":0.0009637254660099605,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "I", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "ATT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713907572096829,
"Nucleotide GTR":0.0009637838160368434,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATT", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713195705479172,
"Nucleotide GTR":0.0009637131868363716,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAT", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009710207101661449,
"Nucleotide GTR":0.0009634166668241426,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "C", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TGC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421669_India_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717704572046159,
"Nucleotide GTR":0.0009641605426088748,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421669_India_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "DAGV", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GNT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711788029872374,
"Nucleotide GTR":0.0009635735216235828,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "A", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GCT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001944356806371556,
"Nucleotide GTR":0.001929130587946781,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "Y", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAG", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "TAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "KN", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAN", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421775_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "RS", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGN", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421847_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421895_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGN", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421895_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421947_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "DAGV", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GNT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421947_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421948_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGN", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421948_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421953_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "NHDY", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "NAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421953_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421954_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718505783943753,
"Nucleotide GTR":0.000964240036371232,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "S", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "TCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421954_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421956_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "DAGV", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GNT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421956_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "KQE", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "NAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421963_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421964_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "QH", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAN", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421964_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422002_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "EAGV", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GNA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422002_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "KTRM", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "ANG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "TPAS", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "NCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "KN", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAN", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971179613207698,
"Nucleotide GTR":0.0009635743254992222,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAG", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACT", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "LF", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTN", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422239_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971681188655633,
"Nucleotide GTR":0.0009640719731200724,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCT", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422239_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "ED", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAN", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422342_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009710381187498524,
"Nucleotide GTR":0.0009634339390815861,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTC", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422342_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGN", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009727521982496023,
"Nucleotide GTR":0.0009651345956597954,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "T", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "ACT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009709242061687089,
"Nucleotide GTR":0.0009633209185475386,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "V", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009710381244534028,
"Nucleotide GTR":0.0009634339447404728,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAC", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717589902096213,
"Nucleotide GTR":0.0009641491654116824,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAA", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0003544660121832938,
"Nucleotide GTR":0.0003516901960841215,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "H", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAT", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718480840400631,
"Nucleotide GTR":0.0009642375615501571,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "V", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "GTT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422729_Netherlands_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717971174398363,
"Nucleotide GTR":0.0009641869940683358,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAT", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422729_Netherlands_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009713305088436901,
"Nucleotide GTR":0.0009637240394745738,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "I", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ATA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009718505836998222,
"Nucleotide GTR":0.000964240041635132,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "S", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "TCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716846028845635,
"Nucleotide GTR":0.000964075360612247,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "V", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GTT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00097185748672647,
"Nucleotide GTR":0.000964246890604319,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTA", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009713700029322241,
"Nucleotide GTR":0.0009637632242857066,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "L", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "TTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423052_England_20200319_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "NTSI", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ANT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423052_England_20200319_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "SL", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TNA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423060_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423068_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "QPRL", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CNG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423068_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423130_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "TPAS", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "NCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423130_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423164_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "NTSI", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ANC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423164_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423173_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "KQE", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "NAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423173_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423227_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "ILVF", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "NTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423227_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423324_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009734262818417448,
"Nucleotide GTR":0.0009658034005170994,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "D", "Q", "ILV", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GAT", "CAA", "NTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423324_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423328_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "SRGC", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "NGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423328_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423346_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971393166575362,
"Nucleotide GTR":0.0009637862065348277,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTG", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423346_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423354_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009717704572274199,
"Nucleotide GTR":0.0009641605426314992,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "F", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "TTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423354_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423373_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "DAGV", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GNT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423373_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTN", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423412_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423446_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "NTSI", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ANT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423446_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423453_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724658238253526,
"Nucleotide GTR":0.0009648504638278103,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "N", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "AAT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423453_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423465_England_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423465_England_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423481_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTN", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423481_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423548_England_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000971400081320209,
"Nucleotide GTR":0.0009637930671304503,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "L", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "CTA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423548_England_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "EAGV", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GNA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423579_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423639_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "KQE", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "NAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423639_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423648_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "NTSI", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "ANT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423648_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423740_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "KN", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAN", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423740_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423752_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009727521982496023,
"Nucleotide GTR":0.0009651345956597954,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "I", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423752_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423772_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "ED", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAN", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423772_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423780_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["RS", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGN", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423780_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "TPAS", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "NCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423825_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000970906567022404,
"Nucleotide GTR":0.0009633034175330277,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACG", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423913_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423927_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002927513080789181,
"Nucleotide GTR":0.0029045877856667,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "I", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "ATT", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423927_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423933_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "KN", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAN", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423933_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424007_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "EAGV", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GNA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424007_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424062_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009731480778974043,
"Nucleotide GTR":0.0009655273751821623,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "LF", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "E", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTN", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GAA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424062_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424138_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGN", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424138_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424188_Washington_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0003518323980816113,
"Nucleotide GTR":0.0003490772057606611,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "C", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "TGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424188_Washington_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424239_Washington_20200321_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0009717528124580953,
"Nucleotide GTR":0.0009641430360380019,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "F", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "TTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424239_Washington_20200321_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718149239116062,
"Nucleotide GTR":0.0009642046610979891,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAT", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716420701787075,
"Nucleotide GTR":0.0009640331609791417,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAA", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713121980348357,
"Nucleotide GTR":0.0009637058720572899,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACC", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424332_Washington_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971850583683731,
"Nucleotide GTR":0.0009642400416191672,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTT", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424332_Washington_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424371_Reykjavik_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0003518311561629567,
"Nucleotide GTR":0.0003490759735674463,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424371_Reykjavik_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009709055843471537,
"Nucleotide GTR":0.0009633024425530878,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "P", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "CCA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24":{
"Global MG94xREV":0.0009717589896067164,
"Nucleotide GTR":0.0009641491648134987,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "N", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "AAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424510_Reykjavik_20200320_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424510_Reykjavik_20200320_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009709065608074671,
"Nucleotide GTR":0.000963303411366761,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "A", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "GCG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009713961342029672,
"Nucleotide GTR":0.0009637891509230021,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "D", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GAT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713141148793972,
"Nucleotide GTR":0.00096370777389108,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "N", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AAT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTN", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713319520717607,
"Nucleotide GTR":0.0009637254714007545,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "Q", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CAG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425023_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "NHDY", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "NAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425023_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425056_Ghent_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009714875090969228,
"Nucleotide GTR":0.0009638798102620299,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "Y", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "TAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425056_Ghent_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711787681395056,
"Nucleotide GTR":0.0009635734870487428,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAC", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425170_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425170_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425197_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009718505783943753,
"Nucleotide GTR":0.000964240036371232,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "I", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ATT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425197_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717389213220615,
"Nucleotide GTR":0.0009641292536831698,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425240_England_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009711796192314408,
"Nucleotide GTR":0.0009635743314757939,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTG", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425240_England_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425336_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009710917498962236,
"Nucleotide GTR":0.0009634871502435463,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "V", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "GTA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425336_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425404_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718472889320558,
"Nucleotide GTR":0.0009642367726686249,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTC", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425404_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425485_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711796131814184,
"Nucleotide GTR":0.0009635743254731485,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCG", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425485_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425501_England_20200315_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009713700029322241,
"Nucleotide GTR":0.0009637632242857066,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "Y", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "TAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425501_England_20200315_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425549_England_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009713700029322241,
"Nucleotide GTR":0.0009637632242857066,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTT", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425549_England_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716362921927588,
"Nucleotide GTR":0.0009640274282404836,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "C", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TGC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425585_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425666_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711788090288345,
"Nucleotide GTR":0.0009635735276178688,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTC", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425666_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713700029322241,
"Nucleotide GTR":0.0009637632242857066,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "N", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAT", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0009720478713252816,
"Nucleotide GTR":0.0009644357843052282,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCA", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009718149595972335,
"Nucleotide GTR":0.0009642046965041624,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "I", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ATA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009718327359769097,
"Nucleotide GTR":0.0009642223336773721,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "F", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TTT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009730181079779704,
"Nucleotide GTR":0.000965398423054514,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "Y", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "TAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711796131814184,
"Nucleotide GTR":0.0009635743254731485,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGG", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711784410454232,
"Nucleotide GTR":0.0009635731625161284,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCG", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426429_Nevada_20200307_null_76":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426429_Nevada_20200307_null_76",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009720614447412462,
"Nucleotide GTR":0.000964449251428049,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "M", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "ATG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713319108836175,
"Nucleotide GTR":0.0009637254305351556,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "I", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "ATT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426515_Arizona_20200313_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0003518668558621801,
"Nucleotide GTR":0.0003491113937030544,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "V", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GTT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426515_Arizona_20200313_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426517_Arizona_20200314_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009718149649023802,
"Nucleotide GTR":0.0009642047017677662,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "V", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GTC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426517_Arizona_20200314_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426721_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009717528123902138,
"Nucleotide GTR":0.000964143035970651,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "N", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAT", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426721_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426819_Victoria_20200325_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0003519012723754063,
"Nucleotide GTR":0.0003491455407012686,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTT", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426819_Victoria_20200325_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009708360058047908,
"Nucleotide GTR":0.0009632334088788677,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "N", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "AAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009722860834352467,
"Nucleotide GTR":0.0009646721309810256,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "V", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GTC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426883_Czech_Republic_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000971767615940157,
"Nucleotide GTR":0.0009641577235942974,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "M", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ATG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426883_Czech_Republic_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426887_Czech_Republic_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009718149239116062,
"Nucleotide GTR":0.0009642046610979891,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAT", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426887_Czech_Republic_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009719040103137906,
"Nucleotide GTR":0.0009642930498663787,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "V", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GTG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427010_Victoria_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009711788090388364,
"Nucleotide GTR":0.0009635735276277925,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTC", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427010_Victoria_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427088_Victoria_20200402_null_46":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427088_Victoria_20200402_null_46",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009800430876627903,
"Nucleotide GTR":0.0009723683902669515,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "-", "-", "-", "I", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "---", "---", "---", "ATA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713875840720159,
"Nucleotide GTR":0.0009637806677479511,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "L", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "CTT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427253_Washington_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009716502072971487,
"Nucleotide GTR":0.0009640412343759747,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "S", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "TCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427253_Washington_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718505838651347,
"Nucleotide GTR":0.0009642400417991513,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "TTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001942741026689231,
"Nucleotide GTR":0.00192752746140214,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAC", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTC", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "KTRI", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "ANA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009711974193776776,
"Nucleotide GTR":0.0009635919922294499,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "C", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TGC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_23":{
"Global MG94xREV":0.000971850583674922,
"Nucleotide GTR":0.0009642400416104281,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTT", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0.000971850583674922,
"Nucleotide GTR":0.0009642400416104281,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAT", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427547_New_York_20200314_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0009712963135495525,
"Nucleotide GTR":0.0009636901119630854,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "S", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "AGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427547_New_York_20200314_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "KN", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAN", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427631_New_York_20200406_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0009709242061786959,
"Nucleotide GTR":0.0009633209185574467,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTG", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427631_New_York_20200406_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009718149595972335,
"Nucleotide GTR":0.0009642046965041624,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "Y", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "TAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009717971531159365,
"Nucleotide GTR":0.0009641870294650569,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "L", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CTA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009714891114032347,
"Nucleotide GTR":0.000963881400020714,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "G", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GGA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427715_New_South_Wales_20200322_null_78":{
"Global MG94xREV":0.0005158445037830769,
"Nucleotide GTR":0.0005118049360133744,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427715_New_South_Wales_20200322_null_78",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_46":{
"Global MG94xREV":0.0009717704643419511,
"Nucleotide GTR":0.000964160549690315,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_46",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_346":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_346",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009720569817223568,
"Nucleotide GTR":0.0009644448233589705,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "K", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "AAG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713932015126599,
"Nucleotide GTR":0.0009637862411985332,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "G", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GGT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009714108581599694,
"Nucleotide GTR":0.000963803759576999,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTG", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428322_Wisconsin_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009718205324384466,
"Nucleotide GTR":0.0009642102257045697,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGT", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428322_Wisconsin_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428385_Connecticut_20200404_null_8233":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428385_Connecticut_20200404_null_8233",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":5890.343145102444,
"Equilibrium frequencies": [
[0.04184768175016231],
[0.01154509684082415],
[0.01141440125828175],
[0.04678653339568569],
[0.01929008274302698],
[0.005321821042927746],
[0.005261575684141983],
[0.02156669288995134],
[0.01592835043555344],
[0.004394373609294011],
[0.004344627364052936],
[0.01780820987982961],
[0.0356202271089104],
[0.009827043082569922],
[0.00971579662547619],
[0.03982411630690824],
[0.01971166437710674],
[0.005438128579885748],
[0.005376566568541209],
[0.02203802947006678],
[0.009086277206638614],
[0.002506756548654193],
[0.002478378960147543],
[0.010158637090314],
[0.007502788320295749],
[0.00206989764095314],
[0.002046465487744091],
[0.008388265290392487],
[0.01677832397022657],
[0.004628867525313644],
[0.004576466705634659],
[0.01875849705231507],
[0.04905599061065091],
[0.01353375237375791],
[0.01338054433446124],
[0.05484556484314117],
[0.022612820551689],
[0.006238510526629479],
[0.006167887839031779],
[0.02528157928146501],
[0.01867202618473928],
[0.005151309260192963],
[0.005092994169908376],
[0.02087569347026096],
[0.04175585010983755],
[0.01151976198029517],
[0.01138935319953548],
[0.04668386381096445],
[0.01026711731222077],
[0.04160751820695417],
[0.01715477533153073],
[0.00473272435179364],
[0.004679147827083769],
[0.01917937709753861],
[0.003907940312878996],
[0.003863700706856239],
[0.01583693774748862],
[0.03167726139134082],
[0.008739242775705517],
[0.008640310697326457],
[0.03541580288289407]
],
"Log Likelihood":-2694.336875768962,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6022986047970441, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":250
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":6417.777712442661,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3313556513092476],
[0.1443707877582588],
[0.1954679040989946],
[0.3288056568334991]
],
"Log Likelihood":-2767.025766096376,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2975437367361644,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1303138116876393,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.04537586101690529,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.69007636829691,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.564220485813636
},
"display order":0,
"estimated parameters":441
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-21/sequences.endornase.compressed.fas",
"number of sequences":218,
"number of sites":346,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1,epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2,epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1,epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2,epi_isl_425585_England_20200324_null_1,epi_isl_425485_England_20200317_null_1,epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2,epi_isl_420911_Munich_20200319_null_3,epi_isl_421954_England_20200330_null_1,epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24,epi_isl_425501_England_20200315_null_3,epi_isl_426887_Czech_Republic_20200331_null_2,(epi_isl_425170_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1)Node400,epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1,epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1,epi_isl_417950_Kinshasa_20200320_null_1,epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1,epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1,epi_isl_423346_England_20200327_null_1,epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_23,epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1,epi_isl_422342_Wales_20200326_null_1,epi_isl_427010_Victoria_20200330_null_3,epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1,epi_isl_420839_Kinshasa_20200322_null_3,epi_isl_425197_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3,epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5,epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1,epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1,epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3,epi_isl_420640_England_20200323_null_2,epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1,epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1,epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1,epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1,epi_isl_420312_Norway_20200318_null_5,epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1,epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1,epi_isl_427547_New_York_20200314_null_11,(epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1,epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3)Node361,epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1,epi_isl_425666_Scotland_20200313_null_1,epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1,epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2,epi_isl_420725_England_20200328_null_1,epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_426721_Victoria_20200325_null_2,epi_isl_423913_England_20200318_null_1,epi_isl_420903_Munich_20200314_null_1,epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1,epi_isl_423752_England_20200323_null_1,epi_isl_425240_England_20200331_null_4,epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1,epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1,epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1,epi_isl_422239_Wales_20200327_null_1,epi_isl_427631_New_York_20200406_null_6,(epi_isl_424510_Reykjavik_20200320_null_5,epi_isl_425404_England_20200319_null_1)Node322,epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1,epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_419798_Victoria_20200315_null_2,epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1,epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_2,epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_2,epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2,epi_isl_423548_England_20200331_null_3,epi_isl_428322_Wisconsin_20200326_null_2,(epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2,epi_isl_427715_New_South_Wales_20200322_null_78)Node270,(epi_isl_421775_England_20200325_null_1,epi_isl_421895_England_20200327_null_1,epi_isl_425336_England_20200328_null_1,epi_isl_427088_Victoria_20200402_null_46,epi_isl_423446_England_20200329_null_1,epi_isl_423453_England_20200329_null_1)Node273,epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1,epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1,epi_isl_421669_India_20200312_null_1,epi_isl_420443_Hasselt_20200304_null_3,epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1,epi_isl_424239_Washington_20200321_null_7,epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2,epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1,epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2,epi_isl_424332_Washington_20200322_null_1,epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1,epi_isl_427253_Washington_20200331_null_2,epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2,epi_isl_417240_England_20200303_null_4,epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_418677_England_20200315_null_1,epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3,epi_isl_426883_Czech_Republic_20200327_null_2,epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4,(epi_isl_421964_England_20200401_null_1,epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_3)Node248,epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_426517_Arizona_20200314_null_4,(epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1,epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1)Node230,epi_isl_423412_England_20200329_null_1,epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1,epi_isl_425549_England_20200322_null_4,epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1,(epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1,epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1,epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1)Node216,epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1,epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1,epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1,epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2,epi_isl_417236_England_20200301_null_1,epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_10,(epi_isl_420726_England_20200327_null_1,epi_isl_424188_Washington_20200320_null_3)Node210,(epi_isl_424371_Reykjavik_20200301_null_3,epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1)Node207,(epi_isl_423373_England_20200328_null_1,epi_isl_426515_Arizona_20200313_null_5)Node204,(epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1,epi_isl_426819_Victoria_20200325_null_10)Node201,(epi_isl_423324_England_20200326_null_1,epi_isl_423465_England_20200330_null_4)Node197,epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1,epi_isl_425023_England_20200324_null_1,epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2,epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1,epi_isl_414010_England_20200226_null_1,epi_isl_423068_England_20200323_null_1,epi_isl_423130_England_20200324_null_1,epi_isl_423164_England_20200325_null_1,epi_isl_423173_England_20200324_null_1,epi_isl_423481_England_20200331_null_1,epi_isl_423579_England_20200331_null_1,epi_isl_422729_Netherlands_20200323_null_1,epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1,epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1,epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2,epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3,epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1,epi_isl_423354_England_20200329_null_2,epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1,epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1,epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1,epi_isl_423740_England_20200323_null_1,epi_isl_423772_England_20200322_null_1,epi_isl_423933_England_20200319_null_1,epi_isl_424138_England_20200320_null_1,epi_isl_423227_England_20200324_null_1,epi_isl_423328_England_20200327_null_2,epi_isl_423780_England_20200324_null_1,epi_isl_423825_England_20200322_null_1,epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1,epi_isl_423060_England_20200324_null_1,epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1,epi_isl_421963_England_20200401_null_1,epi_isl_421956_England_20200331_null_1,epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3,(epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1,epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_1)Node14,epi_isl_425056_Ghent_20200325_null_1,epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1,epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2,epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1,epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1,epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_46,epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1,epi_isl_427482_New_York_20200401_null_7,epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1,epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4,epi_isl_421948_England_20200331_null_1,epi_isl_421847_England_20200326_null_1,epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1,epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1,(epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_346,epi_isl_420697_England_20200329_null_1,epi_isl_420696_England_20200329_null_1,epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1,epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2)Node106,(epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1)Node117,epi_isl_420694_England_20200328_null_1,epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1,epi_isl_418715_England_20200317_null_1,epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1,epi_isl_428385_Connecticut_20200404_null_8233,epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1,epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2,epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1,epi_isl_417312_England_20200308_null_1,epi_isl_423052_England_20200319_null_5,epi_isl_423648_England_20200323_null_1,epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1,epi_isl_422002_England_20200330_null_2,(epi_isl_424062_England_20200311_null_1,epi_isl_426429_Nevada_20200307_null_76,epi_isl_423639_England_20200321_null_1,epi_isl_417288_England_20200305_null_1,epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1)Node146,epi_isl_424007_England_20200320_null_1,epi_isl_421953_England_20200331_null_1,epi_isl_421947_England_20200331_null_1,epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1,epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1,epi_isl_423927_England_20200318_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node106":"test",
"Node117":"test",
"Node14":"test",
"Node146":"test",
"Node197":"test",
"Node201":"test",
"Node204":"test",
"Node207":"test",
"Node210":"test",
"Node216":"test",
"Node230":"test",
"Node248":"test",
"Node270":"test",
"Node273":"test",
"Node322":"test",
"Node361":"test",
"Node400":"test",
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2":"test",
"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2":"test",
"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":"test",
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416745_ARA_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_417236_England_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417240_England_20200303_null_4":"test",
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_417312_England_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417950_Kinshasa_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_417980_Madrid_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418677_England_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418715_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418794_Nevele_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419446_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419666_Austria_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_419798_Victoria_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420312_Norway_20200318_null_5":"test",
"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420443_Hasselt_20200304_null_3":"test",
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420696_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420697_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420725_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420726_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420839_Kinshasa_20200322_null_3":"test",
"epi_isl_420903_Munich_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_420911_Munich_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421297_Wisconsin_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_421669_India_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421895_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421947_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421948_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421953_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421954_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_421956_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421964_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422002_England_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422160_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422239_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422284_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422342_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_422729_Netherlands_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_422790_Netherlands_20200330_null_4":"test",
"epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_422949_Zuid_Holland_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_423052_England_20200319_null_5":"test",
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423068_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423130_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423164_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423173_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423227_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423324_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423328_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_423346_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423354_England_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_423373_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423446_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423453_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423465_England_20200330_null_4":"test",
"epi_isl_423481_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423548_England_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423639_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423648_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423740_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423752_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423772_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423780_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423927_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423933_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424007_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424062_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_424138_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424188_Washington_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_424239_Washington_20200321_null_7":"test",
"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424323_Washington_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_424332_Washington_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_424371_Reykjavik_20200301_null_3":"test",
"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424488_Reykjavik_20200320_null_24":"test",
"epi_isl_424510_Reykjavik_20200320_null_5":"test",
"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_424953_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424984_Michigan_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_425023_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_425056_Ghent_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425170_Wisconsin_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425197_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3":"test",
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_425240_England_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_425336_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_425404_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_425485_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425501_England_20200315_null_3":"test",
"epi_isl_425549_England_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_425666_Scotland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_425926_Scotland_20200324_null_10":"test",
"epi_isl_425960_Scotland_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_426019_Scotland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_426429_Nevada_20200307_null_76":"test",
"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426515_Arizona_20200313_null_5":"test",
"epi_isl_426517_Arizona_20200314_null_4":"test",
"epi_isl_426721_Victoria_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426819_Victoria_20200325_null_10":"test",
"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426883_Czech_Republic_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_426887_Czech_Republic_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_427010_Victoria_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427088_Victoria_20200402_null_46":"test",
"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_427096_Victoria_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427253_Washington_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_23":"test",
"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_7":"test",
"epi_isl_427547_New_York_20200314_null_11":"test",
"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_427631_New_York_20200406_null_6":"test",
"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_427706_New_South_Wales_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_427715_New_South_Wales_20200322_null_78":"test",
"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_46":"test",
"epi_isl_427756_New_South_Wales_20200325_null_346":"test",
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_428322_Wisconsin_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_428385_Connecticut_20200404_null_8233":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":5
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":4
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":9
}
}
}